PROSITE entry PS51015

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS51015
Entry name [info]	YDG
Accession [info]	PS51015
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-AUG-2004 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51015
Associated ProRule [info]	PRU00358

Name and characterization of the entry

Description [info]

YDG domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=147;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=142;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1414716; R2=0.0189142; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=10556.7597656; R2=4.7188840; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=337; H_SCORE=12147; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=231; H_SCORE=11647; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='G';  M= -3,-17,-24,-19,-23,-10, 32,-20,-17,-20,-13, -4,-10,-23,-22,-19, -6,-14, -8,-19,-17,-22;
/M: SY='N';  M= -7,  1,-25, -1,  2,-14, -6, -7,-23, -1,-21,-15,  6, -4, -4,  4,  1, -4,-21,-25,-15, -2;
/M: SY='V';  M= -3,-11,-20,-16,-16,-10,-21, -7,  9,-15, -3,  1, -5,-12,-15,-15, -7, -5, 10,-29,-10,-17;
/M: SY='P';  M= -4, -3,-31,  0,  4,-30,-15,-10,-20, -4,-25,-15, -3, 37,  5,-11, -2, -5,-25,-29,-22,  2;
/M: SY='G';  M= -5,  0,-31,  4,-11,-32, 47,-16,-38,-15,-30,-22,  2, -7,-15,-18, -1,-17,-30,-25,-28,-14;
/M: SY='I';  M= -8,-24,-21,-28,-23, -3,-30,-11, 24,-18, 11, 16,-20,-24,-16,-13,-15, -7, 24,-25, -2,-22;
/M: SY='E';  M= -4, -7,-24, -6,  3,-18,-12,-13,-15,  0, -7, -7, -8, -9, -4, -2, -6, -3,-11,-25,-14, -1;
/M: SY='V';  M=  1,-25,-16,-24,-21, -8,-25,-26, 15,-12, -1,  2,-25, -8,-22,-16, -8, -2, 28,-28,-14,-22;
/M: SY='G';  M= -1, -4,-28, -7,-17,-28, 56,-17,-36,-17,-28,-19,  6,-19,-17,-17,  2,-13,-28,-23,-28,-17;
/M: SY='D';  M= -5, 10,-24, 16, 12,-25,-15,  0,-17, -3,-15, -6,  1,-12,  5, -8, -1, -7,-13,-31,-14,  8;
/M:         M= -4,-10,-25,-14, -8,-13,-17,-14, -4, -8,-12, -4, -4, -8, -6, -9, -1, -1, -7,-10, -9, -8;
/M: SY='W';  M=-18,-30,-33,-34,-24, 30,-26,-18, -5,-21, -1, -4,-26,-27,-18,-17,-26,-17,-12, 54, 26,-18;
/M: SY='E';  M=-11, -6,-14, -7,  5, -8,-19,  0,-18, -6,-16,-11, -2, -6,  0, -4, -2, -7,-17,-25, -8,  2;
/M: SY='Y';  M= -9,  0,-21, -4, -8,  3,-14, -1,-12, -8,-12,-10,  6,-21, -8, -4,  3,  0,-13,-17,  9, -9;
/M: SY='R';  M=-16, -7,-28, -8,  2,-22,-20, -1,-27, 25,-20, -9,  0,-17, 13, 54, -6, -4,-19,-21,-10,  4;
/M: SY='V';  M= -3,-20,-21,-22,-14, -5,-23,-17,  5, -6,  0,  7,-18,-11,-10, -6,-11, -6,  9,-21, -8,-13;
/M: SY='E';  M=  0, -1,-27,  4, 32,-27,-18, -5,-21,  2,-14,-13, -6,  4, 15, -5, -2, -8,-22,-26,-18, 23;
/M: SY='L';  M=  1,-23,  9,-29,-21,  3,-24,-20,  4,-24, 17,  9,-23,-27,-20,-21,-16, -8,  6,-24, -8,-20;
/M: SY='C';  M=-10,-14, 12,-18,-15,-13,-23, -8,-11, -9, -8, -6, -7,-26,-11,  2, -6, -6, -4,-32,-12,-15;
/M:         M= -8,-11, -9,-12, -2, -9,-24,-12, -6, -8, -5, -3,-12,-20, -1, -6, -8, -8, -2,-24, -9, -2;
/M: SY='W';  M=  1,-23,-23,-25,-18, -6,-21,-10,  3,-16,  0,  0,-21,-23,-12,-16,-14,-10,  6,  8,  0,-15;
/M: SY='G';  M=  4, -9,-27,-11,-18,-27, 56,-20,-35,-18,-27,-18, -1,-18,-18,-19,  3,-12,-25,-21,-27,-18;
/M: SY='V';  M=  3,-26,-18,-27,-20,  1,-24,-24, 15,-22, 16,  7,-25,-14,-21,-21,-14, -5, 17,-23, -8,-21;
/M: SY='H';  M=-17, -5,-27, -5, -5,-17,-22, 78,-20,-12,-15,  2,  3,-22,  3, -3,-10,-17,-16,-30, 15, -5;
/M: SY='R';  M=-11,-13,-26,-16,-11, -6,  1,-10,-16, -5, -5, -2, -6,-22, -6,  6,-11,-12,-14,-17, -8, -9;
/M: SY='P';  M=  1,-13,-31, -9,  1,-30,-11, -8,-20, -6,-24,-13,-12, 40,  5,-13, -4, -9,-25,-26,-22,  0;
/M: SY='H';  M=-11,-13,-24,-15,-11, -3,-23, 18, -9,-16, -7, -2, -8, -9, -9,-12, -7, -2, -9,-17,  4,-12;
/M: SY='Q';  M= -6,-12,-21,-13, -3,-19,-21, -7, -3,  1, -7,  7,-10,-18, 13,  3, -4, -5,  0,-24, -9,  5;
/M: SY='A';  M= 29, -7,-13,-13, -8,-20,  0,-15,-11, -9,-15,-10, -4,-13, -5,-15, 12,  2, -3,-25,-19, -6;
/M: SY='G';  M= -1,-11,-11,-12,-21,-29, 58,-21,-39,-21,-29,-20, -2,-22,-21,-21, -1,-19,-28,-24,-30,-21;
/M: SY='I';  M= -9,-28,-26,-36,-28,  6,-35,-28, 38,-28, 14, 14,-19,-21,-21,-27,-15, -7, 26,-19,  1,-28;
/M: SY='D';  M=  0, 11,-11, 14, -2,-25, -4, -6,-24,-11,-17,-16,  2,-15, -8,-15,  2, -2,-16,-32,-17, -5;
/M: SY='G';  M= -2,-11,-20,-13,-16,-15, 23, -1,-27,-11,-20,-12, -5,-21,-13,-13, -5,-15,-21,-12,  0,-16;
/M: SY='M';  M= -7, -7,-24,-13, -9,-17, -5, -8, -5, -8, -7,  5, -1,-17,  4, -6, -3, -5, -9,-24,-12, -3;
/M: SY='E';  M= -3, -1,-25, -2,  4,-21, -9, -9,-19,  4,-22,-13,  3, -2, -1, -3,  4, -1,-17,-25,-13,  1;
/M: SY='N';  M= -1,  4,-21,  0, -3,-16,-14, -6, -9, -6,-10, -5,  6,-16,  0, -8,  2,  0,-10,-26, -9, -3;
/M: SY='E';  M=-11, -1,-28,  4,  9,-14,-12, -4,-19, -4,-12,-12, -6, -5, -3, -8, -7, -6,-19,-17,  0,  2;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='A';  M=  3,  3,-10,  2, -1,-10, -6, -4,-10,  1, -9, -7,  2, -7, -2,  0,  2,  1, -7,-12, -4, -2; D=-14;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='G';  M=  6, -8,-26,-10,-15,-28, 48,-18,-34,-11,-27,-18, -1,-17,-15,-14,  2,-14,-24,-21,-26,-15;
/M: SY='A';  M= 20,  0,-15, -3,  2,-21, -8,-14,-17, -4,-17,-14, -1, -9, -4,-11, 14, 10, -8,-28,-18, -1;
/M: SY='Y';  M=-13, -6,-13, -5, -3, -4,-24,  5,-13, -8,-10, -6, -8,-21,  1, -8, -8, -6,-11,-14, 11, -2;
/M: SY='S';  M=  8,  0,-15, -4, -2,-18, -3,-12,-14,-10,-21,-15,  7,-12, -4,-12, 23, 13, -8,-34,-18, -3;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='A';  M= 20, -7, -8,-13, -8, -9, -5,-13,  1, -8, -3, -3, -6, -7, -7,-12,  3,  2,  3,-12, -9, -8; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='T';  M=  0, -9, -8,-13,-12, -4,-15,-15,  7,-10,  0,  0, -8,-12,-11,-10,  4, 13, 13,-19, -6,-12; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='S';  M=  4, -5, -7, -5, -5, -9, -5, -9, -3, -8,-12, -7,  0, -9, -4, -8, 16,  9,  2,-23,-10, -5; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='I';  M= -5,-20,-21,-27,-23, -3,-29,-23, 29,-23,  9,  9,-12,-22,-18,-22, -9, -3, 24,-26, -6,-23;
/M: SY='V';  M=  9,-23,-12,-25,-24, -7,-13,-26, 14,-18,  0,  2,-21,-25,-24,-19, -3, -1, 30,-28,-14,-24;
/M: SY='V';  M=  5,-18,-15,-22,-17, -6,-20,-21, 11,-18,  6,  5,-15,-20,-15,-18,  0,  6, 15,-27,-10,-17;
/M: SY='S';  M=  9, -2,-13, -2,  1,-16, -4, -8,-18, -9,-26,-18,  6,-11,  0,-10, 31, 15,-11,-32,-12,  0;
/M: SY='G';  M=  2,-13,-26,-14,-20,-20, 44,-17,-26,-18,-21,-14, -6,-21,-19,-19, -2,-15,-17,-16,-16,-20;
/M: SY='G';  M=  0, -7,-27, -9,-12,-23, 32, -9,-29,-10,-23,-14,  0,-19, -5, -9, -1,-14,-24,-16,-13, -9;
/M: SY='Y';  M=-16,-13,-28,-13,-15, 14,-16,  8,-11, -7, -9, -6,-11,-25, -9, -3,-11, -8,-14,  9, 43,-15;
/M: SY='E';  M= -9,  3,-27,  6, 18,-23,-18,  5,-25, 12,-23,-14,  0, -2,  7,  4,  0, -3,-22,-25, -7, 11;
/M: SY='D';  M=-14, 30,-27, 44,  9,-32, -2, -5,-32, -6,-22,-23, 12,-13, -4,-12,  1, -8,-24,-36,-19,  2;
/M: SY='D';  M=-10, 25,-27, 31, 13,-29,-13,  2,-25, -1,-21,-19, 14,-12,  1, -4, -1, -8,-21,-33,-16,  6;
/M: SY='E';  M= -7,  0,-25,  1, 20,-19,-19, -6,-16,  5, -7, -9, -2,-12,  5,  4, -6, -8,-15,-27,-14, 12;
/M: SY='D';  M=-14, 32,-27, 43, 10,-29, -2, -2,-33, -4,-27,-24, 17,-13, -1,-10,  3, -8,-27,-34,-18,  5;
/M: SY='H';  M= -6,  6,-24,  2,  1,-17,-14, 16,-18,  1,-19,-10, 11,-16,  1,  1,  1, -4,-18,-25, -2, -1;
/M: SY='G';  M=  1,-10,-26,-12,-16,-21, 30,-18,-20,-18,-18,-12, -2,-13,-15,-19,  1,-11,-17,-24,-22,-16;
/M: SY='D';  M=-14, 30,-28, 43, 24,-34, -8, -4,-34,  0,-25,-25, 11, -8,  2, -8,  2, -4,-27,-35,-20, 13;
/M: SY='V';  M= -6,-19,-22,-17, -6, -7,-23,-21,  1,-12, -6, -6,-21,-21,-14,-14, -9, -5, 10,  3, -5, -9;
/M: SY='L';  M=-12,-29,-21,-34,-24, 25,-31,-21, 19,-28, 33, 17,-26,-28,-24,-21,-25,-10, 12,-13,  7,-24;
/M: SY='I';  M= -7,-26,-22,-31,-24,  2,-30,-26, 21,-24, 16,  9,-24,-24,-21,-21,-16,  0, 19, -6, -1,-23;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='T';  M=  3, -1, -3, -8, -8,-14,-14,-17,-15,-11,-17,-14,  2,-12, -8,-11, 25, 36, -4,-35,-15, -8;
/M: SY='G';  M=  5,-10,-28,-11,-19,-29, 63,-20,-37,-19,-28,-19, -1,-19,-19,-20,  1,-18,-27,-20,-29,-19;
/M: SY='Q';  M= -5,  4,-24,  5, 11,-29,-13, 12,-24,  3,-22,-10,  5,-12, 21,  7,  6, -4,-22,-28,-10, 15;
/M: SY='G';  M= -4,-10,-29,-11,-14,-26, 42,-15,-33, -6,-25,-11, -2,-19,-12, -3, -4,-17,-24,-20,-23,-14;
/M: SY='G';  M=  2, -7,-24, -8,-15,-26, 47,-18,-33,-17,-28,-19,  2,-17,-15,-17, 11, -5,-23,-25,-26,-15;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='R';  M= -9, -3,-16, -5, -5, -5,-13,  4, -8,  5, -9, -4,  1,-14, -1, 12, -5, -5, -6,-10,  5, -5; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='B';  M=-12, 23,-24, 23, 13,-26,-11,  3,-24,  5,-21,-15, 21,-12, 10,  3,  0, -6,-25,-30,-15, 11; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='S';  M= -2,  2,-21,  1,  0,-22, -5, -8,-22,  4,-24,-15,  7,  1, -1,  4,  8,  2,-17,-28,-17, -2; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='R';  M= -2, -5,-22, -6, -2,-13,-12,  0,-17,  3,-11, -8, -4,-15, -1,  9, -4, -4,-13,-15,  0, -4; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='N';  M= -4,  6,-16,  3,  1,-16, -3, -5,-13, -2,-16,-10, 10,-10,  1, -4,  7,  4,-12,-23,-12,  1; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='G';  M=  1, -2,-19, -6, -5,-17,  4,  0,-19,  1,-15, -8,  2,-13, -4, -3, -1, -3,-14,-19,-10, -5; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='K';  M= -7,  1,-22,  0,  9,-14,-15,  5,-19, 14,-16, -9,  2,-11,  5, 12, -5, -7,-17,-14,  2,  6; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='Q';  M=  5,  3,-25,  5, 16,-32,-14, -4,-22,  6,-20,-11, -2, -3, 22, -2,  1, -7,-21,-24,-16, 19;
/M: SY='P';  M= -2,-18,-17,-18,-12,-17,-20,-20, -2,-12,-13, -7,-13, 11,-12,-12, -1, -2, -1,-30,-17,-14;
/M: SY='E';  M=  0, -3,-23, -2,  8,-17,-16, -9,-18,  8,-14, -9, -3,-12,  5,  1,  0, -5,-14,-23,-11,  7;
/M: SY='D';  M=-16, 39,-28, 48, 19,-33, -9,  1,-33,  1,-29,-26, 25, -6,  2, -7,  2, -8,-30,-38,-21, 10;
/M: SY='Q';  M= -9, -3,-31, -2, 13,-38, -9,  3,-22,  4,-22, -5, -2, -1, 43,  3, -1,-11,-30,-21,-15, 27;
/M: SY='K';  M= -7, -6,-24, -6,  2,-23,-20,-12,-18, 26,-19, -6, -4,-14,  4, 17, -5, -3, -9,-23,-10,  3;
/M: SY='L';  M=-12,-28,-23,-30,-20,  9,-31,-19, 18,-23, 33, 15,-24,-27,-18,-11,-25,-10,  9,-18,  1,-20;
/M: SY='E';  M= -8, -1,-24,  4, 18,-15,-21, -6,-11, -3,-12,-11, -6,-12,  1, -8,  0, -2, -8,-24, -4,  8;
/M: SY='R';  M=-13, 11,-27, 12,  0,-26,  2, -4,-31,  9,-26,-18, 14,-17,  0, 19, -1, -7,-25,-28,-17, -2;
/M: SY='G';  M=  6, -8,-23,-11,-15,-24, 40,-17,-28,-16,-23,-13, -1,-17,-14,-17,  7, -6,-19,-24,-24,-15;
/M: SY='N';  M= -7, 23,-18,  8, -6,-17,  0,  0,-14, -5,-23,-15, 38,-20, -6, -5,  8,  4,-17,-36,-18, -6;
/M: SY='L';  M= -9,-19,-22,-21,-15,  3,-24,-10,  4,-14, 22,  8,-16,-26,-12, -3,-20, -9, -1,-15,  5,-15;
/M: SY='A';  M= 34, -9,-14,-16, -8,-21,  1,-16,-15, -6,-14,-12, -6,-12, -7, -8, 10,  0, -5,-22,-19, -8;
/M: SY='L';  M= -5,-28,-20,-30,-20,  6,-28,-20, 21,-27, 40, 20,-27,-27,-18,-21,-25, -9, 12,-20, -2,-20;
/M: SY='E';  M=  3,  0,-25,  2, 25,-25,-16, -9,-22, 13,-15,-12, -4, -7,  8,  2, -3, -8,-18,-24,-16, 17;
/M: SY='R';  M=-11, -2,-24, -6, -4,-16,-19, -4,-12, 12,-11, -5,  5,-18, -1, 14, -8, -5,-10,-26, -9, -4;
/M: SY='C';  M=  7, -4, 21, -9, -9,-19, -9,-16,-21,-14,-24,-18,  3,-18, -9,-15, 21, 12, -9,-40,-22, -9;
/M: SY='M';  M=-11,-22, -3,-27,-20, -5,-25,-13,  1,-17,  3,  7,-18,-25,-13,-11,-16,-11, -1, -6, -3,-17;
/M: SY='R';  M=-16,  4,-30,  8, 10,-23,-19, 14,-29, 21,-23,-12,  3,-14,  8, 23, -8,-12,-23,-21, -1,  7;
/M: SY='K';  M= -7, -4,-24, -3,  6,-14,-21, -7,-16,  9, -9, -7, -6,-14,  1,  7, -6,  0,-13,-19, -2,  2;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='G';  M= -5, -2,-30, -3, -6,-29, 25,-12,-32,  1,-29,-17,  5, -4, -5, -5, -2,-13,-28,-24,-23, -6;
/M: SY='T';  M= -8,  4,-19, -1, -7,-10,-19,-11, -7, -8, -6, -7,  4,-17, -9, -9,  2, 14, -5,-26, -5, -9;
/M: SY='P';  M= -7,-12,-34, -4,  8,-29,-12,-16,-23, -8,-28,-20,-12, 57, -5,-16, -2, -7,-28,-31,-27, -2;
/M: SY='V';  M= -4,-30,-14,-32,-29, 10,-31,-28, 28,-23, 13, 10,-28,-29,-30,-21,-13, -3, 40,-24, -4,-29;
/M: SY='R';  M=-19, -9,-30, -9,  1,-21,-20, -1,-30, 32,-21,-10,  0,-19, 10, 65,-10,-10,-20,-20,-10,  1;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='I';  M= -7,-26, -4,-33,-27, -2,-34,-28, 27,-26, 13, 10,-21,-25,-22,-25,-14, -2, 24,-27, -7,-27;
/M: SY='R';  M=-20, -8,-30, -8,  0,-20,-20, 16,-30, 24,-20, -8,  2,-20, 10, 59,-10,-12,-22,-22, -5,  0;
/M: SY='G';  M= -3, -9,-28, -9,-15,-20, 40, -1,-32,-16,-25,-15,  0,-20,-13,-15,  1,-14,-25,-17,-10,-15;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='F';  M= -5,-16,-17,-21,-14, 19,-19, -2, -2,-15,  3,  0,-10,-19,-15,-12, -9, -6, -2,-10,  8,-14; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='K';  M= -8, -8,-19, -9, -4, -6, -7, -4,-14,  7,-12, -4, -4,-14, -1,  6, -7, -8, -9,-12, -3, -3; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='R';  M= -7, -6,-20, -5,  3,-15,-16,  1,-13,  7,-11, -5, -4,-13,  1,  8, -3, -4, -7,-23, -7,  1; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='R';  M=-12,  2,-27,  1,  1,-19,-10, -3,-22, 11,-20,-12,  7,-17,  2, 22, -2, -5,-18,-24, -9, -1;
/M: SY='S';  M= -5,  7,  3, 11,  1,-26, -5, -5,-30, -9,-27,-21,  5,-16, -5, -9, 12, -1,-19,-38,-20, -2;
/M: SY='P';  M= -3,  6,-27,  8,  3,-27,-12, -9,-21, -1,-23,-16,  4, 15, -1, -8,  0, -5,-22,-30,-20,  0;
/M: SY='F';  M= -9, -8,-11,-15,-15, 13,-21, -8, -6,-13, -8, -7, -3,-23,-16,-13, -6, -5, -7,-11, 13,-16;
/M: SY='S';  M=  7, -4, -5, -8,  0,-17,-12, -8,-14, -8,-17,-12, -1,-15,  0,-12, 10,  1,-11,-26, -9,  0;
/M: SY='P';  M=-12,-16,-33,-11, -2,-21,-20,-12,-18,  3,-19,-12,-13, 33, -4,  6,-10, -8,-21,-24,-15, -7;
/M: SY='S';  M=  9, -2,-17, -6,  2,-21, -4,-14,-19, -3,-18,-13, -1,-10, -1, -7, 13, 13,-11,-27,-17,  1;
/M: SY='K';  M= -6, -3,-27, -2,  3,-26,  0,-13,-23,  9,-25,-14, -1, -1, -3,  0, -3, -9,-17,-26,-19,  0;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='G';  M= -1, -2,-23, -8,-15,-19, 14,-16,-11,-15,-15,-10,  5,-19,-15,-17,  0, -5, -8,-26,-19,-16;
/M: SY='Y';  M=-13,-16,-25,-19,-19, 20,-26,  4,  4,-14, -2, -1,-12,-26,-13,-13,-10, -5, -2,  7, 44,-19;
/M: SY='R';  M=-11, -9,-24,-10,-10,-14,-25,-14,  0, -2, -6, -2, -7,-19, -5,  9, -7, -1,  4,-25, -9,-10;
/M: SY='Y';  M=-19,-16,-30,-15,-10, 23,-29, 18, -4, -8, -2, -2,-18,-26, -6, -9,-18,-10,-12, 23, 68,-13;
/M: SY='D';  M=-11, 36,-26, 50, 13,-36, -2, -4,-36, -3,-29,-27, 16,-11, -2,-11,  5, -7,-26,-37,-21,  5;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='L';  M=-11,-20,-21,-18,-16,  3,-28,-19, 15,-26, 36, 13,-23,-27,-18,-19,-24, -9,  9,-23, -3,-18;
/M: SY='Y';  M=-20,-19,-30,-19,-18, 24,-29, 18, -4, -5, -2, -1,-18,-29, -8,  0,-19,-10,-11, 24, 69,-18;
/M: SY='R';  M=-12, -8,-30, -6,  5,-22,-21, -2,-19, 15,-18, -8, -4, -2,  4, 19, -8, -9,-17,-24,-11,  2;
/M: SY='V';  M= -5,-28,-18,-30,-26, -2,-32,-26, 28,-17,  9, 10,-24,-26,-22,-12,-13, -4, 36,-26, -7,-26;
/M: SY='E';  M= -3, -6,-23, -2,  9,-19,-20, -4,-10, -6,-13, -9, -9, -1, -4,-11, -2, -6, -3,-30,-14,  2;
/M: SY='K';  M= -4,  6,-25, 10, 13,-25,-16, -9,-23, 14,-16,-12,  0,-11,  3,  4, -3, -7,-17,-27,-14,  8;
/M: SY='Y';  M=-12,-15,-19,-15,-11,  3,-22,  6,-12,-11,-13, -8,-13,-10, -3,-11, -7, -7,-16,  4, 26, -9;
/M: SY='W';  M=-16,-23,-41,-26,-21,  1,-18,-22,-20, -9,-22,-18,-20,-25,-14,-12,-26,-18,-27, 95, 17,-14;
/M: SY='R';  M= -8,-14,-25,-15, -4,-11,-22,-12, -7,  3, -6, -3, -9,-12, -2, 12, -8, -7, -5,-22, -8, -5;
/M: SY='E';  M= -6,  1,-30,  6, 30,-30, -9, -6,-28,  9,-23,-16, -3,  6, 13,  0, -2,-11,-27,-26,-20, 21;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='K';  M= -7,-10,-20,-10, -1,-14,-23,-15, -4,  8, -6, -2,-10,-15, -5,  4, -7, -1,  3,-23, -9, -3; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='G';  M= -3, -4,-25, -6, -9,-21, 30,-15,-26,-15,-17,-14,  3,-18,-12,-15,  2, -7,-21,-25,-22,-11;
/M: SY='K';  M= -7,-10,-25, -9,  1,-19,-14,-13,-13,  7,-13, -7, -7,-10, -2,  7, -5, -6, -8,-25,-14, -2;
/M: SY='S';  M= -3, 11,-18,  8,  3,-23, -8,  1,-22,  0,-26,-15, 17,-12,  7, -2, 18, 10,-18,-34,-15,  5;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='G';  M=  3,  0,-26, -1,-13,-29, 47,-15,-34,-15,-28,-20,  7,-18,-15,-17,  2,-15,-26,-24,-27,-14;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='F';  M= -9,-15,-13,-22,-18, 17,-12,-15, -8,-17, -7, -4, -6,-23,-19,-11, -3, -5, -6,-16,  0,-18;
/M: SY='N';  M=-10,  0,-22, -3,-10, -9,-15, -7, -3, -9, -1,  0,  2,-21,-10,-10, -9, -5, -4,-24, -4,-11;
/M: SY='V';  M= -6,-27, -3,-31,-27,  8,-31,-27, 19,-24, 14,  8,-25,-29,-27,-22,-14, -2, 26,-25, -5,-27;
/M: SY='F';  M=-18,-27,-19,-33,-25, 42,-27,-16, -9,-17, -3, -6,-22,-29,-27,-14,-22,-14,-10, 32, 28,-23;
/M: SY='R';  M=-13, -3,-29, -3, 12,-25,-20, -4,-25, 31,-21, -5, -2,-12, 14, 33, -9,-10,-20,-21,-10, 12;
/M: SY='F';  M=-20,-24,-25,-28,-22, 48,-29, -1, -4,-15,  2, -1,-18,-29,-22, -5,-19,-10, -6, 14, 45,-22;
/M: SY='R';  M=-14, -8,-29, -8,  3,-22,-21, -6,-23, 30,-16, -6, -4,-16,  9, 38,-12,-10,-17,-20, -9,  4;
/M: SY='L';  M=-11,-24,-21,-24,-11,  9,-28,-16, 13,-24, 36, 17,-25,-26,-15,-17,-25,-10,  4,-19,  0,-12;
/M: SY='R';  M= -7,-13,-20,-13, -4,-14,-21,-12, -5,  1, -6, -3,-10,-19, -2, 10, -3,  0,  4,-27,-11, -4;
/M: SY='R';  M=-13,-11,-30,-11, -1,-21,-18, -4,-27, 22,-20,-11, -3, -6,  6, 52, -8, -9,-20,-21,-13, -2;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_01 which contains 572'970 sequence entries.

Total number of hits	30 in 30 different sequences
Number of true positive hits	30 in 30 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	YDG
Version [info]	5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

30 sequences

ORTH1_ARATH (Q9FKA7), ORTH2_ARATH (Q8VYZ0), ORTH3_ARATH (Q9FVS2),

ORTH4_ARATH (Q9C8E1), ORTH5_ARATH (Q680I0), ORTHL_ARATH (Q681I0), 
SUVH1_ARATH (Q9FF80), SUVH1_TOBAC (Q93YF5), SUVH2_ARATH (O22781), 
SUVH3_ARATH (Q9C5P4), SUVH3_CHLRE (Q5QD03), SUVH4_ARATH (Q8GZB6), 
SUVH5_ARATH (O82175), SUVH6_ARATH (Q8VZ17), SUVH7_ARATH (Q9C5P1), 
SUVH8_ARATH (Q9C5P0), SUVH9_ARATH (Q9T0G7), SUVHA_ARATH (Q3EC60), 
UHRF1_BOVIN (A7E320), UHRF1_CRYNH (J9VHE9), UHRF1_DANRE (E7EZF3), 
UHRF1_HUMAN (Q96T88), UHRF1_MOUSE (Q8VDF2), UHRF1_RAT   (Q7TPK1), 
UHRF1_XENLA (B6CHA3), UHRF1_XENTR (F6UA42), UHRF2_HUMAN (Q96PU4), 
UHRF2_MOUSE (Q7TMI3), YDG1_ARATH  (Q9FHI0), YDG2_ARATH  (Q9LVU3)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

34 PDB

2PB7; 2ZKD; 2ZKE; 2ZKF; 2ZKG; 2ZO0; 2ZO1; 2ZO2; 3BI7; 3CLZ; 3DWH; 3F8I;
» more