PROSITE entry PS51869

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS51869
Entry name [info]	APP_E1
Accession [info]	PS51869
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	10-OCT-2018 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00204
Associated ProRule [info]	PRU01217

Name and characterization of the entry

Description [info]

Amyloid precursor protein (APP) E1 domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=160;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=155;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7426894; R2=0.0085000; TEXT='-LogE';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5131.9243164; R2=19.5646687; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=795; H_SCORE=20686; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=560; H_SCORE=16088; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='A';  M=  6, -8,-25, -7,  6,-21, -4,-14,-18, -1,-11,-10, -9, -2, -3, -8, -5, -9,-15,-23,-18,  1;
/M: SY='M';  M=-11,-16,-27,-16, -9,-13,-26, -2, -2,  0, -3,  2,-12, -8, -6,  2,-15,-10, -2,-24, -5,-10;
/M: SY='A';  M=  9,-14,-19,-19,-15,  4, -1,-18,-15,-17,-15,-13, -8,-18,-16,-17,  6,  0, -9, -2, -5,-14;
/M: SY='E';  M= -6, -5,-24, -1, 22,-17,-22,-10, -7, -5, -4, -7, -9,-11,  2, -9, -3, -5, -7,-29,-14, 12;
/M: SY='P';  M= -4,-19,-35,-13, -4,-21,-19,-14,-16,-10,-24,-16,-19, 62,-10,-19, -9, -9,-24,-21,-14,-11;
/M: SY='Q';  M= -7, -9,-24,-11,  3,-21,-18,  1, -5, -3, -3, 14, -7,-15, 27, -1, -3, -6,-13,-23, -8, 15;
/M: SY='V';  M= -4,-30,-19,-34,-30,  0,-34,-30, 39,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 41,-26, -6,-30;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='F';  M=-10,-21,-19,-28,-23, 24,-14,-15,  3,-19,  5, 14,-16,-23,-21,-16,-11, -1,  5,-12,  5,-20;
/M: SY='F';  M= -9,-14,-20,-16, -3, 12,-23,-13, -6,-15,  4, -2,-11,-19, -7,-11, -6,  1, -7,-16,  1, -4;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='G';  M= -1, -6,-27, -7,-10,-27, 48,-18,-35,-15,-26,-19,  0,-16,-14,-16,  3, -9,-26,-22,-26,-12;
/M: SY='Y';  M= -9,-10,-28,-11, -5, -6,-22,  1,-17, 19,-15, -6, -8,-19,  1, 16,-12, -9,-14, -2, 22, -5;
/M: SY='L';  M=-11,-22,-26,-21,-13, -7,-16,-16, -2,-13, 14,  4,-19,-10,-12, -1,-19,-11, -6,-21, -9,-15;
/M: SY='N';  M= -1, 14,-19,  2, -3,-17, -9, -2,-12, -6,-12,-10, 24,-18,  1, -6,  4,  3,-17,-31,-15, -1;
/M: SY='M';  M=-10,-16,-26,-22, -9,-12,-26, -8, 12, -5,  8, 23,-14,-18,  8, -6,-15,-10,  2,-20, -4, -2;
/M: SY='Y';  M=-20,-12,-30,-12,-12, 10,-26, 52,-12,-10, -8,  0, -8,-26, -2, -6,-16,-14,-18,  6, 56,-12;
/M: SY='M';  M= -8,-17,-20,-22,-14, -7,-24,-10,  9, -8, 10, 21,-15,-20, -2, -2,-11,  0,  7,-23, -5, -9;
/M: SY='N';  M=-10, 22,-25, 16,  1,-24, -8, -1,-21, -3,-28,-20, 30, 10, -3, -7,  5,  1,-27,-37,-22, -2;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='E';  M=-12, 14,-26, 22, 23,-30,-15,  3,-26,  8,-20,-13,  5, -8, 22,  8, -1, -9,-25,-25,-13, 22; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='N';  M= -5, 19,-19, 15, 12,-22,-10, -4,-22, -2,-23,-19, 20,-11,  2, -5, 14, 12,-19,-36,-18,  7;
/M: SY='G';  M= -1, -6,-27, -6, -8,-27, 45,-17,-34,-14,-26,-19,  0,-16,-13,-16,  3, -9,-26,-23,-26,-10;
/M: SY='R';  M=-10, -9,-23,-13, -5, -5,-20, -9,-16, 13,-13, -1, -4,-16, -2, 17, -4,  1,-10,-19, -4, -4;
/M: SY='W';  M=-20,-39,-46,-40,-30, 20,-21,-29,-17,-21,-16,-17,-37,-30,-23,-20,-37,-27,-26,130, 30,-21;
/M: SY='E';  M= -8,-10,-24, -7,  9,-14,-26,-15,  1, -5,  1, -1,-13,-15, -5, -9,-10, -8,  4,-27,-11,  2;
/M: SY='P';  M= -3, -9,-23, -9, -5,-20,-18,-19,-15,-10,-21,-15, -8, 34, -9,-14,  9, 21,-14,-31,-20, -9;
/M: SY='D';  M=-17, 43,-27, 58, 16,-36,-11, -3,-36, -1,-27,-27, 17,-10, -1,-10,  3, -1,-26,-39,-19,  7;
/M: SY='P';  M=-12, -7,-33,  3,  0,-22,-20,-16,-15,-13,-11,-12,-14, 39,-10,-18,-13,-10,-20,-30,-21, -8;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='S';  M= -4, 13,-17, 13, 10,-22, -8, -3,-20, -2,-21,-15, 13, -9,  8, -4, 14,  8,-17,-30,-15,  9; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='R';  M= -6, -6,-23, -6, -5,-21, 11, -8,-27,  8,-23,-13,  1,-15, -1, 20,  1, -7,-19,-20,-16, -5; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='T';  M= -4, -4,-16,-10, -9, -5,-20, -9,-11, -4,-12, -9, -3,-14, -7, -6, 10, 27, -5,-17,  8, -9;
/M: SY='K';  M=  3, -6,-25, -8,  2,-26,-16,-11,-21, 14,-21,-10, -5,  3,  8, 10, -1, -2,-16,-22,-15,  4;
/M: SY='T';  M=  0, -4,-18, -8,-10,-19,  9,-16,-23, -8,-21,-15,  2,-14, -9, -3, 15, 18,-13,-28,-18,-10;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='L';  M=-11,-30,-23,-34,-24, 17,-33,-23, 25,-30, 36, 17,-26,-27,-23,-23,-26,-10, 14,-16,  4,-24;
/M: SY='S';  M= -5,  0,-22,  1,  6,-21, -1, -9,-24, -2,-19,-15,  3,-13,  0,  3,  9,  4,-17,-29,-17,  2;
/M: SY='D';  M=-10, 23,-24, 31,  3,-30,  5,-10,-32, -7,-25,-22, 10,-12, -7,-12,  6,  4,-22,-33,-20, -2;
/M: SY='K';  M=-10, -1,-31,  2, 16,-30,-20,-10,-29, 37,-29,-13, -2,  3,  9, 20, -9,-10,-23,-23,-14, 12;
/M: SY='L';  M=-10,-14,-24,-13,  7, -8,-25, -9,  1,-12, 19, 11,-17,-18,  3,-10,-17,-10, -6,-23, -7,  5;
/M: SY='D';  M=-10, 16,-27, 25, 20,-31,  0, -4,-33,  2,-26,-22,  8,-10,  3,  0,  4, -7,-26,-32,-20, 11;
/M: SY='I';  M= -8,-30,-24,-37,-29,  1,-37,-29, 42,-28, 21, 18,-23,-23,-22,-27,-19, -8, 33,-22, -2,-29;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='Q';  M=-11, 12,-29, 12, 18,-32,-16,  1,-27, 22,-26,-12, 10,-10, 23, 13, -2, -9,-26,-26,-14, 20;
/M: SY='Y';  M=-19,-17,-30,-17,-14, 20,-29, 19, -3, -7, -3,  0,-17,-27,  0, -7,-17,-10,-13, 23, 67,-11;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='Q';  M=-12, -2,-30, -2, 12,-32,-20,  1,-26, 29,-24, -6,  0,-12, 31, 30, -6,-10,-24,-20,-10, 21;
/M: SY='K';  M=-10,  3,-30,  6, 25,-31,-20, -5,-29, 34,-26,-12,  0, -7, 19, 19, -6,-10,-24,-23,-13, 22;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='V';  M=  6,-21,-13,-25,-19, -3,-19,-18, 17,-16, 13, 15,-20,-20,-15,-17,-10, -4, 20,-20, -7,-18; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='Y';  M=-18,-18,-26,-18,-18, 26,-26, 18,  0, -9,  0,  0,-18,-26, -9, -9,-18, -9, -9, 26, 70,-18; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='P';  M= -6,-15,-31, -7,  0,-25,-15,-16,-18, -9,-26,-18,-13, 65, -7,-16, -2, -5,-23,-28,-25, -7; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='E';  M= -5, 10,-20, 11, 31,-21,-14, -3,-21,  3,-18,-16,  7, -4,  9, -2,  8,  4,-20,-28,-16, 20; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='L';  M=-11,-16,-21,-17, -8, -5,-21, -9, -2,  2, 12, 10,-14,-20, -4, 12,-18, -9, -3,-18, -4, -7; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='B';  M=-12, 22,-24, 22, 12,-29,-10, 11,-23,  3,-22,-12, 19,-12, 21,  1,  2, -7,-26,-28,-12, 16; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='I';  M= -9,-26,-26,-35,-26,  0,-35,-26, 44,-26, 18, 18,-18,-18,-18,-26,-18, -9, 26,-18,  0,-26; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='T';  M=  6, -1, -9,-10, -9,-10,-15,-18, -9, -9, -9, -9, -1, -9, -9,-10, 16, 38,  0,-25,-10, -9; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='N';  M= -2, 22,-17,  8, -1,-18, -2,  3,-17,  2,-22,-15, 36,-16,  0,  5,  6, -1,-21,-30,-16, -1; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='V';  M= -3,-26,-16,-30,-26,  0,-30,-26, 33,-21, 12, 12,-23,-23,-23,-21,-12, -3, 37,-23, -5,-26; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='V';  M= -2,-20,-12,-20,-15, -4,-24,-19, 18,-13,  6, 11,-22,-22,-17,-14, -9, -2, 29,-25, -9,-16; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='E';  M= -6,  6,-23, 12, 40,-26,-15,  0,-24,  6,-19,-15,  1, -3, 19,  0,  6, -5,-23,-26,-16, 29; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='A';  M= 24, -1,-12,-10, -7,-13, -3, -8,-10, -7,-13,-10,  3,-12, -6,-13,  9,  1, -6,-18, -8, -7; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='N';  M= -1, 14,-17,  5, -1,-18, -4, -3,-16, -5,-24,-16, 24,  1, -3, -6, 13,  6,-19,-32,-18, -3; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='Q';  M= -9, -3,-23, -1,  8,-24,-15, 21,-17,  1,-16, -3, -1,  4, 24,  1, -3, -9,-22,-18, -4, 14; D=-1;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-3; IM=0; DM=-3;
/M: SY='P';  M=  4, -2,-23,  1,  4,-18,-12, -8,-17, -4,-16,-14, -7, 13, -4, -9, -2, -6,-16,-18, -9, -2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='V';  M= -4,-19,-16,-20,-15, -9,-25,-19, 15, -5,  1,  6,-18,-20,-10, -8, -9, -4, 23,-23, -8,-13; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='K';  M= -2, -3,-18, -5, -3,-18,-13,-12,-12,  6,-19,-10,  0, -1, -4, -1,  6,  5, -6,-27,-14, -4; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='I';  M= -9,-25,-22,-31,-22,  3,-30,-20, 32,-24, 26, 22,-20,-20,-15,-21,-20, -9, 18,-18,  0,-21; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='G';  M= -3,  5,-22,  9,  8,-27, 11, -6,-26, -5,-24,-16,  5,-10,  7, -7,  9, -4,-22,-26,-18,  7; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='N';  M= -7, 17,-20, 18,  3,-23,  3, -2,-25, -1,-25,-19, 19,-13, -1,  2, 10, -1,-21,-31,-17,  0; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='W';  M=-15,-34,-38,-34,-26,  7,-19,-26,-10,-18,-13,-13,-34,-26,-19,-18,-31,-22,-15,105, 20,-19; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='C';  M= -9,-18,105,-26,-26,-18,-26,-26,-26,-26,-18,-18,-18,-35,-26,-26, -9, -9, -9,-44,-26,-26; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='R';  M=-11, -3,-26, -2,  9,-23, -7, -5,-27, 24,-22,-11,  0,-12,  7, 29, -6,-10,-20,-19,-12,  6; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='R';  M=-10, -7,-21, -7,  2, -6, -5, -5,-18,  5,-12, -7, -3,-12,  3, 13, -6, -8,-15,-11, -5,  2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='G';  M=  4,  5,-16,  6,  2,-20, 10, -9,-20, -6,-17,-14,  2, -8, -4,-10,  7, -2,-14,-21,-16, -1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='R';  M= -4, -5,-20, -6, -2,-17, -4,  9,-21, 10,-16, -7,  0,-12,  2, 19, -4, -9,-15,-16, -6, -2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='K';  M= -4, -4,-17, -4,  2,-15,-11, -8,-15, 15,-13, -6, -1,-10,  2, 10,  1, -1, -9,-19, -8,  2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='Q';  M= -7, -2,-22, -1,  8,-24,-13, -2,-18, 15,-19, -6, -1,  1, 19, 12, -1, -5,-18,-17,-10, 13; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='C';  M= -7,-15, 88,-22,-22,-15,-22,-22,-22,-22,-15,-15,-15,-29,-22,-22, -7, -7, -7,-37,-22,-22; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='K';  M= -1, -2,-20, -3,  5,-21,-12, -5,-18, 22,-17, -6, -1, -8, 12, 17, -4, -6,-14,-15, -8,  8; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='S';  M=  3, -1, -7, -2, -3,-11,  6, -7,-12, -6,-14,-10,  3, -6, -3, -6, 15,  9, -6,-18,-11, -3; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='H';  M= -8, -4,-18, -4, -1,-11,-10, 22,-16,  1,-15, -5,  0,-11,  2,  1, -4, -7,-15, -1,  5,  0; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='P';  M= -7, -6,-17, -6, -2,-12,-12,  4,-12, -1,-11, -5, -3,  9, -1,  4, -2,  2,-11,-16, -6, -4; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='H';  M=-15, -2,-22, -2,  0,-15,-15, 58,-22, -1,-15, -2,  6,-15,  7, 11, -7,-13,-20,-20, 10,  0; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='Y';  M= -9,-11,-21,-13, -3,  0,-17,  0, -2,-11, -5, -3, -8,-13, -6,-10, -7, -8, -6,  2,  4, -5; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='V';  M= -2,-22,-12,-24,-22,  0,-24,-22, 27,-17, 10, 10,-19,-19,-19,-17,-10, -2, 32,-19, -5,-22; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='V';  M= -6,-11,-17,-14, -8,-10,-20,-14,  3,  6, -4,  1, -9,-14, -6,  5, -8, -3,  7,-17, -6, -8; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='P';  M= -7,-15,-29, -7,  0,-22,-15,-15,-15, -7,-22,-15,-15, 66, -7,-15, -7, -7,-22,-22,-22, -7; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='F';  M=-15,-19,-17,-24,-19, 46,-22, -5,  0,-17,  5,  0,-15,-22,-22,-12,-15, -7, -2, 12, 34,-19; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='R';  M=-12, -7,-22, -9, -3,-13,-17, 10,-11, 10,-10, -2, -1,-13,  3, 22, -9, -9, -9,-16, -1, -3; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='C';  M= -7,-15, 88,-22,-22,-15,-22,-22,-22,-22,-15,-15,-15,-29,-22,-22, -7, -7, -7,-37,-22,-22; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='L';  M= -7,-22,-16,-23,-16,  6,-23,-16, 17,-22, 34, 15,-21,-21,-15,-16,-21, -7,  9,-15,  0,-16; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='G';  M= -3,  1,-22,  4, -9,-23, 40,-12,-29,-12,-22,-16,  3,-13,-12,-13,  0,-13,-22,-17,-21,-10; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='E';  M= -9, 10,-25, 14, 37,-24,-14, -1,-23,  5,-20,-17,  6,  7, 11, -2,  0, -7,-26,-27,-18, 23; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='F';  M=-16,-26,-18,-34,-26, 57,-27,-18,  7,-26, 10,  3,-17,-24,-31,-18,-17, -9,  4,  4, 22,-26; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='V';  M= -6,-10,-18,-11,-10,-13,-19, -3,  2, -9, -8, -1, -6, -5, -6,-10, -5, -4,  6,-26,-10, -9; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='S';  M=  5, -4,-12, -5, -5,-16,  6, -8,-14,-10,-19, -6,  3,-11, -2,-10, 21,  8, -8,-29,-16, -4; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='D';  M=-11, 21,-23, 30, 20,-27,-13, -4,-27,  7,-21,-18,  8, -6,  4, -1,  2,  0,-20,-28,-14, 12; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='A';  M= 30,-10, -9,-17,-11,-13, -6,-18, -4,-10, -6, -6,-10,-11,-11,-16,  7,  7,  6,-20,-14,-11; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='L';  M= -7,-22,-15,-22,-15,  7,-22,-15, 15,-22, 37, 15,-22,-22,-15,-15,-22, -7,  7,-15,  0,-15; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='L';  M= -9,-19,-16,-20,-12, 12,-21,-12,  8,-18, 24, 10,-18,-20,-10,-12,-18, -7,  2,-10,  3,-10; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='V';  M=  0,-18, -7,-19,-19, -1,-21,-21, 16,-13,  5,  5,-18,-19,-19,-13, -3,  7, 30,-22, -7,-19; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='P';  M= -7,-15,-29, -7,  0,-22,-15,-15,-15, -7,-22,-15,-15, 66, -7,-15, -7, -7,-22,-22,-22, -7; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='E';  M= -9,  9,-19, 16, 18,-19,-14,  5,-16, -1,-12,-11,  1, -8,  3, -5, -2, -7,-11,-24, -9, 10; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='G';  M= -5,  4,-21,  4, -3,-22, 20, -8,-26,  3,-22,-14,  6,-12, -5, -2, -1,-10,-20,-18,-16, -4; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='C';  M= -7,-15, 88,-22,-22,-15,-22,-22,-22,-22,-15,-15,-15,-29,-22,-22, -7, -7, -7,-37,-22,-22; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='Q';  M= -8, -4,-21, -4,  7,-20,-16,  0,-13, 12, -9, -1, -3,-11, 22, 14, -6, -7,-15,-15, -6, 14; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='F';  M=-13,-22,-15,-28,-21, 49,-22,-15,  3,-22, 13,  3,-16,-22,-26,-15,-16, -7,  1,  3, 18,-21; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='L';  M= -8,-11,-15,-10,-10,  8,-17,-12,  2,-17, 16,  3,-12,-18,-13,-13,-11, -5,  0,-15,  0,-11; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='H';  M=-15,  7,-22, 10,  3,-17,-13, 59,-23, -6,-16, -4,  9,-13,  6, -1, -6,-13,-22,-23,  9,  1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='Q';  M= -6,  0,-19, -4,  1,-18,-15, -2, -3,  1, -9,  0,  3,-12, 16,  0, -2, -5, -8,-18, -8,  8; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='E';  M= -8,  9,-21, 13, 32,-20,-13, 11,-21,  4,-16,-13,  7, -4, 12,  0,  0, -7,-22,-23,-10, 21; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='R';  M=-11, -1,-19, -3,  0,-15,-11,  0,-20, 15,-17, -9,  7,-14,  5, 36, -1, -3,-15,-19, -9,  0; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='M';  M=  1,-10,-13,-15, -9, -7,-10, -3,  1, -4,  1, 19, -8,-12,  0, -1, -2, -2,  1,-17, -6, -5; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='D';  M=-10, 16,-19, 22, 11,-15,-10,  2,-19, -1,-17,-15,  8, -9,  1, -5,  2, -4,-17,-18, -1,  5; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='Q';  M= -5,-12,-15,-12, -5,-13,-18, -8,  2, -1, -4,  2,-11,-15,  7,  3, -5, -4,  7,-18, -7,  0; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='C';  M= -7,-15, 88,-22,-22,-15,-22,-22,-22,-22,-15,-15,-15,-29,-22,-22, -7, -7, -7,-37,-22,-22; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='E';  M= -8,  5,-23,  8, 29,-17,-13, -2,-20,  3,-16,-15,  1, -5,  9, -2, -3, -8,-22, -4, -9, 19; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='N';  M= -4, 10,-16,  8,  2,-17, -6, -5,-16,  0,-20,-14, 13,  1, -1, -3,  9,  5,-15,-26,-14,  0; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='H';  M=-11, -8,-19, -9, -8,  7,-16, 29,-11, -9, -8, -2, -3,-17, -4, -6, -5, -7,-12, -5, 25, -8; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='Q';  M= -5, -8,-16, -9, -2,-12,-17, -8, -3,  1, -1,  2, -8,-12,  7,  0, -5,  1, -3,-17, -6,  3; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='H';  M=-15, -7,-21, -8, -4, -1,-16, 27,-18,  2,-10, -3,  0,-16,  0, 18, -9,-10,-15,-13,  7, -4; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='W';  M=-15,-26,-34,-26,-18,  4,-15,-18,-16, -9,-15,-13,-25,-21,-11, -4,-26,-20,-21, 90, 17,-12; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='H';  M=-11,  6,-21,  5,  9,-17,-13, 40,-21,  2,-17, -6, 10,-11,  8,  3, -4,-10,-21,-22,  2,  6; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='T';  M= -3,  5,-14,  4,  4,-18,-11, -5,-14, -2,-14, -8,  3, -7, 10, -3, 11, 14,-11,-22,-10,  7; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='T';  M= -1, -6,-12, -5,  4,-10,-15,-11, -2, -6, -5, -5, -7,-11, -5, -8,  4,  5,  5,-23,-10, -1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='A';  M= 18, -8, -9,-13,-11,-12,  1,-16, -5,-10, -7, -6, -7,-11,-11,-13,  5,  5,  3,-17,-13,-11; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='K';  M= -1, -3,-20, -4,  2,-21, -4, -6,-20, 16,-17, -7, -1,-10,  8, 15, -3, -7,-15,-15,-10,  5; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='E';  M= -1,  4,-20,  9, 32,-21,-13, -3,-20,  9,-14,-13, -1, -2, 11,  1,  0, -6,-18,-20,-14, 21; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='A';  M= 24, -5, -9,-11, -4,-16, -4,-11, -9, -5,-10, -7, -4, -7,  0,-10,  9,  5, -3,-17,-13, -2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='C';  M= -7,-15, 88,-22,-22,-15,-22,-22,-22,-22,-15,-15,-15,-29,-22,-22, -7, -7, -7,-37,-22,-22; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='Q';  M= -3, -8,-15, -8, -3,-10, -7, -8, -6, -5,  0, -1, -6,-13,  1, -5, -1, -2, -6,-19, -8, -1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='T';  M= -3,  1,-15,  1,  7,-13,-14,-10, -6, -6, -9, -8,  0, -7, -1, -8,  6,  9, -5,-22,-10,  2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='R';  M=-10, -2,-22, -2, 10,-21,-15,  0,-20, 21,-16, -6,  0,-10, 16, 29, -5, -7,-17,-15, -8, 11; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='G';  M=  0,  6,-17,  5, -5,-20, 23, -7,-23, -8,-21,-15, 11,-12, -7,-10,  7, -5,-19,-22,-18, -6; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='M';  M= -8,-17,-16,-24,-16,  1,-19, -5, 14,-12, 19, 39,-17,-18, -4,-10,-15, -3,  8,-18, -1,-10; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='T';  M= -7, -2,-19, -9, -7,-13,-18, -9, -1, -4, -8, -3,  5,-14,  1,  2,  1,  8, -4,-23, -8, -5; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='L';  M= -8,-25,-15,-27,-21, 15,-25,-17, 17,-21, 25, 16,-23,-25,-20,-16,-19, -6, 16,-15,  2,-20; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='H';  M=-16, -6,-26, -6,  0,-14,-18, 31,-21,  7,-15, -3,  0,-17, 13, 23, -8,-11,-20,-14, 11,  3; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='S';  M=  3,  7,-14, 10,  1,-21,  7, -8,-23, -8,-26,-19,  9,-10, -2,-10, 23,  8,-14,-32,-18, -1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='Y';  M=-14,-18,-20,-21,-18, 36,-22,  1, -2,-15,  0, -2,-14,-23,-17,-12,-10, -5, -5, 11, 41,-18; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='G';  M= 15,-11,-18,-15,-14,-17, 24,-17,-16,-15, -8, -8, -7,-15,-14,-17, -1, -9,-10,-17,-18,-14; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='M';  M= -6,-19,-18,-23,-17, -4,-19, -9, 14,-11,  8, 29,-19, -4, -8,-12,-14, -6, 12,-21, -6,-13; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='L';  M=-10,-24,-18,-24,-17, 11,-26,-12, 14,-23, 36, 14,-24,-26,-16,-16,-24, -9,  6,-10, 11,-17; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='L';  M= -9,-13,-21,-11,  4, -6,-22,-11, -1, -6, 16,  4,-15,-16, -4, -6,-16, -9, -4,-19, -6,  0; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='P';  M= -9,-17,-34, -9,  0,-26,-17,-17,-17, -9,-26,-17,-17, 77, -9,-17, -9, -9,-26,-26,-26, -9; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='C';  M= -9,-17,103,-26,-26,-17,-26,-26,-26,-26,-17,-17,-17,-34,-26,-26, -9, -9, -9,-43,-26,-26; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='G';  M=  5,-10,-21,-12,-15,-19, 29,-17,-17,-16,-17,-11, -2,-15,-14,-17,  3, -9,-12,-20,-19,-15; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='I';  M= -2,-18,-16,-21,-16, -3,-21,-18, 16,-19, 10,  6,-13,-18,-13,-17, -3,  0, 14,-23, -6,-16; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='D';  M=-13, 32,-24, 46, 21,-31, -9, -1,-31,  0,-24,-23, 13, -7,  3, -7,  4, -5,-24,-33,-17, 12; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='R';  M= -9,-11,-21,-11, -3,-14,-19, -7, -7, 11, -4,  5, -9,-16,  6, 15,-11, -8, -4,-18, -6,  1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-3;
/M: SY='F';  M=-19,-26,-21,-34,-24, 64,-29,-19, -4,-18,  4, -1,-17,-27,-33,-13,-19,-10, -3,  6, 24,-24;
/M: SY='R';  M=  0, -8,-18,-12, -8,-15,-17,  0,-13, -1,-13, -7, -3,-17, -4, 10,  5,  8, -3,-27, -9, -8;
/M: SY='G';  M=  7,-10,-27,-11,-19,-29, 60,-20,-36,-19,-27,-19, -1,-19,-19,-20,  1,-17,-26,-20,-29,-19;
/M: SY='V';  M=  7,-24,-10,-26,-25, -4,-25,-27, 20,-17,  5,  5,-24,-25,-25,-19, -4,  6, 37,-29,-11,-25;
/M: SY='E';  M=-10,  8,-30, 17, 52,-30,-20, -2,-30, 17,-22,-18,  0, -2, 18,  5, -2,-10,-28,-28,-18, 35;
/M: SY='F';  M=-17,-28,-21,-34,-28, 57,-30,-12,  4,-24,  8,  1,-21,-30,-31,-18,-19, -9,  4,  9, 37,-28;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='P';  M=-10,-17,-39, -9,  1,-30,-20,-19,-21, -2,-30,-19,-17, 76, -7,-13,-10,-10,-29,-29,-27, -7;
/M: SY='P';  M=  1, -1,-26, -4,  0,-23,-13, -8,-16, -1,-18,-11,  4, 12,  2, -6, -2, -6,-20,-27,-19,  0;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_01 which contains 572'970 sequence entries.

Total number of hits	18 in 18 different sequences
Number of true positive hits	18 in 18 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	7

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	E1
Version [info]	3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

18 sequences

A4_CAEEL(Q10651), A4_CAVPO(Q60495), A4_DICFU(O73683),

A4_DORPE(Q06BR2), A4_DROME(P14599), A4_HUMAN(P05067), 
A4_MACFA(P53601), A4_MOUSE(P12023), A4_PANTR(Q5IS80), 
A4_PIG  (P79307), A4_RAT  (P08592), A4_SAISC(Q95241), 
A4_TAKRU(O93279), APLP1_HUMAN (P51693), APLP1_MOUSE (Q03157), 
APLP2_HUMAN (Q06481), APLP2_MOUSE (Q06335), APLP2_RAT   (P15943)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

UniProtKB/Swiss-Prot
'Partial' sequences

7 sequences

A4_BOVIN(Q28053), A4_CANLF(Q28280), A4_FELCA(P86906),

A4_MACMU(P29216), A4_RABIT(Q28748), A4_SHEEP(Q28757), 
A4_URSMA(Q29149)

» more

PDB
[Detailed view]

21 PDB

1MWP; 1OWT; 2FJZ; 2FK1; 2FK2; 2FK3; 2FKL; 2FMA; 2M05; 3KTM; 4JFN; 4PQD;
» more