PROSITE entry PS51519

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS51519
Entry name [info]	RWP_RK
Accession [info]	PS51519
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-JAN-2011 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51519
Associated ProRule [info]	PRU00852

Name and characterization of the entry

Description [info]

RWP-RK domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=85;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=80;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.3212302; R2=0.0113737; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6738.0327148; R2=6.0326085; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=808; H_SCORE=11612; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=544; H_SCORE=10020; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-5; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='Q';  M=  5, -4,-22, -4, -1,-17, -5,-10,-10,  1,-11, -4, -4, -5,  7,  2,  4,  2, -9,-23,-14,  0;
/M: SY='P';  M=  4, -4,-24, -2,  5,-21, -4, -8,-16,  8,-17, -6, -4, 10,  5,  2,  4, -2,-15,-25,-18,  3;
/M: SY='A';  M= 10, -1,-22, -3, -1,-17,  0,-15, -5,  1,-11, -5,  2, -3, -2,-12,  8,  6, -6,-32,-21, -4;
/M: SY='G';  M=  5, -3,-23, -7, -2,-19,  8,-10, -7,  2,-11, -2,  1, -2, -4, -9,  2,  0,-13,-25,-19, -5;
/M: SY='I';  M=  1, -8,-18,-10, -6, -8,-12, -9,  4, -4,  1,  1, -7, -8, -6, -8, -4,  1,  2,-26, -5, -7;
/M: SY='A';  M=  7,  0,-24, -2,  0,-17,  2,-15, -7,  4,-11, -1,  1, -7,  0, -6,  3,  0, -9,-26,-17, -2;
/M: SY='R';  M=  3, -6,-24, -5,  5,-15, -6,-13,-16, 13,-17,  2, -5,  0, 10, 15,  0, -8,-14,-17,-13,  4;
/M: SY='R';  M= -2, -8,-21, -4,  3,-17,-12, -6,-21, 11,-16,  0, -9,  3, 11, 24, -3,-12,-15,-18,-11,  3;
/M: SY='S';  M=  5, -2,-20, -5, -3,-13,  5,-16, -9, -1,-12, -8,  0, -9,  0, -5,  8,  1,-11,-21,-17, -4;
/M: SY='R';  M= -1, -7,-22, -6, -3,-11,-10, -9,-13,  6,-13,  0, -4, -7,  8, 20, -3,-10,-10,-20, -9, -2;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='T';  M=  8, -4,-17, -9, -8,-11, -9,-14, -1, -3, -6, -2,  1, -7, -4,-11,  7, 11,  1,-33,-16, -8; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='E';  M=  0, -3,-18,  1, 14,-21, -8, -4,-18, 12,-13, -3, -6,  8,  7,  5, -1, -9,-18,-18,-12, 10; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='K';  M=  1, -4,-16, -2,  1,-13, -4,-10,-11,  3,-10, -5, -5, -2,  1,  3,  3, -3, -9,-16,-10, -1; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='A';  M=  1, -2,-15, -3, -1,-12, -4, -6, -3, -1, -4, -2, -1, -4, -4, -9, -1,  0, -5,-20, -9, -3; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='A';  M=  1, -3,-15, -2, -4, -7, -3, -3, -3, -2, -3, -2, -5, -3, -2, -1, -1, -1, -2,-13, -3, -4; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='A';  M=  3, -2,-19, -3, -1, -9, -6,-10, -6,  2, -7, -1, -1, -7, -3, -4,  2, -2, -6,-22,-12, -4; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='D';  M=  2,  1,-22,  6,  2,-21,-12, -5,-14,  1,-11, -8, -2, -1,  5, -1,  4,  1,-10,-28,-11,  2;
/M: SY='I';  M= -3,-17,-13,-25,-21, 12,-18,-17, 31,-15, 22, 10,-11,-29,-20,-18,-12,  0, 24,-23,  8,-21;
/M: SY='T';  M=  8,  0,-22, -3, -6,-22, -9,-15, -9, -2,-10, -7,  3,  5,  3,-14, 13, 23, -5,-36,-15, -3;
/M: SY='L';  M= -6,-15,-16,-18,-12, 13,-19,-13, 10, -6, 15,  9,-13,-23,-10, -7,-12, -4,  7,-12, 13,-11;
/M: SY='E';  M=  2,  6,-10, 14, 24,-27,-15, -3,-21,  9,-10, -7, -1, -2,  8, -6,  3, -8,-19,-24,-16, 18;
/M: SY='D';  M=  3, 12,-13, 25, 14,-29,-13,-12,-18,  3, -5,-10, -1, -9,  1, -7,  0, -6,-12,-27,-13,  9;
/M: SY='I';  M= -5,-14,-10,-20,-17, 11,-17,-10, 30,-17, 30, 17,-12,-30,-19,-21,-16,  0, 19,-24, 13,-17;
/M: SY='R';  M=  5, -8,-21, -6,  3,-14,-12,-11,-12,  5,-12, -2, -8, -8, 14, 16,  4, -4, -7,-18,-11,  4;
/M: SY='Q';  M=  4, -7,-19, -6,  7,-18,-11, -8,-13,  5,-12, -4, -8,  2, 21, 10, -1, -3,-15,-20,-12, 10;
/M: SY='Y';  M=-21,-22,-32,-16,-14, 11,-27, 15, -4,-12, 13, -1,-21,-18,-10, -5,-14, -9,  3,  3, 36,-14;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='F';  M=-17,-26,-31,-37,-31, 68,-27,-20,  1, -9, 21, -9,-14,-35,-23, -9,-11,-14,  9,  8, 33,-31;
/M: SY='H';  M= -7, -2,-29,  0,  2,-22,-18, 45,-14, -7, -7,  3,  1, -3, -4,-11, -2, -6,-17,-38, -7, -1;
/M: SY='L';  M= -6,-14,-11,-15,-10,  7,-18, -7, 10, -7, 23, 20,-15,-28,-12, -8,-16, -2,  5,-14, 17,-10;
/M: SY='P';  M= -4,-12,-27, -7,  4,-31,-10,  2,-22,  6,-23,-27,-16, 67,  0,-10,  0,  7,-27,-32,-18, -2;
/M: SY='I';  M=  4,-12, -8,-18, -6, -6,-16,-14, 15, -9,  8,  6, -7,-20,  4, -8, -8,  0,  8,-24, -7, -3;
/M: SY='K';  M=  7,  0,-20,  2,  7,-19,-14,-12,-11,  8,-11,  2,  0, -6,  8,  4,  1,  0, -7,-28,-14,  6;
/M: SY='E';  M=  5,  9,-14, 21, 22,-31,-15,-11,-21,  8,-10, -9, -3, -2, 10, -3,  0, -6,-15,-25,-14, 18;
/M: SY='A';  M= 34, -3,-28, -3, -5,-15, -5,-21,  5, -3, -7,  8, -3,-14,  4, -9,  7, 10, 15,-46,-32, -4;
/M: SY='A';  M= 31, -2,-14, -2,  1,-19, -3,-21, -3, -2,-10,  4, -1,-11,  5,-10, 11,  9,  5,-45,-38, -1;
/M: SY='R';  M= -1, -5,-22, -3,  5,-14,-14,-12,-17, 16,-14,  6, -3, -4, 11, 22, -2,-10,-12,-20, -9,  5;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='E';  M=  7, -1,-12, -1, 10,-19,-12, -9, -8,  4, -6,  2, -1, -8,  8, -4,  0, -2, -8,-29,-16,  8;
/M: SY='L';  M= -8,-13, -5,-16,-13, 22,-21,-10, 20,-16, 36, 19,-17,-32,-20,-18,-19, -1, 11,-19, 25,-13;
/M: SY='G';  M= -1,  4,-31, -5,-13,-25, 50,-21,-11, -4,-19,-12, 10,-11,-13,-13, -1,-15,-26, -7,-27,-14;
/M: SY='I';  M=  4,-20,-17,-27,-27,  9,-23,-22, 37,-16, 15,  6,-11,-35,-24,-16,-10,  5, 36,-27,  3,-27;
/M: SY='S';  M=  0, -5, 13, -8, -2,-20,  8,-20,-13, -8,-15,-18, -3,-11,-12,-12, 14,  0,-17,-20,-30, -9;
/M: SY='I';  M=  5,-10,-17,-11, -8, -5,-15,-13,  8, -8,  6,  3,-11,-12, -8,-12, -2,  8,  8,-26, -1, -8;
/M: SY='T';  M=  9, -1,-21, -8,-14,-17,-12,-16, -2, -6, -6, -4,  6, -4, -3,-20, 21, 35,  3,-41,-13,-10;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='T';  M=  5, -7,-14, -9,-11, -9,-18,-17,  5, -7,  0,  0, -4,-15, -6,-11,  5, 14,  9,-32, -6,-10;
/M: SY='L';  M= -7,-13, -8,-18,-15, 26,-21,-12, 18,-15, 32, 15,-15,-32,-20,-17,-17, -2, 12,-19, 23,-15;
/M: SY='K';  M= -1, -1,-30,  1, 16,-10,-11,-18,-19, 35,-17, 18, -2,  7,  0, 11, -1,-10,-18,-18, -6,  8;
/M: SY='R';  M= -5,-10,-22, -6,  2,-10,-14,-13,-21, 16,-15,  6, -9, -5, 15, 38, -5,-16,-13,-11, -4,  3;
/M: SY='I';  M= -1,-15,-16,-17,-14, -3,-17,-12, 11, -7,  4,  7,-10,-19, -1,  9, -9, -6, 11,-21, -1,-11;
/M: SY='C';  M=-25,-19,128,-28,  4,-17,-35,-42,-16,-24,  2,-16,-10,-29,-19,-16,-16,-17,-15,-17,-44, -4;
/M: SY='R';  M=-11,-18,-25, -8,-10, -8,-20, -4,-26,  6,-15, -1,-18,-10, 24, 62, -9,-24, -9, -1,  6, -2;
/M: SY='Q';  M=  2, -6,-17, -1, 13,-20,-16, -6,-20, 10,-14, -1, -9, -3, 22, 22, -2,-11,-15,-16,-10, 15;
/M: SY='L';  M=-11,-11,-19,-16,-13, 16,-20, 10,  7,-13, 19, 11, -8,-24,-15,-13,-13, -5,  1,-21, 18,-13;
/M: SY='G';  M= -1,  3,-37, -6,-16,-27, 61,-23,-11, -7,-19,-16,  6,-10,-15,-16,  0,-16,-28,  0,-27,-16;
/M: SY='I';  M=  0,-19,-18,-30,-25,  5,-17,-19, 45,-17, 20, 10, -8,-32,-21,-22,-11,  2, 34,-26,  2,-25;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='P';  M=  1, -5,-24, -2,  4,-21, -4, -5,-15,  6,-14, -7, -7, 16,  1, -2,  0, -3,-17,-23,-13,  1; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='R';  M= -9,-18,-21,-10, -7,-11,-18,-10,-28, 10,-20,  0,-18, -9, 27, 69, -9,-27,-11,  0, -1,  1;
/M: SY='W';  M=-49,-50,-20,-40,-10, 10, 10,-49,-30,-20,-20,-30,-69,-30, -9,  1,-30,-50,-30,197, 49,-10;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-30,-10, 10,-40,-10, 10,-30, 10,-30,-40,-30,110,  0,-10,-10,  0,-40,-30,-20,  0;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-46,-15,-12,  8,-19, 28,-12,-10,  6, -2,-19,-11, -4, -3,-10,-11, -7,  2, 32,-12;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='R';  M= -8,-18,-21,-10, -7,-11,-19, -8,-26,  9,-18,  1,-18, -9, 28, 68, -9,-26,-10, -4, -1,  1;
/M: SY='K';  M=  2, -5,-24, -5, 12,-14,-14,-12,-16, 20,-16,  9, -4,  4, 15, 13, -1, -4,-16,-20,-10, 11;
/M: SY='I';  M= -2,-16,-11,-21,-17,  7,-19,-15, 24,-13, 20, 13,-12,-29,-16,-13,-12,  1, 19,-21,  9,-17;
/M: SY='Q';  M=  5, -3,-18, -3,  4,-15,-11,-14,-13,  9,-13,  2, -3, -4, 11, 10,  2, -1,-11,-24,-13,  4;
/M: SY='S';  M=  8, -1,-15, -2,  0,-15, -1,-14,-11,  2,-16,-10,  0, -8, -3, -6, 20, 10,-11,-28,-20, -5;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='L';  M= -4,-11, -8,-15,-11,  9,-18,-14, 19,-12, 22, 12,-13,-23,-14,-15,-12,  1, 12,-23, 12,-11; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='D';  M= -1,  9,-21, 13,  5,-20,-10, -5,-16,  3,-11, -6,  6, -8,  5,  1, -1, -5,-16,-28,-11,  4;
/M: SY='R';  M= -1, -2,-22, -5, -3,-10, -6,-10,-12,  7,-14,  1,  5,-10,  3, 13,  3, -5,-11,-23,-12, -4;
/M: SY='M';  M=  2, -7,-11, -9, -1,-11,-13, -7, -1,  2,  3, 11, -5,-15, -3, -5, -3,  1, -4,-25, -7, -2;
/M: SY='I';  M=  0,-14,-20,-20,-15, -3,-14,-12, 19, -8,  8,  7, -7,-20, -7, -6, -7, -2, 15,-23, -2,-13;
/M: SY='E';  M=  4,  5,-22,  8,  9,-25,-10,  2,-17,  3,-13, -4,  3, -3,  9, -4,  4, -1,-17,-29,-15,  8;
/M: SY='D';  M=  2,  3,-25,  6,  2,-18,-11, -5,-11,  2, -8, -3,  1, -8,  4, -4,  3,  0,-10,-26, -9,  1;
/M: SY='L';  M= -3,-12,-14,-15,-11,  7,-15,-11, 15,-11, 18, 10,-13,-23,-13,-13,-10, -1,  9,-17, 11,-12;
/M: SY='E';  M=  2, -4,-12, -2, 15,-17,-12, -9,-15,  6, -8, -2, -5, -5, 15,  4, -3, -8,-15,-18,-11, 15;
/M: SY='E';  M=  2, -1,-14,  1, 10,-19,-11, -9,-11,  4, -8, -4, -1, -7,  6, -3,  1, -3,-11,-22,-12,  8;
/M: SY='L';  M=  1, -3,-20,  0, -2,-11,-13, -9, -4, -2,  2,  2, -7,-16,  0, -3, -4,  0, -2,-21,  0, -3;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='M';  M=  4, -7,-15,-12, -5, -8,-11, -9,  5, -2,  4, 10, -2,-16, -3, -8, -7,  0,  0,-28, -8, -5;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='E';  M=  4,  2,-18,  6, 10,-22, -7,-10,-14,  6,-11, -5, -1, -3,  6,  1,  1, -6,-13,-24,-16,  7;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='D';  M=  2,  3,-16,  4,  2,-19,-10, -8,-10,  2, -7, -2,  4, -9, -2, -7,  3,  2, -9,-30,-14, -1;
/M: SY='A';  M=  4, -5,-14, -5, -4,-13,-11,-16, -3, -4, -5, -7, -5, -8, -4, -7,  3,  4,  0,-26,-11, -6;
/M: SY='E';  M=  4, -1,-20,  4,  9,-22, -8, -7,-15,  4,-13, -9, -6,  7,  6, -4,  3, -1,-16,-24,-15,  6;
/M: SY='G';  M=  8,  3,-23,  3, -2,-22,  9,-18, -9, -1,-11, -7,  1, -8,  0, -6,  3, -3,-11,-24,-21, -3;
/M: SY='E';  M=  6,  0,-15,  0,  8,-22, -9, -9, -7,  2, -7, -3,  1, -4,  7, -9,  2,  1, -9,-29,-17,  7;
/M: SY='A';  M=  3,  0,-18,  1,  2,-16, -6,-14,-12,  3,-10, -7, -1, -4,  0, -2,  3, -2, -9,-24,-14, -1;
/M: SY='Q';  M=  4, -3,-16, -2, 13,-21,-11, -9,-14,  7,-11, -4, -4,  2, 14,  0,  0, -3,-15,-22,-15, 13;
/M: SY='A';  M=  5, -2,-18,  0,  5,-17,-11,-11, -8,  3, -8, -3, -4, -5,  5, -1, -1, -3, -7,-26,-12,  4;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_01 which contains 572'970 sequence entries.

Total number of hits	17 in 17 different sequences
Number of true positive hits	17 in 17 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	RWP-RK
Version [info]	4

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

17 sequences

NLP1_ARATH  (Q8H111), NLP1_ORYSJ  (Q10S83), NLP2_ARATH  (Q7X9B9),

NLP2_ORYSJ  (Q0JC27), NLP3_ARATH  (Q9SVF1), NLP3_ORYSJ  (Q5NB82), 
NLP4_ARATH  (Q9LE38), NLP5_ARATH  (Q9SFW8), NLP6_ARATH  (Q8RWY4), 
NLP7_ARATH  (Q84TH9), NLP8_ARATH  (O22864), NLP9_ARATH  (Q9M1B0), 
RKD1_ARATH  (Q9M9U9), RKD2_ARATH  (Q9CA66), RKD3_ARATH  (Q9FGD1), 
RKD4_ARATH  (Q9LVU8), RKD5_ARATH  (O81791)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment