Matrix / Profile
[info]
|
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=57;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=57;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.3582128; R2=0.0073481; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1115; N_SCORE=8.55; MODE=1; TEXT='R';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=714; N_SCORE=5.6; MODE=1; TEXT='RR';
/DEFAULT: M0=-18; D=-80; I=-80; B1=-200; E1=-200; MI=-205; MD=-205; IM=-205; DM=-205;
...
A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
/I: B1=0; BI=-205; BD=-205;
/M: SY='M'; M= -2,-20,-43,-41, -4,-49,-23, 16,-45, 8,107,-45, -9,-27,-31,-37,-20, 4,-56, -4;
/M: SY='T'; M=-21,-41, 0,-10,-26,-40, -5, 12, -8,-16, 10, 18,-27, -5, 4, 27, 47, -4,-35,-42;
/M: SY='P'; M=-25,-57,-20, 4,-30,-50, 13,-59, 35,-53,-32,-10, 57, 4, 44, 15, 31,-47,-73,-28;
/I: I=-21; MI=0; MD=-55; IM=0; DM=-55;
/M: SY='P'; M=-18,-44, 41, 29,-67,-21, -2,-62, 23,-68,-58, 36, 52, 19, -7, 9, -9,-57,-75,-61;
/M: SY='P'; M= -4,-32,-40,-43, 3,-55,-53, 21,-41, 17, 18,-53, 65,-21,-56,-42,-22, 39,-54,-12;
/M: SY='P'; M= -1,-36,-42,-10, 9,-70,-33, 34,-23, 5,-25,-50, 41,-23,-20,-31, -6, 36,-30, 11;
/M: SY='T'; M= 1, 18,-60,-46, 11,-54,-20, -6,-25,-25, 2,-33,-16,-26,-18, 23, 60, 18, -4, 20;
/M: SY='V'; M= 7, 36,-81,-84, 0,-54,-74, 39,-57, 30,-12,-75,-75,-67,-63,-61,-24, 57,-80,-45;
/M: SY='P'; M=-15,-64, 20, -2,-24,-39, 22,-56, 3,-34,-43, 14, 47, 13, 7, 30, 25,-48,-26, -6;
/M: SY='P'; M= 11,-48, -6, 39,-42,-19,-22,-19, -5,-16, 0,-32, 55, -5,-11, 1, -5,-10,-40,-37;
/M: SY='D'; M=-32,-77, 61, 24,-59, 6, 11,-80,-15,-62,-32, 38,-37, 4,-23, 28, 25,-54,-63,-39;
/M: SY='T'; M= 17,-39, 38, 19,-41,-42, -7, -9,-24,-17, 30,-15,-55, 6,-36, 4, 50,-21,-33,-47;
/I: I=-20; MI=0; MD=-51; IM=0; DM=-51;
/M: SY='P'; M=-31,-51, 4,-30,-59,-29,-25,-58, -5,-27,-29, 9, 56,-20, -2, 53, 54,-57,-89,-49;
/M: SY='L'; M= -6,-26,-51,-56,-11,-78,-84, 37,-43, 49, 12,-61,-20,-56,-39,-52,-31, 42,-78,-33;
/M: SY='E'; M= 3,-67, 19, 36,-12, -7,-12,-20, 10,-21,-33, -8,-30, 15, 16, 23, -9,-32,-21, 11;
/M: SY='E'; M=-19,-87, 55, 62,-74,-62, 5,-56, 20,-48,-42, -8,-55, 30, -7, 0, 4,-33,-72,-47;
/M: SY='A'; M= 64, 6,-75,-73,-31,-54,-69, 17,-68, 10, -8,-48,-63,-53,-77,-26,-14, 42,-49,-52;
/M: SY='L'; M= 10,-16,-76,-20, 19,-72,-40, 25,-18, 42, 37,-39,-73,-26,-15,-27,-32, 14,-43, -8;
/M: SY='E'; M= -6,-50, 22, 41,-47,-32, 15,-43, 26,-35,-13, 19,-32, 34, 22, 10, -6,-40,-64,-20;
/M: SY='L'; M= -1,-45,-45, 0,-18,-62,-26, 28, 13, 31, 24,-47,-75, 5, 16,-31, 1, 8,-56,-24;
/M: SY='M'; M=-38,-47,-86,-83, 52,-86,-76, 23,-46, 39, 97,-70,-84,-60,-75,-56,-49, 1,-56,-24;
/M: SY='R'; M= 3,-45, -7, 12,-40,-41, 2, -1, 10, -1, -1, 4,-54, 22, 37, 6, 6, -1,-40,-24;
/I: I=-15; MI=0; MD=-39; IM=0; DM=-39;
/M: SY='E'; M= 3,-70, 22, 46,-73,-45, 3,-60, 40,-51,-48, -2,-56, 33, 31, 5, -5,-53,-50,-45; D=-15;
/I: I=-15; MI=0; MD=-39; IM=0; DM=-39;
/M: SY='H'; M=-14,-47, -6, 14,-32,-15, 49,-54, 10,-28,-30, 34,-33, 8, 16, 28, 19,-42,-52, 21;
/M: SY='G'; M=-21,-42, 15,-11,-73, 40, 25,-88, 31,-75,-54, 37, 2, 12, 38, 2,-24,-69,-87,-53;
/M: SY='I'; M=-17,-16,-43,-31, 16,-63, 29, 35,-27, 12, -5,-54, -9, -6,-14, -4, -5, 28,-42, 29;
/M: SY='H'; M=-22,-31, 11, -2,-49, 9, 51,-58, -5,-44,-52, 18, 3, 7, 35, 40, 6,-55,-26,-18;
/M: SY='H'; M= 16, 4,-47,-27, -3, -2, 45,-19,-13,-34, 7,-17,-31, 5, 38, 25,-16,-12, 0, 18;
/M: SY='L'; M= 23,-15,-87,-75, 23,-43,-81, 35,-70, 39, 11,-87,-65,-77,-63,-54,-38, 37, -4, 0;
/M: SY='P'; M= -2,-17,-78,-75, 4,-62,-67, 5,-71, 9,-34,-82, 98,-67,-77,-61,-40, 21,-25, 12;
/M: SY='V'; M=-35,-41,-90,-87,-37,-86,-70, 44,-79, 9,-21,-87,-86,-81,-81,-67,-42, 83,-83,-43;
/M: SY='V'; M=-40, 6,-60,-24,-24,-59,-45, 30,-51, 16, 14,-66,-83,-50,-64,-33, 22, 62, 21, 4;
/M: SY='D'; M=-35,-56, 80, 34,-74,-17,-26,-86, -3,-74,-62, 45,-48, -8,-11, 6,-11,-65,-92,-56;
/I: I=-23; MI=0; MD=-59; IM=0; DM=-59;
/M: SY='E'; M= -6,-58, 54, 55,-84, 6,-19,-82, 9,-80,-71, 22, -4, 2, 9, 11,-40,-69,-90,-57;
/I: I=-17; MI=0; MD=-33; IM=0; DM=-33;
/M: SY='N'; M=-24,-83, 33, 24,-38,-36, -3,-60, 3,-52,-50, 34,-38, 14,-13, 4, -7,-45,-90, -6; D=-13;
/I: I=-13; DM=-33;
/M: SY='G'; M=-30,-70, 32, -1,-52, 67,-15,-89, 3,-71,-36, 39,-42, 15, 4,-22,-41,-84,-72,-54;
/I: I=-21; MI=0; MD=-53; IM=0; DM=-53;
/M: SY='R'; M=-32,-29,-13, 30,-54,-16, 19,-35, 45,-41,-17, 17,-49, 29, 47,-20, 2,-21,-71,-40;
/M: SY='L'; M=-33,-24,-68,-63, 26,-81,-69, 27,-65, 44, -2,-63, 27,-60,-78,-61,-24, 34,-46, 39;
/M: SY='V'; M= -1, -6,-57,-16,-45,-77,-14, 38,-10, 20, -4,-66,-73, 5, -8,-19,-14, 48,-59,-20;
/M: SY='G'; M=-15,-58,-18,-57,-78, 97,-44,-99,-55,-93,-86,-16,-72,-61,-58,-19,-56,-91,-86,-45;
/M: SY='I'; M=-35,-33,-84,-49, 0,-86,-69, 56,-71, 25, 44,-41,-73,-47,-40,-33, -9, 43,-16, 0;
/M: SY='V'; M=-31,-49,-89,-70, 6,-79,-87, 56,-70, 36,-12,-85,-76,-72,-82,-68,-52, 58,-26,-13;
/M: SY='T'; M=-26,-28, 3,-16,-39,-29, 24,-56,-40,-35,-45, -5,-28,-30,-22, 53, 78,-48,-82,-26;
/M: SY='R'; M= -7,-57, 2, 3,-26,-52,-16, 9, 12, 11, 12,-31,-22, 14, 39, -4,-14, 4, -2,-17;
/M: SY='R'; M= -4,-61, 7, 24,-37, -1, 19,-53, 35,-46,-35, -1,-33, 0, 35, 24, 13,-35,-44,-13;
/M: SY='D'; M=-20,-72, 90, 20,-61,-40, 0,-76,-15,-70,-28, 9,-71, 7, -6, 5, -9,-64,-55,-48;
/M: SY='I'; M=-16,-17,-97,-80, 11,-88,-86, 53,-83, 51, 14,-92,-84,-81,-76,-69,-53, 36,-73, -9;
/M: SY='L'; M= -8,-40,-42,-23, -6,-58,-21, 29,-22, 44, 29,-39,-68,-16, 16,-37,-16, 15,-40,-20;
/M: SY='R'; M= -5,-56, 3, 24,-13,-23, 10,-49, 36,-33,-22, 3,-31, 21, 43, 14, 0,-46,-80,-10;
/M: SY='A'; M= 35, -7,-35, 2, 11,-34, 8, -2,-18, 1, -2,-15,-55,-11, -1, -4, -8, 10, 16, 23;
/M: SY='L'; M=-18,-47,-25, -7, 1,-41,-32, 31,-26, 39, 24,-30,-40, -6,-12,-33,-21, 17,-57, 9;
/M: SY='A'; M= 14,-49, 5, -2,-11,-14, -1, 1, -1, 4, 4, -6, -6, 8, 5, 4, -7, 11,-21,-20;
/I: I=-21; MI=0; MD=-55; IM=0; DM=-55;
/M: SY='K'; M=-14,-51, 19, 26, -8,-16, 10,-37, 26,-30,-11, 18,-31, 22, 20, 8, -5,-40,-74, 24;
/M: SY='P'; M= -6,-43, 0, 33,-57, 34, -9,-28, -6,-37,-34, 25, 41, 17, -7, 11,-19,-51,-50,-47;
/I: I=-23; MI=0; MD=-59; IM=0; DM=-59;
/M: SY='H'; M=-11,-58, 2, -2,-20,-12, 40, 5, 4, 9, -5, 28,-34, 2, 16,-11, -1,-10,-13,-29;
/I: I=-24; MI=0; MD=-62; IM=0; DM=-62;
/M: SY='D'; M= 19,-50, 52, 24,-42,-25,-38,-55, 19,-32,-50,-13, 30, 6,-11, 7, 0,-30,-47,-16;
/M: SY='E'; M=-25,-28,-53, 32, -3,-29,-44, 9, -9, 21, 11,-26,-25,-20,-11, 23, 15, 17,-79,-33;
/I: E1=0; IE=-205; DE=-205;
» more
|