PROSITE entry PS51634

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS51634
Entry name [info]	CRC
Accession [info]	PS51634
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-JAN-2012 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51634
Associated ProRule [info]	PRU00971

Name and characterization of the entry

Description [info]

CRC domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=125;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=120;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.4109969; R2=0.0071049; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=13140.6083984; R2=12.7448454; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=787; H_SCORE=23171; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=435; H_SCORE=18685; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-21; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='S';  M= -6, -1,-47,-11,  0,-51, -9,-12,-51, 11,-48,-32, 10,-26,  7, -1, 12, -2,-39,-58,-40,  1;
/M:         M=-21,-17,-13,-24,-22,-43,-33,-14,-38,-11,-38,-30, -7,-41,-13,-10,-15,-18,-33,-55,-37,-21;
/M: SY='K';  M=-11,-25,-46,-32,-11,-34,-40,-24,-23, 22,-27,-19,-21,-16, -6,  0,-14,-11,-20,-54,-35,-12;
/M: SY='S';  M= -6,-15,-43,-23,-12,-43,-21, -4,-42,  3,-41,-30, -4,-16, -5, -1,  7, -7,-34,-56,-31,-11;
/M: SY='C';  M=-13,-61,109,-69,-69,-29,-61,-66,-17,-58,-22,-24,-51,-59,-49,-58,-23,-22,-18,-46,-43,-68;
/M: SY='N';  M= -9, -4,-35,-16,-11,-46,-27, -9,-41,  9,-40,-28, 12,-26,  0,  5,  8,  1,-30,-57,-36, -8;
/M: SY='C';  M= -9,-56,106,-65,-65,-43,-49,-66,-25,-56,-34,-32,-47,-49,-48,-57,-19,-21,-24,-52,-51,-65;
/M: SY='K';  M=-12,-21,-42,-28, -7,-46,-38,-19,-36, 32,-34,-23,-12,-17,  5, 16,-10, -3,-23,-56,-39, -4;
/M: SY='K';  M=-16, -9,-54,-19, -1,-44,-33, -4,-46, 37,-37,-26,  5,-18, 12,  8, -9, -8,-37,-55,-31,  1;
/M: SY='S';  M= 12, -2,-27,-12,-12,-42,-10,-20,-39, -6,-40,-29, 10,-24,-10,-18, 51, 13,-28,-60,-33,-12;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='K';  M=-13,-12,-47,-21, -3,-37,-32,-10,-36, 29,-32,-20, -1,-28, 14,  9, -7,-10,-30,-51,-31,  1; D=-11;
/I:         I=-11; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
/M: SY='C';  M= -9,-55,107,-64,-63,-38,-56,-64,-16,-54,-27,-25,-45,-55,-45,-54,-17,-11,-13,-49,-46,-63; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='L';  M=-25,-63,-16,-65,-56, -7,-65,-50, 23,-40, 40, 21,-54,-48,-39,-41,-34,-20, 15,-42,-24,-49; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='K';  M= -7, -4,-49,-12, 12,-48,-26, -6,-48, 43,-41,-27,  6,-22, 25, 12,  4, -5,-37,-55,-36, 14; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='L';  M=-21,-41,-33,-47,-44,-16,-42,-37, -4,-29, 22, 10,-27,-44,-30,-33,-18,-19, -7,-46,-26,-38; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='Y';  M=-39,-40,-51,-49,-45, 30,-56, 27,-33,-37,-24,-32,-31,-58,-28,-38,-27,-28,-32, 20, 95,-36;
/M: SY='C';  M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70;
/M: SY='E';  M=-16, -2,-56, 10, 15,-52,-33,-23,-43,-12,-47,-36,-14, -7, -7,-20,-11,-17,-26,-64,-49,  7;
/M: SY='C';  M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70;
/M: SY='F';  M=-32,-52,-38,-54,-53, 72,-54,-18,-13,-44, -3, -4,-50,-54,-43,-45,-25,-31,-20, -8, 32,-52;
/M: SY='A';  M= 39,-20,-24,-22, -7,-42,-12,-18,-37,  0,-35,-22,-17,-16,  0,-14, 18, -1,-21,-51,-36, -5;
/M: SY='S';  M= 17, -6,-30,-17,-18,-44, -4,-20,-37, -7,-40,-28,  6,-26,-14,-18, 22,  0,-27,-58,-38,-18;
/M: SY='G';  M=-12,-12,-57,-24,-26,-51, 36,-19,-61,-10,-58,-41,  2,-44,-16,-13,-10,-23,-52,-53,-41,-23;
/M:         M=-14,-19,-44,-21,-12,-38,-23,-22,-27,-11,-30,-20,-13,-36, -6,-18,-11, -9,-13,-51,-32,-10;
/M: SY='Y';  M=-35,-42,-49,-46,-31, 32,-56, 13,-23,-34,-18,-19,-38,-51,-25,-35,-30,-30,-23, -6, 47,-30;
/M: SY='C';  M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='S';  M=  4, -6,-21,-13, -9,-28, -7,-16,-23,  2,-25,-17,  0,-18, -6, -9, 20, 12,-17,-38,-23, -9; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='E';  M=-16, 12,-54, 15, 16,-53,-31,-12,-50,  1,-51,-36,  9,-14,  7,-12,  2, -8,-40,-63,-45, 12;
/M: SY='N';  M=-11, 10,-47,  0,-16,-52, -2,-17,-52,-10,-50,-37, 25,-20,-14,-21, 12, -7,-43,-65,-44,-16;
/M: SY='C';  M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70;
/M: SY='N';  M= -8,  5,-47, -4,  0,-49,-14, -6,-49,  4,-47,-33, 16,-30, -1, -6,  9, -1,-37,-59,-37, -2;
/M: SY='C';  M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70;
/M: SY='N';  M=-16, -7,-40,-16,-14,-30,-34, -7,-33, -6,-34,-22,  6,-36,  1,-15,  3,  3,-23,-44,-14,-10;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='N';  M=-20, 19,-44,  8,-12,-56, -8,-11,-56, -6,-56,-40, 36,-20, -9,-18, -2,-11,-47,-65,-46,-13; D=-12;
/I:         I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
/M: SY='C';  M=-11,-58,115,-67,-67,-36,-58,-67,-13,-57,-26,-26,-49,-57,-48,-57,-21,-19,-15,-48,-47,-67; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M:         M=-18,-30,-33,-35,-22, -3,-37, -6,-31,-11,-22,-19,-23,-40,-14,-21,-11,-19,-28,-32, -1,-21; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='N';  M=-27, 41,-36, 13,-14,-56,-13,  4,-55, -4,-56,-38, 77,-40, -3,-13,  8, -1,-46,-66,-39,-14; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='K';  M=-21,  3,-55,-11, -4,-46,-29,  3,-46, 34,-42,-29, 20,-31,  7, 17, -9,-11,-39,-58,-32, -2;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M:         M= -7,-20,-34,-24,-11,-32,-33,-21,-19, -7,-18,-14,-14,-12,-12,-18, -1, -8,-12,-49,-30,-12; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M:         M=-17,-16,-43,-18, -2,-26,-30,-10,-23,-13,-25,-15,-16,-32, -7,-18,-13,-16,-20,-38,-17, -4; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='H';  M=-26, -5,-50,-17,-14,-18,-32, 41,-44,-10,-38,-32, 13,-26, -5,-12,-12,-18,-37,-29, 18,-12; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='E';  M=-14,  5,-46,  9, 36,-47,-26, -9,-44, -2,-46,-30, -4,-23,  9,-16, -8,-15,-31,-52,-42, 24; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='D';  M=-15,  8,-41, 14,  6,-40,-30,-17,-32,-12,-35,-26,  2,-22, -7,-20, -2, -2,-21,-54,-37,  1; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='A';  M=  7,-20,-27,-21, -8,-24,-26,-21,-22, -9,-23,-15,-19,-15, -9,-21,  3,  1,-12,-42,-26, -9; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='R';  M=-16,-30,-34,-35,-20,-30,-39,-20, -8, -3,-16,-11,-22,-29,-11, 21,-14, -8,  4,-43,-30,-16; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='Q';  M=-17,-16,-42,-15, 11,-24,-36, -8,-31,  1,-22,-10,-15,-27, 19, -6, -9,-14,-24,-38,-24, 13; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='E';  M= -6, -6,-40, -7, 12,-33,-26, -6,-36, 11,-34,-24, -8,-20,  6, -2, -1, -6,-25,-39,-22,  9; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='A';  M= 23,-19,-17,-22,-13,-32,-15,-20,-20, -5,-23,-13,-16,-17, -5,-11,  9, 10, -9,-39,-29,-11; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='I';  M=-18,-31,-28,-38,-24,-22,-42,-25,  9,-13, -6,  1,-26,-31,-11,  0,-18,-10,  6,-39,-26,-20; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='K';  M=-17,  2,-44,  3,  5,-33,-29,-11,-34, 10,-30,-23,  1,-24,  0, -2, -9,-12,-27,-47,-31,  2; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='Q';  M=  0,-20,-27,-25,-12,-28,-24,-17,-16, -6,-16,  1,-13,-24,  4, -5, -3, -2, -7,-37,-27, -7; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='I';  M=-10,-38,  5,-45,-39,-18,-43,-41, 20,-32,  0,  2,-35,-35,-31,-34,-15, -2, 13,-39,-26,-39; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-13; MD=-13; IM=-13; DM=-13;
/M: SY='L';  M=-19,-33,-34,-33,-15,-17,-44,-24, -8, -5, 12,  4,-29,-30, -7,-15,-22,-18, -8,-36,-23,-12; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='E';  M= -7, -6,-36, -3,  4,-29,-17,-17,-29,-10,-26, -9, -9,-24, -2,-19,  1, -9,-23,-42,-31,  1; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='R';  M=-21,-14,-47,-22, -5,-39,-30, -1,-39, 31,-31,-23, -6,-22,  9, 62,-14,-14,-31,-40,-31,  1; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='N';  M=-20, 35,-43, 11, -9,-55,-13,  3,-54, -1,-54,-35, 67,-36,  2,-11, 19,  7,-43,-66,-37, -8;
/M: SY='P';  M=-10,-38,-60,-29,-18,-59,-49,-38,-50,-15,-49,-39,-38,113,-27,-27,-19,-29,-40,-69,-59,-18;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='K';  M=-16, -6,-45, -9, -3,-36,-32,-14,-34,  8,-23,-20,  0,-28, -2, -2, -9,-13,-27,-51,-33, -4; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='A';  M= 57,-25,-14,-27,-18,-41, -4,-27,-33, -8,-32,-22,-22,-13,-17,-22, 26,  2,-15,-52,-38,-17;
/M: SY='F';  M=-20,-55,-34,-56,-52, 66,-50,-24,-10,-42,  0,  3,-54,-50,-43,-45,-30,-31,-15,-12, 20,-51;
/M: SY='P';  M= -1, -9,-47, -5, -3,-49,-30,-19,-46,  2,-42,-27, -9,  7,  4,-10, -1,-12,-35,-59,-44,  0;
/M: SY='P';  M=-13,-41,-57,-32,-20,-54,-52,-39,-43,-21,-39,-33,-41, 96,-29,-30,-22,-30,-35,-66,-55,-20;
/M: SY='K';  M=-11,-11,-60,-21,  9,-50,-31, -9,-50, 77,-40,-30, -1,-21, 19, 34,-11,-11,-40,-59,-40,  9;
/M: SY='I';  M=-14,-55,-21,-62,-48,-13,-57,-51, 43,-40, 15, 29,-51,-42,-36,-42,-30,-12, 35,-46,-31,-46;
/M:         M= -5,-30,-33,-37,-28,-33,-21,-36, -7,-23,-18,-12,-23,-37,-26,-31, -5, -7, -1,-54,-37,-28;
/M: SY='R';  M= -7,-11,-43,-21,-12,-46,-21,-15,-40,  8,-39,-27,  1,-24, -1, 12,  7, -6,-30,-56,-38, -8;
/I:         I=-4; MD=-8;
/M: SY='S';  M=  0,-16,-28,-25,-24,-36,-11,-28,-20,-17,-29,-17, -7,-27,-19,-21, 15,  8,-16,-51,-34,-23; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-8;
/M:         M= -7,-21,-26,-25,-17,-32,-33,-23,-19,-10,-19,-14,-13,-11,-11,-12, -1, -3, -9,-46,-30,-15; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-8;
/M: SY='Q';  M=-11, -2,-42, -1,  5,-37,-22, -3,-39, -6,-33,-23, -1,-23,  8,-14, -3, -9,-30,-46,-29,  5; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-8;
/M: SY='G';  M=  1,  0,-38,  3,-11,-41,  6,-17,-43,-11,-43,-32, -2,-22,-15,-21,  2, -2,-32,-49,-36,-13; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-8;
/M:         M=  0,-14,-24,-21,-23,-28, -2,-22,-14,-16,-20,-11, -4,-27,-19,-23, -6, -8, -9,-39,-29,-22; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-8;
/M: SY='Q';  M= -5,-11,-16,-17, -9,-28,-23,-14,-19, -3,-20, -9, -3,-23,  6, -6,  3,  6,-14,-35,-23, -5; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-8;
/M: SY='D';  M= -9,  7,-27, 14, 14,-32,-21,-11,-30, -7,-30,-23, -1,-18,  0,-15, -5,-10,-21,-39,-30,  8; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8;
/M:         M= -4,-15,-22,-17, -7,-20,-16,-14,-14, -3,-16, -9,-12,-11, -5, -7, -6, -2, -6,-20,-18, -6; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='E';  M= -6, 10,-33, 17, 19,-32,-19, -9,-32, -4,-33,-25,  1,-15,  2,-12,  8, -4,-23,-41,-28, 13; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='D';  M=-14, 22,-35, 29, 10,-34,-15, -4,-36,  0,-35,-26, 17,-18,  5, -9, -2, -7,-30,-41,-29,  7; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='A';  M= 21,-16,-11,-18,-14,-21,-10,-18,-13, -9,-12, -9,-13,-10,-13,-17,  9, -1, -4,-31,-21,-14; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M:         M= -4,-11,-22,-16,-11,-21,-11, -9,-12,-11,-16, -7, -5,-21, -8,-15, -1, -5, -7,-31,-19,-11; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='K';  M= -3, -8,-33, -7,  1,-31,-21, -5,-30,  6,-28,-20, -7,  5,  0, -1, -4, -7,-22,-37,-25,  1; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='T';  M= -3,-16,-22,-22,-16,-24,-11,-21,-13,-10,-16, -3,-10,-20, -9,-16,  2,  8, -7,-34,-24,-14; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='P';  M= -6,-12,-41, -8,-12,-43,-31,-25,-34,-15,-36,-28,-12, 33,-18,-24, -7,-15,-26,-55,-42,-13; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='A';  M=  6,-25,-24,-26,-10,-25,-28,-25, -7,-15,-11, -1,-25,-17,-13,-23, -2, -7, -3,-40,-29,-12; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='S';  M= -7,-15,-27,-16,-11,-26,-31,-22, -9, -8,-15,-10,-13,-24, -8,-17,  1, -3, -3,-43,-26,-10; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M:         M= -2,-19,-37,-21,-16,-32,-11,-20,-35, -8,-31,-22,-16,-13, -9, -7, -5,-10,-27,-43,-32,-13; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='R';  M=-15,-22,-40,-27, -9,-32,-34,-13,-25, 21,-18,-14,-15,-16,  2, 22,-15,-12,-17,-41,-29, -5; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='H';  M=-24,-14,-66,-17,  6,-33,-35, 63,-56,-10,-48,-38, -4,-16,  3,-10,-19,-28,-45,-48, -2,  3;
/M: SY='K';  M=-12, -9,-43,-20,-15,-24,-28,-10,-41,  8,-36,-25,  4,-32, -4,  6,  4, -5,-33,-48,-24,-12;
/M: SY='K';  M=-18, -3,-55,-16, -2,-51,-30, -5,-49, 44,-42,-30, 12,-27, 11, 37, -7, -4,-38,-58,-39,  1;
/M: SY='G';  M= -4,-23,-58,-32,-39,-46, 71,-37,-64,-26,-63,-45,-14,-49,-38,-37,-12,-30,-56,-55,-51,-39;
/M: SY='C';  M=-10,-60,118,-69,-68,-38,-60,-68,-15,-58,-27,-27,-50,-58,-49,-58,-21,-18,-13,-50,-48,-68;
/M: SY='N';  M=-23, 24,-52,  3, -6,-48,-20, 28,-55,  4,-53,-37, 53,-36,  3, -5,  6, -2,-45,-60,-23, -6;
/M: SY='C';  M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70;
/M: SY='K';  M=-19,-14,-60,-24,  1,-50,-34, -6,-50, 58,-40,-30, -4,-24, 16, 56,-14,-14,-40,-56,-40,  6;
/M: SY='K';  M=-16,-13,-60,-23,  4,-50,-33, -7,-50, 66,-40,-30, -3,-23, 17, 47,-13,-13,-40,-57,-40,  7;
/M: SY='S';  M= 11, -3,-25,-11, -4,-42,-17,-16,-40, -5,-39,-24,  7,-23,  8,-15, 51, 21,-29,-55,-30,  0;
/M: SY='G';  M= -9,  1,-53,-11,-14,-53, 23,-16,-59, -7,-58,-41, 16,-38,-14,-17,  5,-13,-48,-59,-43,-15;
/M: SY='C';  M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70;
/M: SY='L';  M=-15,-49,-27,-53,-45,-12,-52,-41,  4,-31, 30, 14,-39,-41,-31,-34, -8,-15,  1,-46,-23,-38;
/M: SY='K';  M=-10,-10,-60,-20, 10,-50,-30,-10,-50, 80,-40,-30,  0,-20, 20, 30,-10,-10,-40,-60,-40, 10;
/M: SY='K';  M=-19, -4,-56,-18, -2,-49,-31, -7,-47, 48,-37,-28, 11,-27, 11, 29,-10,-11,-39,-59,-39,  1;
/M: SY='Y';  M=-40,-50,-50,-60,-50, 40,-60, 30,-30,-40,-20,-30,-40,-60,-30,-40,-30,-30,-30, 30,110,-40;
/M: SY='C';  M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70;
/M: SY='E';  M=-21, 16,-70, 29, 73,-60,-39, -2,-61,  7,-61,-42, -7,-21, 25,-12,-10,-20,-42,-62,-51, 54;
/M: SY='C';  M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70;
/M: SY='Y';  M=-36,-47,-46,-51,-40, 48,-56,  7,-26,-33,-16,-15,-41,-55,-16,-35,-30,-30,-28,  6, 57,-32;
/M: SY='Q';  M=-17, -8,-56, -9, 31,-50,-37,  0,-49, 34,-41,-18, -3,-26, 54, 11,-11,-12,-38,-49,-37, 37;
/M: SY='A';  M= 24,-16,-34,-20,-19,-46,  3,-23,-42, -7,-40,-26,-12,-24,-15, -9,  5, -9,-28,-54,-44,-17;
/M: SY='N';  M= -9, -7,-46,-20,-19,-44,  7,-21,-44, -3,-40,-15,  9,-36, -8,-17,  3, -9,-37,-56,-42,-17;
/M: SY='V';  M=-11,-47,-20,-53,-42,-22,-53,-48, 31,-35,  4,  8,-41,-40,-35,-38,-19, 11, 36,-50,-30,-41;
/M:         M=-17,-38,-49,-43,-37,-31, -4,-34,-33,-21,-21,-10,-29,-28,-27,-15,-23,-26,-30,-49,-40,-33;
/M: SY='C';  M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70;
/M: SY='S';  M= 12, -1,-21,-12,-13,-41,-16,-22,-35,-10,-38,-25, 10,-24,-10,-20, 54, 36,-22,-58,-30,-13;
/M: SY='S';  M=  0, -9,-36,-10, -1,-38,-30,-24,-28, -8,-29,-18,-10,-26, -8,-21, 17, -2,-20,-57,-37, -4;
/M: SY='N';  M=-26,  6,-46,-13,-19,-40,-30, -7,-34,  1,-38,-25, 27,-38, -7,  5, -4, -9,-31,-58,-34,-17;
/M: SY='C';  M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70;
/M: SY='K';  M=-20, -3,-58,-16,  0,-52,-30, -3,-52, 49,-44,-32, 13,-27, 13, 43,-10,-12,-42,-58,-40,  3;
/M: SY='C';  M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='E';  M=-22,-18,-48,-16, 11,-34,-49,-20,-18,-10,-22,-10,-24,-34,  3,-22,-19,-14,-14,-49,-33,  7;
/M: SY='D';  M=-14, 25,-62, 40,  0,-59, 11,-23,-66,-19,-66,-52, 11,-35,-17,-30, -7,-21,-55,-70,-57, -6;
/M: SY='C';  M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70;
/M: SY='K';  M=-12, -7,-58,-13, 20,-51,-32, -8,-50, 53,-43,-31, -2,-21, 21, 23, -5, -9,-38,-58,-41, 18;
/M: SY='N';  M=-30, 50,-50, 20,-10,-60,-10, 10,-60,  0,-60,-40, 90,-40,  0,-10, 10,  0,-50,-70,-40,-10;
/M:         M=-14,-33,-39,-35,-21, -6,-43,-12,-27,-19,-24,-13,-26,-21, -3,-25, -9, -8,-20,-30, -1,-15;
/M: SY='E';  M=-21,-17,-55,-13, 20, -6,-43, -7,-41, -8,-37,-26,-26,-34, -1,-23,-15,-23,-32,-37,-13, 10;
/M: SY='G';  M=-10,-18,-52,-23,-18,-48, 21,-28,-40,-24,-48,-33,-16,-42,-24,-33,-11,-20,-35,-58,-47,-21;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_01 which contains 572'970 sequence entries.

Total number of hits	19 in 19 different sequences
Number of true positive hits	19 in 19 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	CRC
Version [info]	4

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

19 sequences

LIN54_CAEEL (Q95QD7), LIN54_DANRE (Q08CM4), LIN54_DROME (A1Z9E2),

LIN54_HUMAN (Q6MZP7), LIN54_MOUSE (Q571G4), LIN54_PONAB (Q5RBN8), 
LIN54_RAT   (Q641Z1), LIN54_XENTR (Q0IHV2), MTL5_HUMAN  (Q9Y4I5), 
MTL5_MOUSE  (Q9WTJ6), MTL5_RAT(Q5XHX9), TCX2_ARATH  (F4JIF5), 
TCX3_ARATH  (Q8L548), TCX4_ARATH  (Q84JZ8), TCX5_ARATH  (Q9SZD1), 
TCX6_ARATH  (Q9SL70), TCX7_ARATH  (F4JY84), TCX8_ARATH  (Q700D0), 
TSO1_ARATH  (Q9LUI3)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

1 PDB

5FD3