PROSITE entry PS51171

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS51171
Entry name [info]	PREPHENATE_DEHYDR_3
Accession [info]	PS51171
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-DEC-2005 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00671
Associated ProRule [info]	PRU00517

Name and characterization of the entry

Description [info]

Prephenate dehydratase domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=183;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=178;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8558452; R2=0.0154492; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=463; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=301; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='R';  M= -7, -8,-26, -9,  0,-22,-19, -9,-22, 29,-20, -8, -4,-16,  4, 35, -8, -8,-11,-21,-11,  0;
/M: SY='V';  M= -4,-30,-18,-34,-30,  0,-34,-30, 38,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 42,-26, -6,-30;
/M: SY='A';  M= 28,-13,-15,-20,-13,-16,  0,-20, -5,-15, -5, -6,-10,-14,-12,-20,  5, -2,  0,-22,-17,-13;
/M: SY='Y';  M=-20,-23,-27,-26,-23, 46,-30,  8,  0,-16,  3,  0,-20,-30,-19,-13,-20,-10, -7, 24, 64,-23;
/M: SY='L';  M= -9,-27,-19,-28,-19,  8,-29,-20, 17,-28, 44, 17,-27,-28,-19,-19,-25, -4,  9,-21, -1,-19;
/M: SY='G';  M= -1,-12,-29,-12,-20,-26, 60,-20,-34,-21,-22,-16, -3,-21,-20,-20, -3,-19,-26,-20,-27,-20;
/M: SY='P';  M= -8,-18,-36, -9,  0,-29,-18,-19,-20,-10,-30,-20,-16, 78, -9,-19, -4, -6,-28,-31,-29, -9;
/M: SY='K';  M=  0, -5,-25, -6, 10,-14,-17,-10,-22, 18,-18,-11, -4,-11,  2, 12, -5, -8,-15,-18, -9,  6;
/M: SY='G';  M= 10,-10,-26,-12,-18,-28, 56,-20,-34,-18,-26,-18, -2,-18,-18,-20,  2,-16,-24,-20,-28,-18;
/M: SY='T';  M=  3,  0,-10, -7, -7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13,  3,-10, -7,-10, 26, 41, -3,-33,-13, -7;
/M: SY='F';  M=-20,-26,-24,-32,-26, 59,-30, -3,  0,-22,  6,  0,-20,-30,-28,-16,-20,-10, -4, 18, 51,-26;
/M: SY='T';  M=  4, -2,  2, -7, -7,-16,-11,-16,-17,-12,-21,-16,  3,-13, -7,-12, 27, 29, -6,-37,-17, -7;
/M: SY='H';  M=-13,  3,-28,  6, 20,-25,-18, 51,-28, -2,-21, -8,  6,-12, 17,  0, -1,-12,-28,-30,  1, 16;
/M: SY='L';  M=  3,-13,-21,-14,  0,-14,-20,-12, -3, -5,  6,  2,-14,-17,  3, -7,-10, -7, -3,-22,-10,  2;
/M: SY='A';  M= 45,-12,-10,-21,-12,-18, -3,-21, -6,-11, -8, -8,-12,-12,-12,-20,  8,  0,  5,-21,-19,-12;
/M: SY='A';  M= 28,-15,-12,-22,-14,-11,-11,-21,  0,-15,  4, -2,-15,-16,-14,-19,  1,  3,  7,-22,-14,-14;
/M: SY='L';  M= -9,-13,-23,-13, -1, -9,-23, -8, -5, -3,  3,  1,-12,-20,  1,  1, -9, -6, -5,-19,  0, -1;
/M: SY='K';  M= -8,  0,-26,  0, 12,-28,-18, -5,-25, 25,-24,-10,  1,-10, 17, 19,  1, -1,-20,-24,-12, 14;
/M: SY='Y';  M=-10,-18, -8,-24,-17, 20,-24,  4, -7,-16, -2,  3,-14,-25,-11,-13,-13,-10, -8, -5, 21,-14;
/M: SY='F';  M=  5,-24,-16,-32,-23, 34,-21,-21,  2,-23,  8,  0,-19,-24,-28,-20,-11, -6,  6, -6,  8,-23;
/M: SY='D';  M=  2,  4,-24,  6,  1,-29,  2, -9,-22,  1,-20,-12, -1,-14,  5, -6,  0, -9,-16,-25,-18,  3;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='H';  M=  1, -3,-19, -8, -5, -5,-12,  5,-15,  1,-15, -8,  3,-16, -3,  2,  0, -4,-12,-15,  3, -5; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='H';  M= -5, -5,-15, -6, -7,-10,  5, 14, -9, -9, -8, -2,  0,-10, -4, -7, -4, -9, -9,-12, -2, -7; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='D';  M= -6,  6,-14,  9,  0, -7, -9, -7,-13, -6,-13,-11,  2,  2, -6, -8,  4,  4,-10,-18, -8, -3; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='G';  M= -3,  4,-16,  6,  4,-18,  9, -6,-20,  2,-17,-12,  3, -7, -1, -2,  3, -5,-15,-17,-13,  2; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='S';  M=  0,  6,-22,  9,  5,-26, -3,-10,-18, -8,-20,-15,  4,-11,  2,-12, 10, -2,-14,-31,-18,  3;
/M: SY='L';  M=  2,-21,-19,-24,-14,  6,-24,-17, 11,-18, 12,  4,-20,-22,-17,-18,-12, -6, 11,-15,  3,-16;
/M: SY='E';  M=-10, -2,-28, -1, 20,-22,-24,  1,-12,  2,-12, -7, -3, -9, 11, -3, -3, -4,-14,-26, -9, 14;
/M: SY='H';  M=-13, -4,-27, -2,  1,-11,-22,  9,-10, -5, -8, -4, -4,-18,  4, -2, -7, -8,-13,-17,  9,  0;
/M: SY='M';  M= -8, -9,-20,-10, -9, -4,-21,-14, -4, -3,  1,  3,-10,-19,-10, -5, -8, -1,  0,-23, -5, -9;
/M: SY='P';  M=  2,-18,-31,-17, -9,-18,-11,-17, -9,-13,-17,-11,-16, 34,-12,-20, -7, -9,-15,-20,-13,-14;
/M: SY='C';  M=  0,-19, 19,-25,-22,  0,-23, -9, -6,-17, -5, -1,-19,-28,-17,-19,-10, -7,  0,-13, 12,-21;
/M: SY='K';  M=  7,  6,-21,  4,  7,-25, -9, -8,-23, 11,-22,-15,  6,-11,  2,  6,  4, -3,-16,-27,-17,  4;
/M: SY='S';  M=  8,  4,-13, -2, -2,-19, -6,-11,-18, -3,-24,-16, 11,-11, -2, -6, 25, 19,-10,-34,-17, -2;
/M: SY='I';  M= -6,-27,-27,-35,-25, 12,-32,-26, 27,-26, 10,  9,-19,-10,-22,-26,-16, -9, 15,-15,  1,-26;
/M: SY='P';  M= -5, -8,-28, -4, -1,-19,-17, -8,-16, -5,-16,-11, -9, 15,  0, -6, -3, -6,-18,-22, -9, -3;
/M: SY='D';  M= -9, 27,-28, 39, 29,-35,-13, -1,-32,  3,-24,-22,  9, -7, 11, -6,  1, -9,-27,-33,-19, 20;
/M: SY='V';  M=  7,-24, 15,-29,-26, -8,-25,-28, 11,-21,  1,  1,-23,-27,-25,-23, -7, -3, 26,-31,-15,-26;
/M: SY='F';  M=-14,-30,-22,-38,-29, 40,-33,-24, 21,-29, 17,  9,-22,-27,-31,-23,-20, -9, 16, -7, 13,-29;
/M: SY='D';  M= -5, 15,-22, 16, 11,-23,-13, -5,-21,  1,-19,-16, 12,-13,  0,  0,  3,  1,-15,-32,-17,  5;
/M: SY='A';  M= 15, -3,-20, -5, 11,-26,-10, -7,-19,  2,-17,-11, -3, -9, 12,  0,  8, -2,-15,-24,-17, 11;
/M: SY='V';  M=  2,-27,-13,-28,-26,  2,-27,-23, 22,-19, 11,  8,-27,-28,-25,-19,-11, -2, 35,-22, -1,-26;
/M: SY='E';  M=-12,  6,-26, 14, 22,-24,-20, -6,-20,  6,-16,-14, -2,-12,  4,  8, -4, -8,-12,-30,-16, 12;
/M: SY='N';  M=  2, 12,-20,  7,  6,-23,-11,  6,-20, -3,-19,-13, 13,-12,  6, -6,  7,  4,-18,-30,-13,  6;
/M: SY='G';  M= -5,  3,-29,  3, -6,-31, 36,-10,-35, -6,-29,-18,  8,-17, -4, -9,  0,-15,-29,-24,-24, -5;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='Q';  M= -1, -2,-21, -4,  7,-23, -7, -7,-20,  6,-17, -9, -1,-10, 12,  5,  3,  3,-16,-21,-13,  9; D=-13;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='A';  M= 20,-12,  4,-17,-13,-14, -9,-19, -5,-13,-10, -8,-10,-16,-13,-17, 10,  3,  7,-27,-17,-13; D=-13;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='D';  M=-14, 32,-27, 40, 10,-33, -3, -2,-32, -2,-27,-23, 18,-12,  3, -8,  3, -3,-26,-35,-19,  7;
/M: SY='Y';  M=-19,-25,-25,-29,-24, 48,-30,  0,  2,-20,  9,  2,-21,-30,-23,-15,-21,-10, -4, 17, 52,-24;
/M: SY='A';  M= 31, -9,-16,-15,-12,-23, 20,-19,-20,-13,-18,-14, -5,-13,-12,-19, 10, -4,-10,-22,-23,-12;
/M: SY='V';  M= -5,-29, -2,-32,-29,  8,-31,-28, 23,-24, 12,  8,-27,-30,-29,-22,-14, -4, 33,-25, -5,-29;
/M: SY='V';  M= -1,-30,-11,-30,-29,  1,-30,-29, 29,-21, 15, 11,-30,-30,-29,-20,-12, -1, 45,-29, -9,-29;
/M: SY='P';  M= -4,-19,-37,-11, -1,-29,-18,-20,-19,-10,-28,-19,-19, 80,-10,-20, -8, -9,-27,-29,-29,-10;
/M: SY='I';  M= -8,-30,-24,-36,-28,  2,-36,-28, 40,-28, 24, 18,-24,-24,-22,-26,-20, -8, 30,-22, -2,-28;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='N';  M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='S';  M=  7, -4,-13, -8, -3,-11, -9,-11,-15,-10,-19,-13,  2,-12,  0,-10, 22, 17, -9,-29,-12, -1;
/M: SY='T';  M= -2,-15,-17,-21,-17, -6,-24,-22, 12,-19,  3,  2,-10,-17,-14,-18,  4, 15, 13,-28, -8,-17;
/M: SY='E';  M= -8, 19,-25, 26, 34,-29,-12, -1,-29,  3,-25,-22, 12, -6, 10, -4,  9, -3,-26,-35,-20, 22;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='S';  M=  9,-10,-16,-12, -6,-17,-12,-15, -8,-11,-10, -8, -7, -4, -3,-13, 10,  8, -3,-29,-16, -5;
/M: SY='V';  M= -2,-30,-14,-32,-30,  0,-32,-30, 34,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 46,-28, -8,-30;
/M: SY='N';  M= -6, 10,-18, -2,-10,-12,-13, -7, -2,-10,-10, -7, 22,-20, -8,-10,  5,  5, -6,-34,-14,-10;
/M: SY='H';  M=-14,-11,-28, -8, -2, -2,-23,  2, -8,-13,  1,  1,-13,  1, -8,-13,-15,-11,-13,-18,  2, -6;
/M: SY='T';  M=  2, -6,-10,-12,-12,-10,-18,-20, -4,-12,-10, -8, -4,-14,-12,-12, 18, 34,  8,-32,-12,-12;
/M: SY='Y';  M=-14,-24,-26,-27,-19, 16,-31, -7, 14,-20, 17, 10,-21,-26,-11,-16,-21,-10,  3, -1, 27,-17;
/M: SY='D';  M=-19, 44,-30, 62, 19,-39,-11, -1,-39,  6,-30,-28, 18,-10,  1, -5, -1,-10,-29,-38,-19, 10;
/M: SY='L';  M= -1,-17,-19,-19,-12, -1,-19,-11,  2,-13, 13,  8,-15,-21, -9,-11, -9, -3,  0,-19,  2,-11;
/M: SY='L';  M=-12,-30,-21,-33,-23, 22,-31,-21, 19,-30, 40, 16,-27,-29,-24,-21,-27,-10, 10,-14,  6,-23;
/M: SY='L';  M= -7,-12,-24,-13, -7, -6,-23,-11, -1,-11,  8,  3,-12,-20,  1, -5,-13, -9, -5,-19, -4, -4;
/M: SY='H';  M=-14,  4,-30,  7, 16,-27,-21, 27,-21,  4,-18, -6,  3,-12, 18,  2, -6,-13,-23,-27, -3, 15;
/M: SY='S';  M= -8,  0,-23,  0, -1,-12, -1, -1,-25, -7,-19,-14,  2,-15, -6, -3,  4,  2,-18,-25,-10, -4;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='Q';  M= -1, -5,-11, -6, -2,-11, -9, -5, -4,  1, -8,  2, -3, -9,  5, -1,  4,  1, -2,-17, -7,  1; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='D';  M=-13, 18,-29, 26,  9,-31,-12, -5,-30,  4,-29,-22, 10, 11,  0,  0,  0, -6,-26,-34,-20,  3;
/M: SY='I';  M= -2,-28,-20,-32,-24,  2,-30,-25, 28,-26, 28, 15,-25,-25,-21,-23,-19, -7, 23,-22, -4,-24;
/M: SY='Q';  M= -7, -8,-24, -8,  4,-13,-20,-10,-15,  4,-16, -8, -7, -3,  6, -1, -1, -1,-12,-22, -9,  5;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-24,-37,-30,  0,-37,-30, 44,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 36,-23, -3,-30;
/M: SY='V';  M= -3,-27, -5,-33,-27,  5,-31,-27, 23,-25, 13,  9,-23,-26,-25,-24,-14, -6, 24,-23, -5,-27;
/M: SY='G';  M= 20,-10,-22,-14,-16,-26, 43,-20,-28,-16,-22,-16, -4,-16,-16,-20,  4,-12,-18,-20,-26,-16;
/M: SY='E';  M=-10, 14,-29, 20, 53,-29,-18,  1,-29,  9,-21,-20,  7, -2, 18,  0,  1, -9,-30,-31,-20, 35;
/M: SY='M';  M= -9,-18,-22,-23,-11,  1,-27,-14, 13,-15, 10, 16,-16,-19, -6,-14,-12, -3,  8,-20, -2, -9;
/M: SY='T';  M= -1, -9,-18,-11, -2, -4,-22, -9, -4, -8, -6, -6,-11,-16, -8,-11,  1, 10,  1,-16,  7, -6;
/M: SY='L';  M= -9,-30,-21,-32,-23,  7,-32,-23, 27,-29, 40, 19,-28,-28,-21,-22,-26, -9, 18,-21, -1,-23;
/M: SY='P';  M=-14,  6,-32, 15,  5,-29,-17,  2,-27, -3,-26,-19, -1, 27, -3, -5, -4, -6,-26,-32,-17, -2;
/M: SY='I';  M= -2,-28,-26,-37,-28, -2,-34,-29, 41,-27, 15, 15,-20,-20,-20,-28,-15, -8, 28,-21, -3,-28;
/M: SY='H';  M= -3,  8,-19,  4, -2,-19,-13, 24,-21, -8,-19,-11, 12,-14, -1, -7,  9,  9,-17,-32, -5, -3;
/M: SY='H';  M=-17, -9,-27,-10, -4, -2,-23, 48,-18,-12, -8,  2, -1,-21,  8, -4,-12,-15,-21,-19, 14,  0;
/M: SY='C';  M= -9,  2, 22, -5, -9,-20,-15, 20,-26,-14,-24,-14, 11,-24, -6,-11,  4, -5,-20,-40,-11, -9;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-22,-32,-22,  8,-32,-22, 26,-30, 44, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 14,-20,  0,-22;
/M: SY='L';  M= -9,-29,-21,-32,-23,  6,-31,-21, 27,-27, 37, 23,-27,-27,-19,-21,-25, -9, 18,-21, -1,-22;
/M: SY='V';  M= 13,-18,-12,-20,-19,-11, -7,-23,  5,-16, -6, -3,-15,-21,-19,-18,  5,  2, 19,-29,-16,-19;
/M: SY='K';  M= -5,-10,-26,-10, -5,-16, -9,  2,-19,  4,-15, -8, -6, -7, -3,  4, -6, -9,-17,-19, -2, -6;
/M: SY='P';  M= -6, -4,-29,  1,  4,-26, -9,-14,-19, -3,-24,-16, -4, 19, -4,-10,  1, -5,-19,-30,-21, -2;
/M: SY='S';  M= -6,  0,-24,  0, -2,-20, -1, -7,-23,  3,-22,-13,  0,-14,  1, -2,  4,  3,-18,-20, -5, -1;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='T';  M= -5, -4,-16, -7,  0,-12,-17,-11,-13, -1, -8, -8, -2,-12, -2,  7,  7, 18, -7,-25,-10, -2; D=-11;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='P';  M= -7,  2,-23,  4,  7,-20,-13, -8,-14,  0,-19,-12,  2, 13, -1, -6,  0, -4,-16,-25,-15,  1; D=-11;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='I';  M=  0, -2,-13, -9, -9, -5,-12, -9,  4,-11,  4,  0,  3,-14, -8,-10, -3,  2, -1,-19, -7, -9; D=-11;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='A';  M= 10,  3,-20,  0,  1,-21, -2,-11,-18, -3,-14,-12,  3,-13, -4, -9,  3, -4,-13,-27,-17, -2;
/M: SY='K';  M=-10, 13,-25, 16, 13,-27,-14, -5,-28, 18,-26,-17, 10,-11,  5, 13,  3, -1,-21,-30,-15,  9;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-22,-35,-28,  2,-35,-28, 38,-27, 23, 17,-25,-25,-23,-25,-19, -7, 31,-23, -3,-28;
/M: SY='E';  M=-10,  9,-27, 10, 15,-28, -8, -4,-28, 13,-24,-15,  7,-11, 11, 10,  0, -4,-24,-27,-16, 12;
/M: SY='K';  M= -8,  3,-21, -3, -1,-19,-18,  0,-21, 14,-20,-10,  7,-13,  1, 13,  4, 13,-14,-27, -8, -1;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-22,-35,-28,  2,-35,-28, 39,-27, 23, 17,-25,-25,-23,-25,-19, -7, 32,-23, -3,-28;
/M: SY='Y';  M= -5,-17,-26,-20,-17, 12,-24, 15,  0,-12, -2,  0,-15,-24, -9,-13,-13, -9, -6,  9, 46,-17;
/M: SY='S';  M= 13, -1,-10, -3, -2,-19, -2,-12,-18,-10,-26,-18,  7,-10, -2,-11, 35, 21, -8,-37,-19, -2;
/M: SY='H';  M=-20, -3,-29, -4, -3,-11,-21, 89,-27,-12,-17,  0,  7,-21,  5, -2,-11,-19,-27,-26, 21, -3;
/M: SY='P';  M= -2,-16,-32,-13, -4,-24,-18,-19,-12, -7,-22,-13,-14, 47, -8,-16, -4, -6,-17,-28,-23,-10;
/M: SY='Q';  M= -9, -8,-25, -9,  5,-27,-22, 11, -8,  0,-11,  7, -7,-16, 32,  1, -5, -9,-11,-23, -6, 18;
/M: SY='A';  M= 23,-13,-18,-16,-10,-21,  0,-20,-12,-12,-16,-12,-11,  8,-12,-19,  6, -2, -5,-25,-22,-12;
/M: SY='F';  M= -8,-28,-24,-32,-23, 23,-27,-18, 10,-25, 21,  7,-25,-27,-22,-20,-23,-11,  3,  9, 16,-22;
/M: SY='A';  M= 26, -7,-18,-13, -3,-26,  1,-13,-17,  0,-16, -9, -6,-11,  5, -8,  5, -5,-11,-20,-18,  1;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='C';  M= -6,-21, 69,-28,-28,-13,-29,-29,-10,-25,-10,-10,-21,-34,-28,-25, -7, -1,  9,-42,-22,-28;
/M: SY='R';  M=-12, -4,-26, -3,  7,-22,-16,  8,-28, 17,-23,-12,  3,-15,  9, 35,  1, -5,-20,-26,-10,  5;
/M: SY='K';  M= -8, 10,-10,  3,  3,-26,-13, -4,-25, 18,-28,-14, 17,-16,  7,  9,  1, -4,-22,-31,-16,  5;
/M: SY='W';  M=-20,-31,-35,-34,-27, 38,-26,-12, -8,-20, -5, -8,-28,-30,-23,-17,-28,-18,-15, 70, 45,-23;
/M: SY='L';  M=-10,-29,-22,-32,-22,  7,-31,-20, 27,-28, 40, 24,-27,-27,-18,-21,-27,-10, 14,-20,  0,-21;
/M: SY='R';  M=  0,  6,-23,  5,  6,-24,-11,  5,-25,  8,-22,-14,  8,-13,  4, 11,  4, -5,-19,-28,-13,  4;
/M: SY='R';  M=  3, -7,-21, -9,  2,-18,-15,-11,-17,  9,-12, -8, -5,-13,  0, 11,  1,  1,-10,-24,-13,  0;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='H';  M=-10,  4,-18,  1,  0,-14,-12, 37,-18,  0,-15, -4,  9,-12,  4,  2, -2, -4,-17,-21,  4,  0; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='F';  M=-15,-24,-22,-28,-22, 37,-28, -8,  9,-21, 14,  6,-20,-26,-22,-16,-20, -9,  2,  6, 33,-22; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='P';  M=-11,-18,-39, -9,  0,-29,-20, -8,-21,-10,-29,-18,-17, 79, -8,-18,-10,-11,-30,-30,-25, -9;
/M: SY='N';  M= -1, 12,-22,  9,  3,-27,  1,  7,-24, -4,-25,-14, 17,-14, 10, -5, 10, -3,-23,-31,-15,  6;
/M: SY='W';  M=  8,-27,-22,-30,-24, -3,-18,-27,  3,-17, -5, -5,-27,-24,-21,-20,-14, -9, 10, 29,  0,-21;
/M: SY='K';  M=-11,  7,-28, 11, 12,-28,-18, -6,-23, 14,-21, -8,  0,  1,  8,  4, -4, -4,-20,-27,-14,  9;
/M: SY='Y';  M=-11,-26,-21,-28,-23, 15,-30,-13, 14,-17, 14,  8,-23,-28,-20,-10,-18, -7, 15, -9, 16,-23;
/M: SY='E';  M= -8,-10,-25, -9,  8,-15,-23,-13, -3, -1, -5, -3, -9,-14, -1, -1, -5, -5, -2,-26,-11,  2;
/M: SY='Y';  M=  1, -6,-24,-10, -3,-10,-15, -5, -9, -5,-13, -9, -2, -7, -4, -5, -1, -4,-11,-16,  2, -6;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='A';  M= 14,-14,  3,-21,-18,-11,-18,-24,  0,-15, -5, -5,-14,-19,-18,-18,  5, 14, 14,-29,-15,-18;
/M: SY='E';  M= -5, 10,-20, 11, 16,-19,-12, -2,-22, -2,-22,-18,  9,-10,  3, -6, 14,  7,-18,-29, -9,  9;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='T';  M= -3, 12,-13, -1, -7,-13,-14,-11,-13, -7,-16,-13, 18,-13, -7, -7, 17, 35, -9,-33,-13, -7;
/M: SY='A';  M= 23, -6,-14,-10, -8,-22, 15,-16,-20,-12,-22,-16,  0,-12, -8,-16, 20,  4,-10,-28,-22, -8;
/M: SY='E';  M= 12,  8,-22, 10, 15,-28,-10,-10,-24,  8,-20,-16,  0, -8,  2, -4,  2, -6,-16,-26,-18,  9;
/M: SY='A';  M= 41, -9,-12,-17,-10,-21,  7,-19,-14,-11,-14,-12, -7,-11,-10,-19, 12,  0, -4,-22,-21,-10;
/M: SY='A';  M= 22,-18, -2,-26,-19,-12,-15,-22,  6,-16, -1,  3,-17,-19,-16,-21, -2, -3, 14,-25,-15,-18;
/M: SY='E';  M=-11,  6,-29,  7, 24,-30,-18,  0,-27, 23,-24,-12,  6, -9, 23, 18, -3, -9,-26,-25,-14, 23;
/M: SY='M';  M=-14,-15,-27,-20, -9,  1,-26,  3, -2, -5, -3,  8, -9,-19,  3,  1,-13,-11, -6,-15,  5, -4;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='V';  M=  4,-25,-10,-27,-26, -3,-26,-28, 22,-18,  6,  6,-25,-26,-26,-19, -5,  5, 40,-29,-11,-26;
/M: SY='A';  M= 29, -9,-15,-15, -6,-19, -7,-17,-12,  0,-11, -8, -8,-12, -6, -9,  6, -1, -4,-22,-16, -6;
/M: SY='D';  M=-11, 22,-27, 29, 27,-32,-13,  0,-30,  9,-26,-20, 13, -8, 12,  0,  4, -6,-27,-33,-18, 20;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='H';  M= -1, -2,  1, -2,  3,-14, -9, 14,-16, -6,-12, -7,  0,-10,  0, -6,  2, -4,-12,-21, -5,  1; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='P';  M= -7,  6,-19,  7,  4,-18, -9, -5,-16,  8,-19,-11,  5, 13,  0,  1, -3, -5,-17,-19,-12,  1; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='D';  M=-10, 25,-27, 33, 17,-32,  5, -4,-34, -3,-28,-24, 15,-11,  0, -9,  5, -8,-28,-34,-22,  8;
/M: SY='L';  M=-10,-11,-27,-13, -1, -8,-23,-15, -2,-14,  4, -3,-10, -9, -8,-14,-13, -5, -9, -9, -7, -5;
/M: SY='T';  M= -3, -1,-20, -8, -8,-14,-16, -2,-10, -7,-10, -7,  4, -8, -7, -4,  1,  7, -8,-29,-11, -9;
/M: SY='I';  M= -5, -7,-23, -7,-11,-13,-23, -7,  7,-17,  1,  1, -7,-18,-11,-18, -7, -6,  5,-28, -7,-13;
/M: SY='A';  M= 29,-12,-17,-18,-14,-20, 18,-20,-16,-15,-10,-10, -9,-15,-14,-20,  3, -7, -8,-20,-21,-14;
/M: SY='A';  M= 45,-12,-10,-21,-12,-18, -3,-21, -6,-11, -8, -8,-12,-12,-12,-20,  8,  0,  5,-21,-19,-12;
/M: SY='I';  M= -1,-28,-20,-33,-26,  0,-31,-27, 32,-25, 20, 14,-24,-24,-22,-24,-16, -6, 28,-23, -5,-26;
/M: SY='A';  M= 30, -9,-16,-16,-13,-22, 20,-20,-19,-13,-16,-13, -6,-13,-13,-19,  8, -2, -9,-21,-22,-13;
/M: SY='N';  M=  1, 10,-18,  4, -2,-22,  5, -6,-22, -8,-30,-20, 22, -4, -3, -9, 21,  7,-20,-37,-22, -3;
/M: SY='E';  M= -8, 12,-27, 22, 29,-30,-14, -5,-29,  6,-26,-21,  4,  3,  8, -3,  6, -4,-25,-33,-20, 18;
/M: SY='M';  M= -2,-12,-19,-15, -6, -7,-19, -8, -2, -7,  0,  8,-11,-18, -4, -4, -3,  1,  0,-21, -1, -6;
/M: SY='A';  M= 33,-10,-14,-17,-11,-15,  3,-14,-13,-11,-13,-11, -8,-13,-10,-18,  9, -1, -5,-16, -9,-11;
/M: SY='A';  M= 40,-10,-14,-18,-12,-22, 15,-20,-16,-12,-14,-12, -8,-12,-12,-20,  8, -4, -6,-20,-22,-12;
/M: SY='E';  M= -2,  1,-24,  2, 21,-23,-17, -2,-21,  6,-18,-11, -2, -9, 17,  0,  4, -1,-20,-22, -7, 18;
/M: SY='L';  M=-10,-18,-20,-21,-14, -1,-25, -4,  4,-16, 22, 13,-16,-23,-10, -7,-15,  1,  1,-23, -1,-13;
/M: SY='Y';  M=-19,-14,-30,-17,-18, 22,-24, 18, -7,-12, -6, -4, -9,-28,-11,-10,-17,-12,-15, 25, 52,-17;
/M: SY='G';  M= -8,  6,-29,  7,  3,-29, 18,  0,-34,  4,-28,-17,  9,-15, -2, -2, -2,-14,-28,-26,-18,  0;
/M: SY='L';  M= -4,-28,-19,-29,-19,  7,-27,-20, 17,-28, 44, 17,-28,-28,-19,-20,-26, -9,  9,-20, -2,-19;
/M: SY='E';  M= -3,  4,-25,  4, 20,-22,-15, -1,-22, 12,-21,-13,  3,-10, 12,  3,  2, -5,-21,-22, -7, 15;
/M: SY='I';  M= -3,-23,-24,-29,-21, -7,-30,-24, 24,-12,  6,  9,-17,-20,-15,-11,-13, -7, 21,-22, -6,-21;
/M: SY='L';  M= -8,-30,-20,-32,-24,  6,-32,-24, 29,-28, 35, 18,-28,-28,-22,-22,-24, -8, 23,-22, -2,-24;
/M: SY='A';  M= 20, -1,-18, -2,  7,-23,-10,-14,-15,  0,-14,-12, -6,-10, -3,-10,  3, -4, -6,-25,-18,  2;
/M: SY='R';  M=-16,  9,-30, 15, 18,-28,-18,  8,-32, 20,-24,-15,  5,-12, 10, 24, -6,-11,-25,-27,-11, 12;
/M: SY='N';  M= -9, 23,-24, 18,  1,-24, -1, -2,-21, -1,-26,-18, 28,-16, -3, -5,  5, -4,-22,-34,-18, -1;
/M: SY='I';  M= -8,-26,-26,-33,-22, -3,-36,-27, 39,-24, 14, 14,-20,-20,-18,-25,-16, -8, 29,-23, -4,-24;
/M: SY='Q';  M=  5,  1,-21, -1, 13,-26,-13, -4,-15,  0,-18, -9,  3,-11, 17, -4,  7, -3,-14,-27,-16, 15;
/M: SY='D';  M=-18, 48,-28, 60, 16,-36, -8,  2,-36,  0,-30,-28, 28,-12,  0, -8,  2, -8,-30,-40,-20,  8;
/M: SY='K';  M=-10,-10,-25, -9,  0,-10,-22, -3,-11,  8, -9, -4, -9,-18,  3,  8, -8, -6, -9,-13,  8,  0;
/M: SY='R';  M= -6,-11,-26,-11, -4,-20, -9,-10,-22, 10,-16,-10, -5, -7, -1, 24, -5, -7,-16,-23,-15, -5;
/M: SY='N';  M= -8, 16,-25, 14, -3,-27, 14, -5,-25, -7,-25,-17, 20,-18, -4, -9,  2, -9,-22,-31,-21, -3;
/M: SY='N';  M=  2, 30,-18, 12, -2,-20,  0,  4,-18, -2,-26,-18, 46,-18, -2, -4, 10,  0,-24,-36,-20, -2;
/M: SY='R';  M=-10,-11,-22,-15, -9,  0,-20, -1,-11, -2,-12, -6, -3,-18, -6,  7,  0,  1, -8,-21,  0, -9;
/M: SY='T';  M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='R';  M=-19, -9,-30, -9,  2,-22,-20,  1,-29, 28,-20, -9,  0,-19, 16, 63, -9,-10,-21,-20,-10,  5;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='I';  M= -7,-31,-21,-33,-27,  4,-31,-27, 27,-25, 21, 12,-29,-28,-24,-22,-21, -8, 26, -8, -1,-26;
/M: SY='I';  M= -1,-28,-19,-32,-25,  1,-30,-26, 30,-25, 23, 14,-25,-25,-22,-23,-17, -6, 27,-23, -5,-25;
/M: SY='L';  M= -8,-30,-21,-33,-25,  5,-33,-25, 31,-28, 33, 18,-27,-27,-22,-23,-23, -8, 24,-22, -2,-25;
/M: SY='G';  M= 14, -7,-22,-10, -8,-27, 23,-15,-26, -6,-23,-14, -2,-14, -4,-11,  6, -8,-18,-22,-22, -6;
/M: SY='R';  M= -5, -6,-27, -6,  4,-26,-16, -7,-25, 21,-24,-11, -2, -2, 11, 25, -2, -6,-19,-23,-14,  6;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_01 which contains 572'970 sequence entries.

Total number of hits	48 in 48 different sequences
Number of true positive hits	48 in 48 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Archaea, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	PS_Langendijk_Genevaux
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	Prephenate dehydratase
Version [info]	3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

48 sequences

AROD1_ARATH (Q9SA96), AROD1_PETHY (D3U715), AROD2_ARATH (Q9SSE7),

AROD2_PETHY (D3U716), AROD3_ARATH (Q9ZUY3), AROD3_PETHY (D3U717), 
AROD4_ARATH (O22241), AROD5_ARATH (Q9FNJ8), AROD6_ARATH (Q9SGD6), 
CMPDT_AQUAE (O67085), CMPDT_BUCAI (P57472), CMPDT_BUCAP (Q8K9F8), 
CMPDT_BUCBP (Q89AE5), CMPDT_ECO57 (P0A9J9), CMPDT_ECOLI (P0A9J8), 
CMPDT_ENTAG (Q02286), CMPDT_HAEIN (P43900), CMPDT_NEIG1 (Q9ZHY3), 
CMPDT_PSEAE (Q9HZ67), CMPDT_SHIFL (P0A9K0), CMPDT_STUST (P27603), 
GQQA_KOMEU  (A0A0M0ELU2), PHA2_SCHPO  (O14361), PHA2_YEAST  (P32452), 
PHEA_AMYME  (Q44104), PHEA_BACSU  (P21203), PHEA_CORGL  (P10341), 
PHEA_LACLA  (Q9CEU2), PHEA_LACLM  (P43909), PHEA_METJA  (Q58054), 
PHEA_MYCA1  (A0Q994), PHEA_MYCA9  (B1MEG8), PHEA_MYCBO  (Q7TVJ6), 
PHEA_MYCBP  (A1KQH3), PHEA_MYCGI  (A4T6G3), PHEA_MYCLB  (B8ZTU2), 
PHEA_MYCLE  (Q9CDC4), PHEA_MYCMM  (B2HMM5), PHEA_MYCPA  (Q745J2), 
PHEA_MYCS2  (A0R643), PHEA_MYCSJ  (A3Q7Q1), PHEA_MYCSK  (A1UNA3), 
PHEA_MYCSS  (Q1B1U6), PHEA_MYCTA  (A5U9G7), PHEA_MYCTO  (P9WIC2), 
PHEA_MYCTU  (P9WIC3), PHEA_MYCUA  (A0PX17), PHEA_MYCVP  (A1TGX7)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

2 PDB

7ALZ; 7AM0