PROSITE entry PS51194

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS51194
Entry name [info]	HELICASE_CTER
Accession [info]	PS51194
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-APR-2006 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51192
Associated ProRule [info]	PRU00542

Name and characterization of the entry

Description [info]

Superfamilies 1 and 2 helicase C-terminal domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=151;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=146;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.8787699; R2=0.0049794; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=19233.5097656; R2=7.0479798; TEXT='Heuristic 0.5%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1531; H_SCORE=30024; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=1129; H_SCORE=27191; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-15; D=-100; I=-100; B1=-400; E1=-400; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;

...

                A   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y
/I:         B1=0; BI=-255; BD=-255;
/M: SY='Q';  M= -8,-54, 30,  5,-30,  1,-23,-33, 15,-13,-12, 21, -1, 35, -2,  2,  3,-19,-16,  1;
/M: SY='L';  M=-26,-30,-50,-36,  9,-40,-33, 44,-33, 48, 11,-55,-37,-50,-41,-45,-24, 32,-52,-19;
/M: SY='D';  M=-29,-27, 40, 35,-43,-44,-27,-13, 27,-21,-33,  5,-10, 18, 10,-14, 14,-11,-59, -9;
/M: SY='Q';  M= -4,-57, 34, 27,-45,-41,  3,-36, 21,-44,-35,  5,-18, 66, 16, -6,-15,-45,  8,-28;
/M: SY='L';  M=  1,-41,-25, -5, 21,-38,  8, 13, -9, 32,  3,-23,-43,-17, -9,-18,-18,  5,  3, 28;
/M: SY='Y';  M=-20,-15,-43,-41, 19,-25, -7, 34,-41, 36, 26,-43,-57,-48,-45,-42,-20, 23,-42, 47;
/M: SY='V';  M=-14,-28,  6, 17,-11,-39,-12, 16,  7, 10, -1, -8,-25,-17,-10, -2,  3, 18, -6, 13;
/M: SY='K';  M=  5,-30, -6, 23,  9,-41,-11,-10, 30,-12,-17, 11,-26,  0,  5,-10, -2, -2,  7, 11;
/M: SY='V';  M=-11, 31,-54,-19, -8,-48,-10, 34,-33, 34,  0,-50,-33,-25,-51,-32, 12, 35,-17, -8;
/I:         I=-8; MD=-21;
/M: SY='E';  M=-27,-45, -8, 27,-42,-35, -4,-50, 18,-34,-39,-15,-13, 11,  4,-14,-20,-30,-41,-50; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-21;
/M: SY='E';  M=-30,-52, -4, 36,-74,-22,-36,-72, 16,-60,-63,  8,-32,  3,-15,  3,-14,-62,-76,-64; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-21;
/M: SY='E';  M=-48,-79, 10, 36,-60,-55,-54,-80,  3,-76,-47,-21,-57, 23, 14,-14,-53,-75,-79,-61; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='E';  M=-62,-68,-19,  2,-77,-42, -8,-59,-15,-20,-35,-21,-75, -7, -5,-15,-19,-53,-88,-71; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-21;
/M: SY='R';  M=-19,-58,-42,-17,-39,-54,-25,-26, -1,-35,-35,-35,-22,-15,  6,-20,-13,-27,-14,-39; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-21;
/M: SY='H';  M=-18,-51,-27, -1,-46,-23, 38,-46,-17,-33,-59,  0,-18,  3,-36,-17,-32,-47,-78,-22; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-21;
/M: SY='K';  M=-25,-73,-22, -6,-24,-25,-13,-58, 14,-27,-33,-27, 10,-10,  5,-22,-11,-48,-19,-30; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-21;
/M: SY='G';  M=-30,-67,  9, -5,-22, 24, 23,-31, -8,-46,-55, 13, 18,-12,-38,-13,-20,-41,-45,-55; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-21;
/M: SY='G';  M=-26,-63,  8, 18,-36, 30, 12,-63,  1,-48,-21,  4,-15, -3,-21,  2, -7,-47,-66,-24; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-21;
/M: SY='R';  M=-28, -4, 15,-21,-62,-35,-32,-55, 42,-57,-50,-14, -3, 37, 51, 11,-14,-57,-62,-43; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-21;
/M: SY='V';  M=  8,  0,-46,-52,-18,  7,-23, 22,-29,-24,-10,-45, -4,-50,-54, -2, 29, 37,-62,-36; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-21;
/M: SY='I';  M=-42,-42,-62,-50,-13,-59,-38, 59,-55, 52, 26,-57,-58,-37,-53,-45,-24, 19,-51, -8;
/M: SY='I';  M=-36,-51,-64,-59,-29,-66,-62, 66,-56, 21,-17,-58,-57,-55,-58,-44,-35, 63,  3,-37;
/I:         I=-16; MI=0; MD=-40; IM=0; DM=-40;
/M: SY='F';  M=-51,-52,-62,-59, 96,-61,-42, -1,-55,  2,-20,-54,-62,-59,-53,-41, -3,-12,-23, 52;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-39; IM=0; DM=-39;
/M: SY='C';  M=  2, 80,-43,-39,-13,-48,-53, -7,-48,  6,-13,-43,-40,-48,-45, 13, 38, 39,-63,-43;
/M: SY='N';  M=  4,-52, -8,  7,-34,-34, 18,-38, -8,  0,-31, 37, 14, 36,  4, 20, 10,-20,-60,-35;
/M: SY='T';  M=-23,-33,-35,-11,-18,  5, -1,-35,-23,-30, 19, -4,-36,-14,  1, 46, 60,-40, -4, -8;
/M: SY='K';  M=-19,  9,-37,-18,-29,-51,-31, -1, 49,-32,-37,-28,-49, 21, 44, -4,  9, 13,-11,  5;
/M: SY='K';  M=  3,-55, 10, 32,-45,-46,  4,-52, 43,-52,-20, 17,-35, 23, 36,  1, -8,-24,-58,-29;
/M: SY='M';  M= -8,-28,  2, 23,-20,-32, -1,-18,  7, -8, 57,-17,-47,  9,  6,  7, 25, -6,-30,-19;
/M: SY='C';  M= 40, 59,-48,-49,-20,-28,-52, 13,-44, 14,-16,-45,-53,-33,-51,  4,  7, 31,-59,-43;
/M: SY='D';  M=-31,-58, 66, 59,-46,-48,  2,-40,  6,-28,-18, 10,-34, 14,-18,-25,-22,-47,-41,-10;
/I:         I=-17; MI=0; MD=-42; IM=0; DM=-42;
/M: SY='Q';  M=  3,-29, 28, 27,-19,-34,  0,  2,-13, -5, -5, -5,-48, 29,  5, -4,  5,-13,  7, -2;
/M: SY='L';  M=-25,-10,-61,-49, -4,-63,-29, 33,-55, 61, 25,-57,-59,-50,-54,-47,-14, 21,-50,  0;
/M: SY='A';  M= 35, 30,-32, 20,-25,-32,  7,-30,  0,-31,-24,-22,-38, -5,-24, 24, 31,-20, -2, 12;
/M: SY='E';  M=  3,-26, 25, 36,-40,-22, -1,-30, 25,-24, -7, 17,-41, 30, 12,  3,-21,-34,-11,-30;
/M: SY='Y';  M=-15,  0,-25, 11, 23,-44, -9, -5, 14, 15, 13,-19,-40,-20,  1,-28, -4,-11, 39, 48;
/M: SY='L';  M=-41, -4,-64,-57,  7,-64,-30, 19,-56, 72, 33,-60,-62,-50,-49,-55,-42,-10,-22,-10;
/I:         I=-19; MI=0; MD=-47; IM=0; DM=-47;
/M: SY='R';  M=-26,-55, -9, 27,-56,-36,-22,-50, 41,-42,-17, 22,-46, 30, 55,  6,  3,-36,-58,-38;
/I:         I=-22; MI=0; MD=-57; IM=0; DM=-57;
/M: SY='E';  M=-20,-57, 11, 48,-58,-41,  6,-57, 41,-43,-32, 18,-32, 40, 31,  4,-30,-49,-58,-32;
/I:         I=-8; MD=-21;
/M: SY='R';  M=-16,-54,-13, -2,-48,-61,  8,-39, 21, -8, -5, 11,-40, -1, 31,-34,-40,-46,-29,-35; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='G';  M=-41,-72,-16,-27,-44, 55,-40,-77,-29,-75,-36, 14,-30,-22,-38,-15,-49,-60,-73,-52; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-21;
/M: SY='Y';  M=-48,-66,-49,-58, 24,-74,-17, 34,-58, 13, -3,-66,-62,-53,-64,-51,-43, 16, 14, 37; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-21;
/M: SY='K';  M=-20,-48,  2,-11,-66,-40,-30,-64, 31,-54,-46, 14, 14, -5, 27, 11,-10,-49,-70,-44; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-21;
/M: SY='V';  M= 29, 20,-54,-48,-14,-51,-59,  5,-51,-26,-27,-44,-28,-56,-51,-11,-15, 38,-62, 12; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-21;
/M: SY='A';  M= 10, -6,-11,-14,-23,  1,-21,-15,-19, -2, -8,-29,-33,-13,-13, -3,  3, -6,-35, -7; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-21;
/M: SY='Y';  M= 16,-14,-39,-10,-19,-16,  4,-11,  0, -9, -2,-11, 11,-18, 19,  0,-11,  9,-48, 38; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-21;
/M: SY='I';  M=-46,-53,-64,-59, 19,-66,-49, 52,-56, 50, 24,-59,-60,-52,-56,-49,-33, 13,-44, 31; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='H';  M=-35,-59, 29,-27,-32,-49,120,-58,-32,-48,-37,  4,-51,-22,-30,-18,-31,-58,-58, 49;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-39; IM=0; DM=-39;
/M: SY='G';  M= 19,-51,-33,-20,-47, 70,-18,-51, -5,-41,-36,-27,-36,-31,-41, 30,-10,-50,-55,-39;
/M: SY='D';  M=-14,-41, 39,  8,-51, 32,-15,-55,  9,-56,-40, 11,-24, 20, 20, 22,  0,-27,-61,-41;
/M: SY='M';  M=-24,-32,-54,-38,-13,-45,-34, 19,  3, 38, 73,-47,-52,-18,-19,-34, 23,  9,-54,-28;
/M: SY='P';  M=-18,-40, 16, 10,-45,-30,-17,-22, 26,-36,  6,  5, 47, -5,-16, 29, 24,-22,-61,-47;
/M: SY='Q';  M=  2,-55, -9,-19,-27,-17, -7, -2, -7,-27,-38, -1, 26, 73,-13, 11, 10,-16,-55,-21;
/M: SY='E';  M= -1,-53, 12, 24,-22,-25,  9,-11, 22, -4,-25, 22,-14, 14, 11,  8,-15,-13,-58,-35;
/M: SY='E';  M= -8,-57, 29, 62,-56,-15,-12,-21,  9,-19, -9,  6,-43, 42,-10,-20,-26,-31,-60,-47;
/M: SY='R';  M=-40,-47,-41,-26,-46,-41, -5,-48, 16,-41,-23,-12,-52, 43, 92,-33,-23,-46,-55,-41;
/M: SY='D';  M=-13,-54, 35, 33,-39,-44,-15, -8,  7,  0, -7, -1,-46, 32, 10,-13, 17, -7,-60,-34;
/M: SY='E';  M=  1,-16,  9, 41,-31,-34, -9,-25, 22,-26,-31, -4,-39, 21, 28,  6,  6,-23, 11,-32;
/M: SY='I';  M= 18,-49,-44,-21,-29,-53,-52, 50,-33,  8, -4,-25,-41,-16,-29,-10,  7, 41,-57,-19;
/M: SY='M';  M=-12,-22,-31,  1, 27,-58, -4, 40,-42, 32, 46,-43,-48,  7,-48,-32,-30, 11,-49, -9;
/M: SY='Q';  M= -7,-54, 25, 35,-38,-44, 22,-32, 14,-38,-17, 18,-45, 35, 25, -7, 25,-35,-60,-32;
/M: SY='R';  M=  4,-56, 27, 24,-52,-19,  6,-23, 27,-26,-43, -1,  6, 10, 35,  1,-13,-41,-57, -8;
/M: SY='F';  M=-15,-52,-62,-50, 93,-20,-24,-17,-54, 15,-28,-54,-45,-58,-53,-41,-26,-19, 48, 26;
/I:         I=-17; MI=0; MD=-42; IM=0; DM=-42;
/M: SY='R';  M= -1, -6,  7,-10,-35,-20,-21,-39, 30,-39, -4, 12,  3,  2, 46,  1,  6,-38,-29,-22; D=-17;
/I:         I=-17; DM=-42;
/M: SY='S';  M=  4,-42,  9,  8,-55, -1, -5,-43, 19,-22,-31, 25,  6, 16, 15, 29,  5,-45,-60,-47; D=-17;
/I:         I=-17; DM=-42;
/M: SY='G';  M=-11,-55, 13,  3,-27, 62,-20,-42,  7,-43,-48, 21,-24, 13,-13, -1,-24,-49,-56,-41;
/M: SY='K';  M=-18,-40, 24, 33,-30, -3, 19, -5, 38,-33,-20, -6,-19, 13,  5, -4,-14,-14,-58,-27;
/M: SY='F';  M=-16, 18,-23,-42, 35,-14,-16, 23,-17, -1,-24,-11,  0,-28, 22, -4,-10,  6, 15, 19;
/M: SY='D';  M=-16, -8, 43,-16,-53,-22, 15, -6, 21,-36,-41, 23, -3, 25, 24, -2,-20,  4,-16,-44;
/M: SY='V';  M=-22, 24,-61,-58, 37,-45,-57, 45,-55,  8, -4,-47,-58,-55,-56,-36,-13, 59,-51,-14;
/M: SY='L';  M=-42,-21,-63,-57,-25,-65,-53, 34,-56, 63, 23,-59,-60,-51,-55,-52,-13, 36,-55,-35;
/M: SY='V';  M=-26,  6,-50,-58,  8,-64,-60, 51,-56, 26,-10,-57,-58,-55,-57,-49,-35, 64,-57,-35;
/M: SY='C';  M= 56, 57,-36,-42,-53,  8,-47,-47,-42,-45,-44,-28,-47,-39,-47, 47, 20,-24,-61,-50;
/M: SY='T';  M=-28,-26,-40,-42,-44,-47,-48,  9,-39,-23,-36,-22,-42,-41,-47, 20, 92,-10,-64,-30;
/M: SY='N';  M=-16,-36, 56, -8,-56,-34,-26,-22,  8,-49,-47, 65,-16,-22,  6,  3, 15,-19,-69,-48;
/M: SY='V';  M= 31,-15,-58,-52,-33,-53,-54, 39,-51, 19, 14,-52,-55,-49,-53,-16,-26, 53,-56,-11;
/M: SY='A';  M= 47,-36,-54,-50, 30, 28,-51, 11,-50, 23,-16,-46,-53,-47,-52,-17,-34, -3,-22,-36;
/M: SY='E';  M= 27,-53, -8, 55,-59, 44,-41,-58,-28,-56,-49,-17,-43,-22, 12, 11,-15,-44,-58,-52;
/M: SY='R';  M=-34,-15,-37, 33,-45,-53,-38,-36,-21,  0, 50, -3,-48,-13, 58,-17, 28,  5,-59,-42;
/M: SY='G';  M=-24,-54,-43,-52,-61, 90,-49,-67,-38,-64,-54,-29,-47,-34,-53, 23,-34,-60,-54,-55;
/M: SY='I';  M=-28,-51,-62,-57,-16,-65,-55, 61,-54, 47, -6,-56,-57,-51,-28,-50,-10, 33,-54,-24;
/M: SY='D';  M=-36,-53, 88,-20,-60,-41,  6,-57,-33,-59,-54, 57,-47,-34,-41,-19, 34,-47,-78,-48;
/M: SY='I';  M=-36,-35,-38,-54, 25,-64,-55, 62, -1, 35,  2,-54,-57,-50,-40,-51,-38, 32,-50,-32;
/M: SY='P';  M= -9,-59, 23,  4,-48,-16,-19,-27, 12,-55,-38,-10, 78, 18, -8, -1,  8,-44,-60,-51;
/M: SY='N';  M=  4,-53, 26, 24,-13, 29,  3,-23,-18,-18,-43, 30,-47, 16,-19,  1,  2,-33,-58,-23;
/M: SY='V';  M= 30, 32,  4,-36,-28,-17,-55, 29,-48, -9,-29,-46,-53,-48,-33,-12,-25, 55,-61,-44;
/M: SY='N';  M=-23,  2, 41,  3,-48,-29, -7,-46,-12,-49,-46, 46,-31, -5, 27, 33, 15,-11,-22,-29;
/M: SY='H';  M=-33,-16,-51,-31, 19,-29, 51, -8,-38, 30, -4,-20,-43,-20,-18,-38, 10, 29, 29, 33;
/M: SY='V';  M=-24,-24,-62,-56,-25,-63,-61, 32,-53,  3, 21,-57,-57,-54,-43,-46,-23, 81,-63,-39;
/M: SY='I';  M=  2,-30,  2,-46, 11,-59,-54, 67,-40, -5, -2,-50,-54,-51,-47,-45,-24, 39,-51,  8;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-31; IM=0; DM=-31;
/M: SY='N';  M=-35,-29,-32,-23, -5,-50, 43, 35, -6,  4, 18, 53,-38, 12,  8,-21,-18,  1,-59,-36;
/M: SY='Y';  M=-24,-54,-35,-21, 54,-58,  1, -6,-49, 22, 24,-51,-59,-36,-48,-40,-26,  0, 11, 80;
/M: SY='D';  M=-37,-57, 85,  4,-36, 10, -2,-59,-34,-58,-44, 24,-47,-19,-17,  4,-11,-49,  0,  4;
/M: SY='P';  M= 24,-10,-48,-39, -6,-23,-27,  7,-35, 24, 19,  4, 31,-43,-43, 13, -6,  5,-53, -4;
/M: SY='P';  M=-32,-22, 54,  6,-59,-40,  3,-51,-21,-44,-49,-27, 89,-19,-24,-25,-29,-19, 15,-51;
/M: SY='W';  M=-12,-56, -5, -8,-16, -5,-17,-46, 33,-27,-29, 15,-19,  0, 32,  4, 10,-35, 88,-31;
/I:         I=-17; MI=0; MD=-42; IM=0; DM=-42;
/M: SY='N';  M=-32,-49, 31, -6, -6,-22, 18,-41,-30,-36,-29, 64,-47,  1,-32, 49, 19,-41,-64,-42;
/M: SY='P';  M=  1,-34,-23, 11,-27,  4,-40,  5,-19,-21, 18,-39, 60,-14, -7,  1, -6, 11,-32,-15;
/I:         I=-17; MI=0; MD=-42; IM=0; DM=-42;
/M: SY='E';  M= 16,-53, 15, 46,-44,-14, -9, -3,  0,-11,-13,-24,-45, 11,  6, 16, -1,-23,-59,-45;
/M: SY='S';  M=  6,-50, 23, 11,-36,-12,-31,-22,-22,-18,-16, 17,-41,  3,  6, 51,  5,-15,-28,-45;
/M: SY='Y';  M= -4,-56, 20,-12, 13,-53,-15,-27,-31,  9, 10,-42,-55, 13, 25,-29,-25,-27,-32, 80;
/M: SY='I';  M= -3,-52,-39,-13,-29,-58,-50, 57,-40, 26,  9,-15,-54,-24,-51,-33,-20, 32, -8, 18;
/M: SY='Q';  M=-42,-62, -4,-20,-60,-48, 94,-58,-16,-50,-25,-22,-47, 99,-24,-17,-37,-59,-61,-31;
/I:         I=-17; MI=0; MD=-42; IM=0; DM=-42;
/M: SY='R';  M= 13,-25,-42,  6,-35,-41,-38,-11,-15, -3, -7,-39,-51,-22, 81,-19,  6,-40,-56,-42;
/M: SY='I';  M= -6, -9,-52,-45,-20,-48,-29, 52, -3, -5, 30,-44,-52, -4, 42, -4, -5, 13,-55,-38;
/M: SY='G';  M=-14,-56,  5,-40,-61, 91,-18,-68,-47,-64,-54,-29,-48,-44,-54,-13,-45,-62,-55,-43;
/M: SY='R';  M=-47,-63,-43,-31,-41,-57,-32,-62, -4,-54,-43,-36,-55, -6,107,-41,-45,-56,-55,-41;
/M: SY='A';  M= 55,  3,-36,-44,-46,-20,-51,  0,-36,-23,-35,-39,-47,-43,-48,  1, 47, 27,-60,-47;
/M: SY='G';  M= 29,-53,-19,-37,-54, 72, 40,-59,-42,-36,-35,-26,-48,-40, -6,-13,-35,-52, 16,-26;
/M: SY='R';  M=-24,-62,-36,-24,-56,-55,-11,-61, -3,-54,-33,-35,-54, -6,104,-27,-44,-55,-56,-42;
/M: SY='N';  M= 20,-21, 24,-30,  3, -4,-10, 13,-21,-13, -6, 31,-19, -3,-15,  3, -1,  0,-57,-21;
/M: SY='G';  M= -7,-21,-10,-19,-56, 69, -6,-24,  9,-38,-34,  5,-18,-23,  0,-12,-27,-25,-57,-50;
/I:         I=-14; MD=-37;
/M: SY='Q';  M=-31,-34, -5, -7,-66,-27, 16,-42,  3,-30,-18,  2,-35, 48, 11,  3,-18,-51,-71,-44; D=-14;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-37; IM=0; DM=-37;
/M: SY='P';  M= -9,-56,-11, 17,-54,-31,  0,-21, 36,-37,-36, -2, 53, 18,  1, 10,  9,-24,-12,-30;
/M: SY='G';  M=  1,-33,-37,-49,-49, 80,-36,-48,-24,-57,-49, -9,-28,-43,-35, 15,-28, -9,-56,-53;
/M: SY='T';  M=-27,-39,  1, -8,  0,-40, 30, -2, 24, -9,  2, -9,-49,  4,  8, -8, 35,  5,-13, 18;
/M: SY='C';  M= 46, 81,-50,-21,-29,-31,-51,  1,-40,-38,-37,-37,-53,-35,-50, 16,-13, 32,-60,-14;
/I:         I=-8; MD=-21;
/M: SY='Y';  M=-44,-58,-43,-48, 20,-65,  0, 49,-38, 10, -5,-41,-60, -2,-34,-50,-17, 22,  4, 50; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-21;
/M: SY='R';  M=-29,-12,-40,-44,  7,-57,-14, -1,-28, 24, 21,-10,-48,-42, 36,  5, 17, -7,-56, -3; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-21;
/M: SY='F';  M=-43,-36,-65,-55, 61,-67,-34, 15,-58, 34,  9,-60,-66,-57,-44,-56,-38, -6,-35, 56; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-21;
/M: SY='Y';  M= -4, 15,-56,-56, 11,-37,-53, 15,-60, 10,-14,-52,-68,-58,-42,-45,-32, 12, 15, 50; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-21;
/M: SY='T';  M= -4,  0,  8,-26,-65,-24,-17,-45,-33,-47,-44,  9,-18,-26,-28, 15, 42,-45,-38,-60; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-21;
/M: SY='P';  M=-28,-74,-23, 13,-32,-59,-16,-52,  1,-43,-24,-33, 28, -7,  1,-17,-22,-28,-41,-11; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='E';  M= -8,-52, 20, 49,-56,-13,  3,-45, -6,-53,-55,  6,-36,  3,  0,-10,-18,-58,-66, -8; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-21;
/M: SY='D';  M=-39,-60, 81, 67,-64,-49,  3,-64, -8,-59,-55, -7,-42,  3, -9,-35,-39,-59,-69,-49;
/I:         I=-18; MI=0; MD=-45; IM=0; DM=-45;
/M: SY='T';  M= 16,-40,-24, -3,-19,-42,-13,-12, 14,  0, 16,  2,-47, -7, -7, 29, 34, -8,-20,-18;
/I:         I=-26; MI=0; MD=-65; IM=0; DM=-65;
/M: SY='K';  M=  5,-53,  3, 28,-35,-18, -8,-18, 29,-28, -7, 13, -5,  4, 24, 12,  4,-25,-36,-31;
/M: SY='M';  M=-16,-43,-45,-32, 22,-33, -9, 18, -5, 24, 35,-15,-42, -5, 21,-28, -2,  2,-24, 30;
/M: SY='L';  M=-12,-37,-28, -1, 19,-23,-23, 12, -7, 38, 23,-32,-21,  4, 13,-32,-33,  3,-49, -6;
/M: SY='R';  M=-19,-33,  2, 25,-33,-35, 20,-40, 36,-30,-21, 13,-13, 29, 46, -7,-16,-32,-56,-10;
/M: SY='K';  M= -2,-30, 13, 34,-43,-34,  4,-41, 35,-41, 10, 17,-24, 27, 24,  0, -6,-48,-11, -5;
/M: SY='I';  M=-19,-30,-60,-55, -2,-61,-40, 59,-36, 38, 40,-45,-46,-46,-30,-35,-12, 20,-51,  1;
/I:         I=-15; MD=-39;
/M: SY='Q';  M=-12,-31,-15, 30,-12,-36, -8, 14,  2, -1,  8,-24,  5, 35,-13,-16,  2,  5,-54,  0; D=-15;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-39; IM=0; DM=-39;
/M: SY='E';  M=-25,-58, 17, 62,-48,-40,-14,-46, 31,-41,-11,  6,-28, 40,  1,  1,-19,-45,-58,-25; D=-15;
/I:         I=-15; DM=-39;
/M: SY='I';  M=  5,-23,-16, -4,  4,-22,  3, 26,-11, -1, 22, -1,-18, -6,  1,-21,  3, 12, -6, -3; D=-15;
/I:         I=-15; DM=-39;
/M: SY='M';  M= -4,-38,-17,-10, 17,-32,-17, 18,-22, 34, 35,-21,-28, 11,-27,-22,-11, -9,-46, 27;
/M: SY='N';  M=-19,-54, 13, 23,-49, -5, -9,-39, 20,-37,-45, 46,-47, 30, 37, 12, -3,-41,-38,-40;
/M: SY='T';  M= -3,-36,  2, 17,-21,-13,  2,-13, 20, -9, -2,  5,-13, 12,  8, 11, 23,-14,-58,-35;
/M: SY='N';  M=  7,-39,  0, 21,-24, -5, -8,-50, 28,-29,-32, 31,  4,  7, 14, 11, -3,-29,-27,-11;
/M: SY='I';  M= -8,-35,-41,-28,  9,-18,  8, 39,-15, 32, 16, -5,-34,  1,-22,-40,-25, 11,-11,-10;
/I:         I=-17; MI=0; MD=-42; IM=0; DM=-42;
/M: SY='Q';  M=  0,-27, 29, 39,-40,-19, 18,-39, 14,-42,-20,  6, -4, 43, -7,  8,-14,-41,-34,  0;
/M: SY='E';  M= -2,-13,  5, 35,-52,  6,-11,-20,  3,-28,-25, 19,  5, 15, -3, 12, 10,-12,-59,-20;
/M: SY='I';  M=-16, -5,-35,-44, 19,-57,-31, 37,-19, 26, 25,-43,-38,-38,-17, -9, 12, 30,-25, -3;
/M: SY='P';  M=-11,-56,  5, 17,-25,-43, -5,-15, 23,-31,-24, 14, 53,  5,  0,-11,-13, 11,-56, -1;
/M: SY='M';  M=-21,-27,-10,  3,  1,-34,-30,  7,  2, 20, 24,-18, 13, -2,-17, -7, 11, 12,-51, 12;
/M: SY='Q';  M=  7,-53,-10, 16,-37,-18, 18,-35, 10,-16, 12, 17,  0, 35,  3,  6,  8,-19, 27,-10;
/M: SY='M';  M=-23,-37, -6, 19, -8,-38,-16, 18, -6, 23, 30,-11, -7,  8,-23,-14,  7, 12,-55,-13;
/M: SY='K';  M= -2,-54,  9, 27,-31,-24,  0,-29, 33,-10,  8, 20,-31, 25, 22,-14,  2,-36,-57,-25;
/M: SY='D';  M= -1,-15, 44, 30,-42,-16,-13,-31, 23,-31,-29, 30,-17, -7, -2, 11, -2,-33,-24,-32;
/M: SY='L';  M=-19,-51,-31, -9, -9,-30,-16, 19,-24, 45, 28,-27, -4,-28,-27,-17,-28, 23,-13, -2;
/M: SY='I';  M=  1,-38, -9, 10,-13,  1,-10, 21, -4,  7, 12, -3,-33,  1, -1,  6,  4,-10,-53,  0;
/I:         E1=0; IE=-255; DE=-255;

» more

Post-processing [info]

PROMOTED_BY	PS51192; PS51193
COMPETES_HIT_WITH	PS51192(30); PS51196

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_01 which contains 572'970 sequence entries.

Total number of hits	2'750 in 2'732 different sequences
Number of true positive hits	2'750 in 2'732 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	22
Number of 'partial' sequences	1

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	99.21 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Archaea, Bacteriophages, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	2
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	N_Hulo
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	Helicase C-terminal
Version [info]	4

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences	2732 sequences 009L_FRG3G (Q6GZW6), 172L_IIV6 (O55764), A18_ECTVM (Q8JL96), » more Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits: [Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format] Retrieve the sequence logo from the alignment
UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences	22 sequences CAS3_THET8 (Q53VY2), DHX32_HUMAN (Q7L7V1), DHX32_MOUSE (Q8BZS9), » more
UniProtKB/Swiss-Prot 'Partial' sequences	1 sequence RH1_CATRO (P85441)
PDB [Detailed view]	884 PDB 1A1V; 1C4O; 1CU1; 1D2M; 1D9X; 1D9Z; 1FUK; 1FUU; 1GM5; 1HEI; 1HV8; 1JR6; » more