PROSITE entry PS50920

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50920
Entry name [info]	SOLCAR
Accession [info]	PS50920
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-AUG-2003 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00189
Associated ProRule [info]	PRU00282

Name and characterization of the entry

Description [info]

Solute carrier (Solcar) repeat profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=91;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=91;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4543622; R2=0.0214531; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=282; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='R';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=156; N_SCORE=5.8; MODE=1; TEXT='RR';
/DEFAULT: B0=-100; E0=-100; M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M:         M= -5, -7,-25, -3, -2,-20,-13,-13,-13, -1,-11, -6, -9, -2, -6, -1, -7, -8, -7,-26,-16, -6;
/M: SY='N';  M= -6,  5,-23,  2, -1,-22, -1, -6,-24,  5,-24,-14,  8,-15,  2,  3,  5,  2,-19,-24,-10,  0;
/M: SY='F';  M= -6,-18,-23,-23,-19, 11,-16,-16,  2,-20,  2, -2,-12,-17,-19,-18,-11, -8, -1, -5,  4,-19;
/M: SY='L';  M= -5,-26,-21,-28,-20,  4,-20,-20, 13,-25, 25, 13,-24,-18,-19,-20,-20, -9,  8,-20, -5,-20;
/M: SY='L';  M= -4,-18, -2,-23,-19,  0,-24,-17,  5,-18,  9,  2,-14,-25,-17,-17,-12, -6,  4,-22, -2,-19;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='S';  M=  3, -3,  0, -6, -6,-20, -9,  0,-22, -4,-18,-12, -1,-16, -5, -4,  4,  2,-12,-28,-12, -7; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='G';  M= -3,-18,-25,-21,-19,  0, 17,-19,-14,-21, -5, -6,-10,-22,-18,-19, -9,-14,-12,-14,-10,-18;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='V';  M=  0,-19, -4,-22,-18,  3,-20,-19,  8,-19, 11,  4,-18,-22,-19,-16, -7,  1, 14,-21, -6,-18; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='A';  M= 21,-13,-18,-19,-16,-14, 14,-21,-12,-16,-12, -9, -8,-16,-16,-20,  4, -6, -4,-20,-18,-16;
/M: SY='G';  M= 14, -9,-20,-13,-14,-22, 29,-19,-23,-16,-18,-14, -4,-16,-14,-18,  7, -4,-14,-23,-23,-14;
/M: SY='A';  M= 12,-17,-10,-24,-18, -3, -5,-14, -3,-16,  0,  6,-15,-20,-15,-18, -6, -7,  1,-16, -5,-17;
/M: SY='V';  M= -3,-21,-19,-24,-22, -7, -7,-22, 10,-20,  4,  6,-17,-23,-20,-19, -7, -2, 15,-25,-12,-22;
/M: SY='A';  M= 38, -8,-11,-16, -9,-20,  3,-19,-13,-11,-14,-12, -6,-11, -9,-18, 14,  5, -3,-23,-20, -9;
/M: SY='G';  M= -1, -5,-16, -6, -6,-24, 22,-18,-26,-14,-20,-16, -2,-16,-12,-17,  1, -6,-19,-26,-23,-10;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='A';  M=  9,-13,-16,-17,-10, -1, -2,-16, -7,-15, -3, -5,-11,-16,-14,-16, -1, -4, -2,-17, -9,-12; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='V';  M= -3,-21, -5,-26,-21, 10,-24,-21, 12,-20, 11,  5,-18,-22,-21,-18,-11, -1, 14,-17, -2,-21; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='S';  M=  8, -4,  2, -8, -7,-12, -1,-12,-12, -9,-13,-10, -1,-10, -7,-10, 12, 11, -5,-21,-13, -7; D=-9;
/I:         I=-9; MI=-19; MD=-19; IM=-19; DM=-19;
/M: SY='V';  M=  3, -5,-13, -7, -8, -8,-14, -4, -4, -5, -6, -4, -7,-13, -8, -8,  0,  3,  4,-17, -2, -9; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='F';  M= -6,-21,  4,-30,-24, 17,-27,-23,  7,-23,  3,  0,-17,-24,-25,-21, -9,  0, 10,-18,  0,-24; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='V';  M=  8,-22,-17,-28,-22,  5,-16,-23, 13,-20,  7,  4,-18,-20,-21,-21, -8, -5, 16,-17, -5,-22; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='V';  M=  4,-12,-14,-15,-16,-10, -4,-19,  0,-15, -5, -4, -8,-19,-16,-15,  4,  5, 10,-27,-14,-16; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='Y';  M= -1,-11, -8,-16,-11, -1,-18, -2, -8,-11, -7, -1, -9,-18, -4,-11, -1,  2, -4,-17,  3, -8; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='L';  M=  5,-20,-16,-26,-18,  2,-21,-18, 10,-19, 17, 13,-19,-21,-15,-18,-10,  1,  9,-20, -5,-17;
/M: SY='D';  M=-16, 33,-30, 49, 37,-36,-14,  0,-36,  4,-26,-26, 12, -6,  8, -6,  0,-10,-30,-36,-20, 22;
/M: SY='V';  M= -2,-19,-16,-23,-19,  4,-24,-19,  8,-15,  4,  2,-16,-22,-18,-12, -4,  7, 14,-20,  0,-19;
/M: SY='V';  M= 14,-24,-11,-28,-24, -6,-22,-27, 20,-18,  5,  5,-24,-24,-24,-21, -5, -1, 35,-27,-12,-24;
/M: SY='K';  M=-11, -6,-28, -6,  3,-23,-22,-11,-22, 36,-19, -6, -5,-15,  5, 28,-11, -9,-12,-21, -9,  3;
/M: SY='T';  M= -3,-12, -5,-18,-17, -8,-23,-21,  3,-14, -3, -3, -9,-20,-15,-11,  3, 16, 12,-31,-11,-17;
/M: SY='R';  M=-16,-11,-28,-11, -2,-19,-21, -4,-22, 22,-14, -6, -4,-20,  9, 51,-11, -9,-13,-21, -9,  0;
/M: SY='L';  M=-11,-27,-21,-33,-23, 15,-28,-15, 21,-24, 31, 30,-24,-26,-16,-18,-24,-10, 11,-16,  4,-20;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='Q';  M= -3, -3,-23, -8,  3,-24,-18, -2, -5, -1,-10,  3,  0,-12, 25, -2, -1, -3,-12,-21, -9, 13; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='A';  M=  9,-11,-12,-15,-11, -8, -6,-13,  2, -6,  0,  3,-10,-12, -9, -9, -4, -4,  6,-15, -9,-10; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='Q';  M= -9, 10,-20, 16, 14,-25,-12,  2,-18,  2,-13, -8,  3, -8, 20, -1,  0, -6,-19,-21,-10, 17; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='N';  M=  0,  5,-14,  3,  7,-16, -1,  2,-16, -3,-16,-11,  9, -8,  1, -5,  8,  2,-14,-22,-11,  4; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='G';  M= -3,  2,-18,  3, -4,-18, 12,  0,-21, -5,-16, -8,  2,-12, -4, -4,  0, -8,-15,-19,-12, -5; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='Q';  M= -7, -2,-20, -1,  9,-19,-13,  5,-15, 11,-14, -2, -2,  0, 14,  6, -5, -7,-16,-15, -6, 11; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='G';  M= -3,-10,-15,-13,-13, -9,  4,-13, -1,-10, -4, -2, -6,-12,-10, -7, -4, -4,  1,-14, -9,-13; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='A';  M= 13,  2,-11,  1, -2,-16, -4,-10, -9, -7,-13,-10,  1, -8, -4,-11, 11,  3, -4,-22,-13, -4; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='A';  M=  4,  2,-15,  0,  0,-17, -3, -6,-14,  1,-12, -8,  3,-10,  2, -3,  4, -2,-11,-20,-12,  1; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='P';  M= -8, -5,-26, -5,  5,-22,-17, -8,-14,  2,-18, -9, -3, 18,  7,  0, -3, -2,-18,-23,-15,  4; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='P';  M=-11,-12,-28,-10, -2,-20,-12, -8,-16,  6,-17, -5, -8, 13,  2, 13, -8, -9,-17,-20,-14, -3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='E';  M= -7, -1,-22,  1, 13,-22, -1, -3,-22, 11,-17, -9,  0, -8, 11, 11, -3, -9,-19,-16,-12, 11; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='Y';  M=-18,-19,-27,-20,-19, 32,-28, 15,  0,-11,  1,  0,-18,-28,-12,-10,-18, -9, -8, 26, 70,-19; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='K';  M= -5, -4,-23, -6,  1,-21,-17,-11,-21, 20,-20,-10, -2, -4,  2, 20, -1,  5,-13,-21,-11,  0; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='G';  M= -2,  5,-23, -1,-11,-23, 37,-10,-29,-12,-27,-18, 17,-17,-11,-12,  6, -7,-25,-26,-23,-11; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='V';  M= -4,-17,-16,-22,-19,  1,-20,-22, 12,-19,  5,  3,-13,-19,-18,-17, -3, 10, 15,-22, -5,-19; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='F';  M=-10,-23,-22,-26,-21, 18,-12,-17,  2,-23, 10,  2,-18,-17,-23,-18,-16,-10,  0, -9,  6,-22; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='B';  M=-12, 26,-26, 26,  4,-28,  2, 11,-31, -2,-28,-20, 26,-16, -1, -1,  4, -7,-28,-35,-16,  1;
/M: SY='C';  M=  6,-13, 40,-18,-15,-20, -7,-23,-22,-19,-18,-16,-11,-24,-18,-21,  1, -3, -8,-36,-24,-16;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='V';  M= -4,-26,-21,-30,-25,  6,-22,-21, 16,-21, 10,  9,-24,-26,-22,-20,-16, -8, 18, -7,  3,-24;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='R';  M= -7,-12,-18,-13, -9, -6,-18,-12, -8, -2,-10, -6, -6, -9, -7,  9,  1,  5, -1,-21, -8,-10; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='K';  M= -9, -5,-27, -7,  5,-24,-22, -8,-14, 15,-16, -5, -2,-12, 14, 14, -3, -1,-13,-23,-10,  8;
/M: SY='I';  M= -7,-24,-23,-33,-25, -1,-33,-24, 33,-23, 16, 20,-19,-21,-17,-23,-14,  0, 25,-23, -3,-24;
/M: SY='L';  M=  2,-25,-17,-27,-20,  7,-24,-20, 11,-21, 16,  6,-24,-19,-21,-19,-14, -5, 14,-17,  0,-21;
/M: SY='K';  M=-11, -2,-27, -4,  6,-26,-20, -6,-26, 31,-23, -8,  0,-12, 15, 31, -4, -1,-19,-21,-10,  9;
/M: SY='E';  M= -5,  7,-23,  8, 19,-21,-15, -4,-23,  5,-21,-16,  5, -9,  6,  2,  7,  3,-19,-27,-11, 12;
/M: SY='E';  M=-12, 11,-29, 20, 38,-29,-19,  7,-26,  4,-16,-14,  1, -7, 18, -2, -3,-11,-27,-29,-14, 28;
/M: SY='G';  M=  1, -9,-29, -9,-19,-29, 65,-19,-39,-19,-30,-20,  1,-19,-19,-19,  3,-17,-29,-21,-29,-19;
/M: SY='F';  M=-11,-28,-22,-29,-21, 19,-28,-22,  9,-24, 15,  5,-25, -7,-26,-20,-19, -8,  8,-16,  0,-23;
/M: SY='R';  M=-11, -8,-26,-10, -3,-13,-19,-10,-18,  9,-13, -8, -3, -5, -2, 17, -6, -3,-15,-23,-10, -4;
/M: SY='G';  M= 14, -7,-19,-11,-12,-23, 25,-18,-25,-11,-22,-15, -1,-14,-12,-15, 10,  1,-15,-24,-22,-12;
/M: SY='F';  M=-12,-28,-19,-32,-24, 30,-30,-21, 14,-28, 28, 11,-24,-28,-27,-20,-21, -5, 10,-12,  8,-24;
/M: SY='W';  M=-15,-28,-34,-30,-24, 26,-25, -5, -8,-16, -6, -8,-26,-29,-17,-15,-25,-16,-15, 65, 49,-21;
/M: SY='K';  M=-11, -2,-28, -3,  8,-28,-19, -5,-27, 34,-25, -9,  1,-12, 16, 31, -4, -5,-20,-22,-11, 11;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='F';  M= -7,-20, -9,-26,-21, 16,-24,-20,  2,-23, 12,  1,-17,-26,-23,-18,-14, -1,  2, -8,  2,-20;
/M: SY='T';  M=  2,-12,-18,-18,-15, -3,-17,-19, -1,-15, -6, -6, -7,-13,-15,-16,  2,  8,  2,-15, -8,-15;
/M: SY='P';  M= 12,-15,-24,-13, -6,-23,-12,-20,-13,-11,-20,-14,-14, 36,-10,-19,  3, -2,-11,-28,-24,-10;
/M: SY='T';  M= -5,  0,-19, -6, -9,-13, -6, -8,-14, -6,-14,-10,  8,-18, -7,  1,  7,  9,-10,-27,-10, -9;
/M: SY='L';  M= -9,-29,-21,-32,-25, 11,-30,-21, 21,-24, 22, 15,-27,-28,-22,-20,-22, -9, 19, -6,  6,-24;
/M: SY='L';  M= -2,-21,-23,-25,-15, -5,-20,-14, 12,-18, 16, 12,-18,-21, -5,-16,-15, -9,  3,-16,  0,-12;
/M: SY='R';  M=-14,-10,-29,-11, -5,-21,  0, -5,-28, 17,-20, -7, -2,-19,  3, 41, -9,-12,-20,-20,-14, -5;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='Q';  M= -4,-11,-22,-15, -8, -9,-21, -6,  4,-10,  1,  3, -7,-18,  5,-10, -6, -5, -2,-16,  3, -3; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='V';  M=  2,-20,-14,-25,-23, -8, -1,-24,  4,-22, -5, -2,-13,-21,-21,-23, -5, -8,  7,-23,-13,-23;
/M: SY='P';  M= -4,-17,-23,-18,-12,-12,-21,-18,  4,-15, -5,  3,-13, 11,-10,-17, -1,  4,  1,-28,-14,-13;
/M: SY='Y';  M=-12,-10,-27,-12,-12,  0,-18, -1, -6, -9, -6, -3, -8,-22, -7, -9,-12, -7, -8, -1, 14,-11;
/M: SY='N';  M=  1,  3,-19, -5, -6,-20, -2, -9,-17, -4,-18,-11, 10,-16,  0, -1,  7,  8,-13,-27,-16, -3;
/M: SY='A';  M= 26,-14, -2,-22,-15,-14,-10,-20, -3,-14, -3, -2,-14,-17,-13,-19,  3,  1,  7,-25,-16,-14;
/M: SY='L';  M=  1,-24, -9,-30,-23,  3,-26,-23, 16,-23, 17, 11,-21,-24,-20,-21,-14, -4, 16,-22, -5,-22;
/M: SY='R';  M=-11, -6,-25, -8,  1,-16,-21, -2,-13, 12,-13, -2, -3,-17,  9, 18, -6, -5,-10,-19, -3,  4;
/M: SY='F';  M=-17,-31,-23,-37,-27, 52,-30,-21,  6,-29, 19,  5,-24,-29,-32,-21,-24,-12,  2, 11, 21,-27;
/M: SY='G';  M=  7,-19,-19,-23,-23, -3,  8,-23, -4,-20, -7, -5,-14,-22,-23,-21, -5, -9,  5,-18,-12,-23;
/M: SY='V';  M= -8,-24,  1,-30,-24, 11,-28,-23, 11,-24,  9,  7,-19,-26,-23,-21,-11, -2, 13,-22, -2,-24;
/M: SY='Y';  M=-18,-21,-27,-24,-20, 34,-29,  6,  1,-12,  4,  4,-19,-28,-15,-10,-20,-10, -6, 16, 54,-20;
/M: SY='D';  M=-12, 27,-26, 39, 29,-32,-14, -3,-32,  1,-24,-24, 10, -7,  6, -7,  5, -1,-25,-35,-19, 17;
/M: SY='Q';  M= -6, -7,-21, -8,  4,-13,-20, -9,-11, -1,-10, -5, -6,-15,  7,  1,  2,  4, -7,-25, -9,  5;
/M: SY='L';  M= -2,-22,-17,-26,-20,  6,-24,-17, 14,-20, 15, 13,-20,-23,-17,-17,-11, -1, 14,-19,  1,-19;
/M: SY='K';  M= -8, -4,-25, -5,  1,-19,-19,-10,-19, 26,-22, -8, -1,-15,  4, 18, -5, -6,-10,-22, -9,  2;
/M: SY='K';  M= -4,  3,-26,  1,  9,-27, -2, -7,-23, 10,-22,-12,  5,-13,  8,  3, -1, -9,-19,-25,-17,  9;
/M: SY='Y';  M= -2,-19,-24,-23,-13,  8,-21, -4, -2,-14,  4,  4,-16,-21,-11,-11,-14,-10, -4,  0, 12,-13;
/I:         E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_01 which contains 572'970 sequence entries.

Total number of hits	1'459 in 496 different sequences
Number of true positive hits	1'459 in 496 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	1
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	99.93 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes, Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	3
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	REPEAT
Feature description [info]	Solcar
Version [info]	4

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

496 sequences

ADNT1_ARATH (O04619), ADT1_ANOGA  (Q27238), ADT1_ARATH  (P31167),

ADT1_BOVIN  (P02722), ADT1_GOSHI  (O22342), ADT1_HUMAN  (P12235), 
ADT1_MAIZE  (P04709), ADT1_MOUSE  (P48962), ADT1_RABIT  (O46373), 
ADT1_RAT(Q05962), ADT1_SOLTU  (P25083), ADT1_WHEAT  (Q41629), 
ADT1_YEAST  (P04710), ADT2_ANOGA  (Q7PQV7), ADT2_ARATH  (P40941), 
ADT2_BOVIN  (Q8SQH5), ADT2_HUMAN  (P05141), ADT2_MAIZE  (P12857), 
ADT2_MOUSE  (P51881), ADT2_PONAB  (Q5R5A1), ADT2_RAT(Q09073), 
ADT2_SOLTU  (P27081), ADT2_TACAC  (Q000K2), ADT2_WHEAT  (Q41630), 
ADT2_YEAST  (P18239), ADT3_ARATH  (O49447), ADT3_BOVIN  (P32007), 
ADT3_HUMAN  (P12236), ADT3_PIG(Q6QRN9), ADT3_YEAST  (P18238), 
ADT4_ARATH  (Q8LB08), ADT4_BOVIN  (Q2YDD9), ADT4_HUMAN  (Q9H0C2), 
ADT4_MACFA  (Q4R8M0), ADT4_MOUSE  (Q3V132), ADT5_ARATH  (Q9FM86), 
ADT_CHLRE   (P27080), ADT_DICDI   (O97470), ADT_DROME   (Q26365), 
ADT_KLULA   (P49382), ADT_NEUCR   (P02723), ADT_ORYSJ   (P31691), 
ADT_PARKE   (P31692), ADT_SCHPO   (Q09188), ADT_THET4   (G2QNH0), 
AGC1_EREGS  (Q75AH6), AGC1_YEAST  (Q12482), ALT9_ALTAL  (A0A3G9HRV8), 
ANT1_EREGS  (Q75A82), ANT1_YEAST  (Q06497), ARG13_NEUCR (Q01356), 
BAC1_ARATH  (Q84UC7), BAC2_ARATH  (Q9CA93), BMCP_DROME  (Q7K566), 
BRT1_ARATH  (Q9SUV1), BRTL1_ARATH (Q9LJX5), BRTL2_ARATH (Q9C9R4), 
BRTL3_ARATH (Q9LV81), BT1_MAIZE   (P29518), CMC1_CAEEL  (Q21153), 
CMC1_YEAST  (D6W196), CMC1_YEASX  (P0CI40), CMC2_CAEEL  (Q20799), 
CMC3_CAEBR  (Q628Z2), CMC3_CAEEL  (Q19529), CMC_DICDI   (Q54RB9), 
CMC_DROME   (Q9VA73), COAC1_ARATH (F4HW79), COAC1_MAIZE (K7VYZ9), 
COAC2_ARATH (F4JU70), COAC2_MAIZE (B4F8I5), COLT_DROME  (Q9VQG4), 
CRC1_YEAST  (Q12289), CTPA_ASPNA  (G3YC86), CTPB_ASPNA  (G3YD89), 
CTPC_ASPNA  (G3YAF3), CTPD_ASPNA  (G3YFS7), CTPE_ASPNA  (G3XP90), 
CTPF_ASPNA  (G3Y1Q5), DIC1_CANGA  (Q6FTN2), DIC1_YEAST  (Q06143), 
DIC_CAEEL   (G5EE96), DIC_HUMAN   (Q9UBX3), DIC_MOUSE   (Q9QZD8), 
DIC_RAT (O89035), DIF1_CAEEL  (Q27257), DTC_ARATH   (Q9C5M0), 
EAAC_ARATH  (O65023), FDB19_FUSPC (K3VFR5), FLX1_YEAST  (P40464), 
FOLT1_ARATH (Q7XA87), FUM11_GIBM7 (Q8J2Q9), GDC_BOVIN   (Q01888), 
GDC_HUMAN   (P16260), GDC_MOUSE   (Q8C0K5), GDC_RAT (P16261), 
GGC1_YEAST  (P38988), GHC1_BOVIN  (Q08DK4), GHC1_HUMAN  (Q9H936), 
GHC1_MOUSE  (Q9D6M3), GHC1_PONAB  (Q5RD81), GHC1_RAT(A0A0G2K5L2), 
GHC2_HUMAN  (Q9H1K4), GHC2_MOUSE  (Q9DB41), GHC2_RAT(Q505J6), 
KMCP1_HUMAN (Q5SVS4), KMCP1_MACFA (Q8HXE3), KMCP1_MOUSE (Q9CR58), 
KMCP1_RAT   (Q5PQM9), KMCP1_XENLA (Q6GQ22), KMCP1_XENTR (Q5XGI1), 
LEU5_YEAST  (P38702), M2OM_BOVIN  (P22292), M2OM_CAEEL  (P90992), 
M2OM_DICDI  (Q54PY7), M2OM_HUMAN  (Q02978), M2OM_MOUSE  (Q9CR62), 
M2OM_NEUCR  (P0C582), M2OM_PIG(F1RFX9), M2OM_RAT(P97700), 
MAPC1_ARATH (Q9FLS8), MAPC2_ARATH (Q9FI43), MAPC3_ARATH (Q9LY28), 
MCAR_MIMIV  (Q5UPV8), MCAT_ARATH  (Q93XM7), MCAT_HUMAN  (O43772), 
MCAT_MACFA  (Q8HXY2), MCAT_MOUSE  (Q9Z2Z6), MCAT_RAT(P97521), 
MCFA_DICDI  (Q54EV4), MCFB_DICDI  (Q54MZ4), MCFC_DICDI  (B0G159), 
MCFD_DICDI  (Q55E85), MCFE_DICDI  (Q55E45), MCFG_DICDI  (Q54BM3), 
MCFI_DICDI  (Q86I81), MCFJ_DICDI  (Q54VX4), MCFL_DICDI  (Q54W11), 
MCFM_DICDI  (Q54QN2), MCFN_DICDI  (Q54BF6), MCFP_DICDI  (Q54DU1), 
MCFR_DICDI  (Q54QI8), MCFS_DICDI  (Q54FE6), MCFU_DICDI  (Q54S10), 
MCFV_DICDI  (Q551X6), MCFW_DICDI  (Q54FU9), MCFX_DICDI  (Q86AV5), 
MCFY_DICDI  (Q86HN8), MCFZ_DICDI  (Q54B67), MFL1_ARATH  (Q9FHX2), 
MFN2A_XENLA (Q6GLJ0), MFN2B_XENLA (Q68F18), MFRN1_BOVIN (Q3ZBJ8), 
MFRN1_DANRE (Q287T7), MFRN1_HUMAN (Q9NYZ2), MFRN1_MOUSE (Q920G8), 
MFRN1_RAT   (Q66H23), MFRN2_DANRE (Q7T292), MFRN2_HUMAN (Q96A46), 
MFRN2_MOUSE (Q8R0Z5), MFRN_CAEBR  (Q620A6), MFRN_CAEEL  (Q23125), 
MFRN_DICDI  (Q55DY8), MFRN_DROME  (Q9VAY3), MME1_DROME  (Q9VM51), 
MME1_YEAST  (Q03829), MNCP_OXYFA  (P15798), MNCP_OXYTR  (Q27151), 
MPCP1_ARATH (Q7DNC3), MPCP2_ARATH (Q9M2Z8), MPCP3_ARATH (Q9FMU6), 
MPCP_CAEEL  (P40614), MPCP_CHOFU  (O61703), MPCP_SCHPO  (Q9P7V8), 
MPCP_YEAST  (P23641), MRS3_YEAST  (P10566), MRS4_YEAST  (P23500), 
MTCH1_HUMAN (Q9NZJ7), MTCH1_MOUSE (Q791T5), MTCH2_BOVIN (Q9N285), 
MTCH2_HUMAN (Q9Y6C9), MTCH2_MOUSE (Q791V5), MTCH2_PONAB (Q5R5M0), 
MTM1_ARATH  (Q944H5), MTM1_YEAST  (P53320), MTT1_MYCMD  (A0A0U2IR85), 
NDT1_ARATH  (O22261), NDT2_ARATH  (Q8RWA5), OAC1_SCHPO  (Q9UTN1), 
OAC1_YEAST  (P32332), ODC1_YEAST  (Q03028), ODC2_YEAST  (Q99297), 
ODC_BOVIN   (A0JN87), ODC_DICDI   (Q55GE2), ODC_HUMAN   (Q9BQT8), 
ODC_MOUSE   (Q8BZ09), ODC_PONAB   (Q5RFB7), ODC_RAT (Q99JD3), 
ODC_SCHPO   (Q9P3T7), ORNT1_HUMAN (Q9Y619), ORNT1_MOUSE (Q9WVD5), 
ORNT1_RAT   (A0A0G2K309), ORNT2_HUMAN (Q9BXI2), ORT1_SCHPO  (O59674), 
ORT1_YEAST  (Q12375), PET8_EREGS  (O60029), PET8_YEAST  (P38921), 
PIC2_YEAST  (P40035), PM34_DICDI  (Q76P23), PM34_HUMAN  (O43808), 
PM34_MOUSE  (O70579), PM47A_CANBO (P21245), PM47B_CANBO (Q00319), 
PNC1_ARATH  (Q9MA90), PNC1_SOYBN  (B6ZJZ9), PNC2_ARATH  (Q8VZS0), 
PUMP1_ARATH (O81845), PUMP2_ARATH (Q9ZWG1), PUMP3_ARATH (Q9XI74), 
PUMP4_ARATH (Q9SB52), PUMP5_ARATH (Q9SJY5), PUMP6_ARATH (Q9FY68), 
PXN_ARATH   (O04200), RIM2_DROME  (Q9VQ37), RIM2_YEAST  (P38127), 
S238A_DANRE (Q08CI8), S238B_DANRE (P0CAT2), S246A_XENLA (Q6INQ6), 
S246B_XENLA (Q63ZR7), S247A_DANRE (Q1ECW7), S247B_DANRE (A4QNX2), 
S2512_HUMAN (O75746), S2512_MOUSE (Q8BH59), S2512_PONAB (Q5RBC8), 
S2512_RAT   (F1LX07), S2513_HUMAN (Q9UJS0), S2513_MACFA (Q8HXW2), 
S2513_MOUSE (Q9QXX4), S2513_RAT   (F1LZW6), S2529_BOVIN (Q08DK7), 
S2529_HUMAN (Q8N8R3), S2529_MOUSE (Q8BL03), S2529_RAT   (Q5HZE0), 
S2532_CRIGR (Q6IZB5), S2532_HUMAN (Q9H2D1), S2532_MACFA (Q95J75), 
S2532_MOUSE (Q8BMG8), S2533_BOVIN (Q1LZB3), S2533_DANRE (Q6P036), 
S2533_HUMAN (Q9BSK2), S2533_MOUSE (Q3TZX3), S2534_BOVIN (Q3SZK0), 
S2534_DANRE (Q6PH61), S2534_HUMAN (Q6PIV7), S2534_MOUSE (A2ADF7), 
S2534_RAT   (Q5XIF9), S2535_BOVIN (Q58DS3), S2535_DANRE (A3KPP4), 
S2535_HUMAN (Q3KQZ1), S2535_MOUSE (Q5SWT3), S2536_CHICK (Q5ZKP7), 
S2536_DANRE (Q6DG32), S2536_HUMAN (Q96CQ1), S2536_MOUSE (Q922G0), 
S2538_AJECN (A6RAY2), S2538_ASPCL (A1CIF6), S2538_ASPFC (B0Y4J4), 
S2538_ASPFU (Q4WQC5), S2538_ASPNC (A2Q9F0), S2538_ASPOR (Q2UU67), 
S2538_ASPTN (Q0CT66), S2538_BOTFB (A6S8E0), S2538_BOVIN (Q5EAC0), 
S2538_CANAL (Q59KC4), S2538_CANGA (Q6FR88), S2538_CHAGB (Q2H608), 
S2538_COCIM (Q1DRJ3), S2538_DEBHA (Q6BH02), S2538_EMENI (Q5B717), 
S2538_EREGS (Q74Z23), S2538_HUMAN (Q96DW6), S2538_KLULA (Q6CNY8), 
S2538_LACBS (B0DK57), S2538_MOUSE (Q91XD8), S2538_MYCMD (Q4PDL5), 
S2538_NEOFI (A1CWA4), S2538_NEUCR (Q96U08), S2538_PICGU (A5D9W9), 
S2538_PICST (A3M019), S2538_PYRO7 (A4RPU0), S2538_PYRTR (B2VSU4), 
S2538_RAT   (Q499U1), S2538_SCHPO (Q9P6N6), S2538_SCLS1 (A7F9Y3), 
S2538_SHEEP (B2MVX9), S2538_VANPO (A7TIQ0), S2538_XENLA (Q6DE75), 
S2538_XENTR (Q6DJ08), S2538_YARLI (Q6C6I3), S2538_YEAS1 (B3LH09), 
S2538_YEAS7 (A6ZXL1), S2538_YEAST (Q07534), S2539_BOVIN (Q17QI7), 
S2539_DANRE (Q7SXW0), S2539_HUMAN (Q9BZJ4), S2539_MOUSE (Q9D8K8), 
S2539_RAT   (Q4V8K4), S2540_BOVIN (Q0VCH6), S2540_DANRE (Q6DHC3), 
S2540_DICDI (Q552L9), S2540_HUMAN (Q8TBP6), S2540_MOUSE (Q8BGP6), 
S2540_RAT   (Q498U3), S2540_XENLA (Q6DFK2), S2540_XENTR (Q6P316), 
S2541_BOVIN (Q0II44), S2541_HUMAN (Q8N5S1), S2541_MOUSE (Q8BVN7), 
S2541_RAT   (B8ZHC9), S2542_DANRE (Q0P483), S2542_HUMAN (Q86VD7), 
S2542_MOUSE (Q8R0Y8), S2542_RAT   (P0C546), S2542_XENLA (Q5PQ27), 
S2542_XENTR (Q05AQ3), S2543_DANRE (Q5U3V7), S2543_HUMAN (Q8WUT9), 
S2543_MOUSE (A2A3V2), S2544_HUMAN (Q96H78), S2544_MOUSE (Q8BGF9), 
S2544_PONAB (Q5RD67), S2545_HUMAN (Q8N413), S2545_MOUSE (Q8CFJ7), 
S2546_CHICK (Q5ZIG3), S2546_DANRE (Q6DGU5), S2546_HUMAN (Q96AG3), 
S2546_MOUSE (Q9CQS4), S2546_RAT   (Q5EB62), S2546_XENTR (A4IIC3), 
S2547_HUMAN (Q6Q0C1), S2547_MOUSE (Q6IS41), S2547_RAT   (Q6J329), 
S2548_BOVIN (Q3MHI3), S2548_DANRE (Q6DHS9), S2548_HUMAN (Q6ZT89), 
S2548_MOUSE (Q8BW66), S2551_HUMAN (Q9H1U9), S2551_MOUSE (Q5HZI9), 
S2551_RAT   (Q52KK3), S2552_HUMAN (Q3SY17), S2553_HUMAN (Q5H9E4), 
S25A3_BOVIN (P12234), S25A3_HUMAN (Q00325), S25A3_MOUSE (Q8VEM8), 
S25A3_PONAB (Q5R7W2), S25A3_RAT   (P16036), SAMC1_ARATH (Q94AG6), 
SAMC2_ARATH (F4HT41), SAMC_BOVIN  (A6QR09), SAMC_DANRE  (Q4V9P0), 
SAMC_DROME  (Q9VBN7), SAMC_HUMAN  (Q70HW3), SAMC_MOUSE  (Q5U680), 
SAMC_XENLA  (Q641C8), SAMC_XENTR  (Q6GLA2), SCM1A_XENLA (Q7ZY36), 
SCM1B_XENLA (Q7T0U6), SCM2A_DANRE (Q6NYZ6), SCM2B_DANRE (A2CEQ0), 
SCMC1_BOVIN (A5PJZ1), SCMC1_DANRE (Q66L49), SCMC1_HUMAN (Q6NUK1), 
SCMC1_MOUSE (Q8BMD8), SCMC1_RABIT (O18757), SCMC1_XENTR (Q5XHA0), 
SCMC2_BOVIN (Q0V7M4), SCMC2_HUMAN (Q6KCM7), SCMC2_MOUSE (A2ASZ8), 
SCMC2_RAT   (Q8K3P6), SCMC2_XENLA (Q7ZYD5), SCMC2_XENTR (Q5XH95), 
SCMC3_HUMAN (Q9BV35), SCMC3_MOUSE (Q6GQS1), SFC1_ARATH  (Q9M038), 
SFC1_YEAST  (P33303), SHAWN_DROME (Q9VWG0), TAAC_ARATH  (Q9M024), 
TDPC1_ARATH (Q8RXZ9), TDPC1_MAIZE (B4FIJ0), TDPC2_ARATH (Q9FI73), 
TDPC2_MAIZE (A0A1D6N272), TPC1_AJECN  (A6RF73), TPC1_ASPFU  (Q4X022), 
TPC1_ASPNC  (A2R5A0), TPC1_ASPOR  (Q2UCW8), TPC1_ASPTN  (Q0CEN9), 
TPC1_BOTFB  (A6SL61), TPC1_CANAL  (Q59Q36), TPC1_CANGA  (Q6FTE5), 
TPC1_CHAGB  (Q2HFL6), TPC1_COCIM  (Q1E7P0), TPC1_DEBHA  (Q6BPW0), 
TPC1_EMENI  (Q5AVW1), TPC1_EREGS  (Q75EP3), TPC1_KLULA  (Q6CQR3), 
TPC1_LODEL  (A5DX39), TPC1_NEOFI  (A1DI57), TPC1_NEUCR  (Q7S2H8), 
TPC1_PHANO  (Q0UUH1), TPC1_PICGU  (A5DIS9), TPC1_PICST  (A3LVX1), 
TPC1_PYRO7  (A4RF23), TPC1_SCLS1  (A7ER02), TPC1_VANPO  (A7TDX5), 
TPC1_YARLI  (Q6C107), TPC1_YEAS7  (A6ZV78), TPC1_YEAST  (P53257), 
TPC_BOVIN   (Q29RM1), TPC_DICDI   (Q54VS7), TPC_HUMAN   (Q9HC21), 
TPC_MACFA   (Q5IS35), TPC_MOUSE   (Q9DAM5), TPC_PONAB   (Q5NVC1), 
TPC_RAT (Q6AYL0), TXTPA_DANRE (Q6PGY3), TXTPB_DANRE (F1R4U0), 
TXTP_BOVIN  (P79110), TXTP_CAEEL  (P34519), TXTP_HUMAN  (P53007), 
TXTP_MOUSE  (Q8JZU2), TXTP_RAT(P32089), TXTP_YEAST  (P38152), 
UCP1_BOVIN  (P10861), UCP1_CANLF  (Q9GMZ1), UCP1_DICGR  (Q8K404), 
UCP1_HUMAN  (P25874), UCP1_MESAU  (P04575), UCP1_MOUSE  (P12242), 
UCP1_OCHDA  (A0PC02), UCP1_PHOSU  (Q9ER18), UCP1_RABIT  (P14271), 
UCP1_RAT(P04633), UCP1_SHEEP  (W5PSH7), UCP1_SUNMU  (Q18P97), 
UCP2_BOVIN  (Q3SZI5), UCP2_CANLF  (Q9N2J1), UCP2_CYPCA  (Q9W725), 
UCP2_DANRE  (Q9W720), UCP2_HUMAN  (P55851), UCP2_MOUSE  (P70406), 
UCP2_PIG(O97562), UCP2_PONAB  (Q5R5A8), UCP2_RAT(P56500), 
UCP3_BOVIN  (O77792), UCP3_CANLF  (Q9N2I9), UCP3_HUMAN  (P55916), 
UCP3_MOUSE  (P56501), UCP3_PIG(O97649), UCP3_RAT(P56499), 
UCP4C_DROME (Q9VMK1), UCP4_HUMAN  (O95847), UCP4_MOUSE  (Q9D6D0), 
UCP5_HUMAN  (O95258), UCP5_MOUSE  (Q9Z2B2), UCPA_DICDI  (Q55BF4), 
UCPB_DICDI  (B0G143), UGO1_SCHPO  (Q9UTF8), Y2148_TRIVH (P0CH61), 
YAD8_SCHPO  (Q09834), YBC9_SCHPO  (O13660), YBT5_SCHPO  (O94502), 
YDE9_SCHPO  (Q10442), YE08_SCHPO  (O13805), YEA6_YEAST  (P39953), 
YETC_SCHPO  (O14281), YFG5_SCHPO  (O13844), YFL5_YEAS1  (B3LUQ6), 
YFL5_YEAS6  (B5VI70), YFL5_YEAS7  (A7A285), YFL5_YEAST  (P43617), 
YG04_SCHPO  (O94370), YG1D_SCHPO  (P78763), YH66_SCHPO  (Q9P7X9), 
YHM2_YEAST  (Q04013), YHMB_SCHPO  (O94344), YIA6_YEAST  (P40556), 
YID3_SCHPO  (Q9UTD6), YIKC_SCHPO  (Q8TFH2), YJE9_SCHPO  (O74439), 
YKQ9_SCHPO  (Q9P6L7), YMC1_SCHPO  (Q10248), YMC1_YEAST  (P32331), 
YMC2_YEAST  (P38087), YP011_YEAST (Q12251), YQ51_CAEEL  (Q09461), 
YQ73_SCHPO  (Q76PC3)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences

1 sequence

UGO1_YEAST  (Q03327)

PDB
[Detailed view]

12 PDB

1OKC; 2C3E; 2LCK; 4C9G; 4C9H; 4C9J; 4C9Q; 6GCI; 8G8W; 8HBV; 8HBW; 8J1N