PROSITE entry PS50921
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | ANTAR |
| Accession [info] | PS50921 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-DEC-2003 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50921 |
| Associated ProRule [info] | PRU00308 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | ANTAR domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=62; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=57; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9703017; R2=0.0155768; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4150.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=452; H_SCORE=4150; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=291; H_SCORE=4150; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-7; D=-30; I=-30; B1=-300; E1=-300; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='L'; M= -3,-15,-21,-20,-15, 4,-22,-16, 3,-13, 6, 4,-12,-20,-14, -7,-10, -3, 2,-18, -2,-15; /M: SY='Q'; M= -3, -6,-23, -7, 5,-22,-18, -7,-13, 5,-13, -5, -3,-13, 14, 6, 2, 0,-13,-25,-11, 9; /M: SY='K'; M= 6, -1,-22, -3, 2,-25,-13, -9,-22, 14,-20,-11, -1,-12, 7, 12, 3, 0,-14,-24,-14, 4; /I: I=-9; MD=-32; /M: SY='L'; M= -9,-25,-21,-25,-17, 5,-24,-17, 9,-21, 29, 12,-24,-26,-14,-12,-22, -9, 3, -6, 0,-16; D=-9; /I: I=-9; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='E'; M= 1, -1,-24, 0, 10,-26, -8, -8,-21, 7,-19,-12, -2,-12, 8, 5, 1, -7,-15,-25,-16, 8; /M: SY='R'; M= -2, -4,-26, -5, 7,-26, -4, -7,-26, 12,-21,-12, -1,-13, 9, 17, -1, -6,-20,-22,-16, 7; /M: SY='E'; M= -8, 7,-26, 12, 28,-29,-18, -2,-22, 7,-20,-13, 1, -8, 20, 0, 3, -3,-20,-29,-16, 24; /M: SY='L'; M= 6,-20,-16,-23,-17, -5,-21,-13, 7,-16, 13, 5,-19,-23,-15,-12,-10, -2, 12,-24, -7,-17; /M: SY='A'; M= 19, -5,-19, -7, 11,-23,-11,-11,-15, -1,-13,-10, -7,-10, 4, -5, 3, -4, -8,-24,-18, 7; /M: SY='Q'; M= -1, 7,-23, 7, 10,-28,-15, -7,-23, 11,-21,-12, 2, -9, 13, 3, 4, 3,-18,-26,-14, 12; /M: SY='L'; M= -3,-24,-19,-26,-18, 4,-24,-15, 11,-19, 28, 14,-24,-26,-15,-12,-20, -8, 7,-17, 2,-17; /M: SY='K'; M= -7, -1,-25, -1, 12,-26,-17, -6,-25, 21,-22,-11, 1,-11, 14, 21, 2, 1,-18,-24,-13, 12; /M: SY='E'; M= -4, 6,-24, 9, 15,-24,-15, -1,-24, 5,-17,-14, 2,-11, 5, 6, 2, -3,-18,-29,-14, 9; /M: SY='R'; M= 7, -4,-23, -6, 1,-24, -6,-10,-23, 10,-19,-11, -2,-13, 4, 14, 0, -4,-15,-22,-16, 1; /M: SY='L'; M= -9,-29,-20,-31,-22, 7,-31,-21, 25,-28, 41, 22,-28,-28,-19,-21,-26, -9, 16,-21, -1,-21; /M: SY='E'; M= 2, -3,-25, 1, 25,-21,-12, -8,-19, 0, -8,-11, -6, -9, 5, -3, -3, -9,-17,-25,-17, 15; /M: SY='S'; M= -1, 3,-20, 3, 9,-22, -2,-11,-24, -4,-21,-17, 3,-10, -1, -5, 13, 11,-16,-30,-18, 4; /M: SY='R'; M=-19, 0,-29, -1, 3,-23,-18, 1,-29, 24,-22,-12, 7,-19, 12, 54, -7, -9,-22,-23,-12, 3; /M: SY='K'; M= -7, 2,-27, 3, 9,-29,-17, 1,-27, 27,-26,-10, 2,-11, 14, 20, -3, -8,-21,-23,-10, 11; /M: SY='L'; M= -9,-18,-22,-17, -5, -6,-27,-16, 4, -7, 12, 4,-17,-21, -9, -1,-15, -5, 6,-24, -7, -8; /M: SY='I'; M= -8,-30,-24,-36,-29, 1,-36,-29, 41,-28, 22, 18,-24,-24,-22,-26,-19, -8, 32,-22, -2,-29; /M: SY='E'; M= -1, 11,-27, 16, 22,-30, 5, -7,-30, -2,-23,-20, 6, -9, 3, -9, 2,-10,-26,-29,-22, 12; /M: SY='R'; M=-13, -4,-29, -3, 13,-26,-21, -2,-24, 24,-17, -7, -2,-14, 19, 32, -8,-10,-21,-21,-11, 14; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='K'; M= -8, -6,-25, -9, -1,-21,-22,-14,-13, 27,-17, -2, -5,-13, 2, 14, -7, -1, -7,-22, -9, 0; /M: SY='G'; M= 11, -9,-24,-11,-16,-27, 48,-19,-32,-17,-26,-18, -1,-17,-16,-19, 7,-11,-22,-22,-27,-16; /M: SY='I'; M= -8,-28,-22,-31,-22, 2,-32,-22, 29,-25, 28, 20,-25,-25,-16,-21,-21, -8, 21,-22, -2,-21; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='M'; M=-10,-18,-22,-26,-15, -5,-21, 0, 16, -8, 15, 51,-17,-19, 7, -8,-17,-10, 6,-20, -1, -4; /M: SY='A'; M= 7, -7,-20,-10, -1,-20,-11,-15,-12, 2,-12, -7, -6,-12, -1, -4, 2, 3, -7,-24,-14, -1; /M: SY='R'; M=-13, -5,-25, -7, 4,-14,-19, -2,-15, 10, -9, -1, -1,-17, 4, 21, -7, -5,-14,-22, -5, 2; /M: SY='H'; M=-14, -3,-28, -3, 5,-19,-19, 24,-23, 9,-16, -6, 3,-17, 11, 18, -7,-10,-21,-23, 2, 5; /M: SY='G'; M= -8, 7,-28, 7, -7,-28, 32, -5,-35, -7,-28,-19, 12,-18, -9, -3, 0,-14,-29,-26,-22, -9; /M: SY='M'; M= -9,-25, -3,-31,-24, 0,-29,-21, 15,-23, 16, 17,-23,-26,-17,-20,-18, -6, 11,-15, -4,-21; /M: SY='S'; M= -2, 11,-18, 14, 2,-25, -2,-10,-25, -7,-25,-19, 9,-11, -1,-10, 19, 14,-16,-34,-18, 0; /M: SY='E'; M= 4, 5,-24, 10, 41,-27,-14, -5,-25, 4,-19,-18, -1, -3, 12, -5, 5, -5,-22,-29,-20, 27; /M: SY='E'; M=-11, 12,-29, 16, 21,-28, -8, 3,-29, 1,-25,-19, 9, 3, 5, -2, 1, -8,-28,-32,-19, 12; /M: SY='E'; M= -5, 8,-28, 14, 30,-31, -6, -3,-29, 5,-21,-17, 2, -7, 14, 0, 0,-10,-26,-27,-19, 22; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='F'; M=-19,-25,-26,-30,-24, 47,-29, 1, -2,-21, 6, 0,-20,-29,-24,-15,-21,-12, -6, 20, 45,-23; /M: SY='R'; M= -5, 4,-25, 4, 12,-26,-16, -3,-24, 12,-20,-12, 4,-11, 14, 16, 1, -2,-20,-25,-14, 12; /M: SY='Y'; M= -5,-19,-26,-20,-11, -2,-21, -5, -2,-13, 3, 2,-17,-21, -8,-10,-14,-10, -6, 6, 9,-10; /M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-32,-22, 6,-30,-18, 26,-26, 38, 28,-26,-26,-16,-20,-26,-10, 14,-20, 0,-20; /M: SY='R'; M=-15, -9,-27, -9, 2,-22,-19, -1,-23, 20,-18, -7, -2,-18, 16, 47, -5, -7,-16,-22,-11, 5; /M: SY='R'; M=-14, -3,-29, -4, 8,-23,-20, -3,-26, 29,-19, -9, 1,-15, 11, 39, -9, -9,-20,-22,-11, 7; /M: SY='T'; M= 5, -9,-18,-14, -4,-12,-18,-11, -4, -9, -2, 0, -9,-14, 2,-11, 2, 10, -4,-20, -5, -2; /M: SY='A'; M= 32, -6,-10,-11, -6,-20, 0,-16,-14,-10,-19,-14, -1,-10, -6,-16, 23, 9, -4,-29,-20, -6; /M: SY='M'; M=-10,-14,-23,-21, -9,-11,-20, 3, 9, -4, 9, 43,-14,-17, 17, -4,-14,-10, -1,-20, -3, 4; /M: SY='D'; M= -8, 29,-24, 34, 9,-30, -7, -2,-30, 3,-28,-23, 21,-12, 1, -1, 7, -3,-24,-36,-19, 5; /M: SY='R'; M=-15, -6,-28, -5, 8,-21,-19, 5,-25, 21,-18, -5, 0,-15, 12, 39, -6, -9,-19,-23, -9, 7; /M: SY='N'; M=-11, 11,-25, 3, 0,-23, -2, 1,-26, 11,-26,-15, 24,-18, 6, 23, 2, -5,-25,-29,-16, 1; /M: SY='V'; M= -6,-14, -4,-16, -8,-16,-25,-16, -2, -1, -8, 1,-14,-21, -4, -3, -6, -2, 8,-28,-12, -6; /M: SY='K'; M= -8, -6,-29, -5, 3,-26,-18,-12,-25, 21,-27,-14, -4, 13, 2, 16, -2, -2,-20,-26,-16, 1; /M: SY='I'; M=-10,-27,-24,-34,-24, 3,-31,-18, 33,-24, 28, 32,-23,-23,-14,-21,-23,-10, 19,-20, 0,-21; /M: SY='R'; M= -5, -6,-24, -6, 0,-20,-14, -9,-13, 5,-11, -4, -4,-16, 2, 9, -4, -6, -9,-25,-12, -1; /M: SY='D'; M=-12, 23,-28, 31, 25,-33,-14, 0,-31, 9,-25,-19, 11, -9, 14, 4, 0, -9,-27,-31,-17, 19; /M: SY='I'; M= -6,-30,-20,-34,-28, 2,-34,-28, 36,-26, 23, 16,-26,-26,-24,-24,-18, -6, 33,-24, -4,-28; /M: SY='A'; M= 46,-11, -1,-21,-11,-20, -2,-21,-11,-11,-11,-11,-11,-12,-11,-21, 9, -1, -1,-22,-21,-11; /M: SY='E'; M= 3, 1,-23, 0, 16,-26,-13, -3,-22, 8,-19,-12, 3,-10, 14, 11, 3, -5,-20,-25,-16, 14; /M: SY='Q'; M= 5, -3,-18, -5, 2,-21,-14, -9,-13, -3,-13, -8, -3,-13, 8, -3, 8, 6, -8,-27,-14, 5; /M: SY='I'; M= -6,-30,-19,-34,-28, 2,-34,-28, 35,-26, 22, 16,-26,-26,-24,-24,-18, -6, 35,-24, -4,-28; /M: SY='V'; M= -6,-29, -9,-32,-27, 2,-32,-27, 27,-26, 22, 13,-27,-29,-25,-23,-18, -6, 30,-26, -6,-27; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 4 in 4 different sequences |
| Number of true positive hits | 4 in 4 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | ANTAR |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
4 sequences
AMIR_PSEAE (P10932), NASR_KLEOX (Q48468), PDTAR_MYCTO (P9WGM2), PDTAR_MYCTU (P9WGM3)» more
|
| PDB [Detailed view] |
4 PDB
1QO0; 1S8N; 1SD5; 4AKK |