PROSITE entry PS50859

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50859
Entry name [info]	LONGIN
Accession [info]	PS50859
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-JUL-2003 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC50859
Associated ProRule [info]	PRU00231

Name and characterization of the entry

Description [info]

Longin domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=112;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=107;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.1883000; R2=0.0190139; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6296.2392578; R2=6.7789855; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=401; H_SCORE=9015; N_SCORE=8.8; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=280; H_SCORE=8194; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='M';  M= -7,-24,-12,-28,-23,  6,-18,-19, 10,-20, 13, 14,-21,-26,-19,-17,-15, -8, 11,-21, -4,-21;
/M: SY='I';  M= -6,-29,-20,-33,-27,  5,-33,-27, 33,-25, 17, 13,-24,-25,-24,-24,-15, -5, 31,-23, -3,-27;
/M: SY='A';  M= 15,-15, -9,-20,-14, -1,-12, -8, -7,-16, -2, -5,-12,-19,-13,-17, -2, -4, -4,-15,  2,-14;
/M: SY='R';  M=-18, -8,-30, -8,  2,-22,-20, -2,-30, 34,-22,-10,  0,-18, 10, 62,-10,-10,-20,-20,-10,  2;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='V';  M= -1, -6,-10, -5, -6, -8,  2,-10, -3, -7, -6, -4, -6,-11, -9, -8,  0, -3,  4,-15, -9, -7; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-19;
/M: SY='G';  M=  4, -4,-13, -4,  0,-13,  5, -8,-12, -4,-11, -8, -2, -3, -3, -5,  3, -2, -9,-14,-12, -2; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-19;
/M: SY='D';  M= -4, 16,-14, 23,  9,-18, -5, -2,-18,  1,-15,-13,  7, -5,  1, -4,  4, -2,-13,-20,-11,  5; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-19;
/M: SY='G';  M= -3, -4,-28, -2, -7,-28, 40,-15,-34, -6,-27,-18,  0,-12,-11,-10, -2,-16,-26,-20,-24, -9; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-19;
/M: SY='T';  M=  4, -7,-14,-11,-10, -9,-15,-16, -2,-13,  1, -3, -7,-11,-11,-13,  2, 10,  1,-25,-11,-11; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-19;
/M: SY='V';  M= -5,-23,-20,-23,-18, -7,-26,-21, 12,-15,  5,  6,-22, -5,-16,-13,-11, -1, 17,-27,-11,-18;
/M: SY='L';  M= -8,-24,-15,-25,-16, -2,-30,-22, 18,-22, 19, 10,-22,-20,-17,-20,-17, -5, 15,-25, -7,-18;
/M: SY='L';  M= -1,-27,-12,-29,-19,  4,-26,-21, 14,-27, 37, 14,-27,-28,-19,-20,-23, -8,  9,-22, -5,-19;
/M: SY='A';  M= 20,-12, -8,-18,-13,-16,-10,-21, -5, -7,-10, -7,-11,-16,-13,-13,  6,  6,  7,-26,-16,-13;
/M: SY='E';  M= -2, 10,-21, 12, 23,-25,-13, -6,-24,  4,-22,-18,  6, -7,  6, -3, 12,  6,-19,-32,-18, 15;
/M: SY='Y';  M=  3,-17,-19,-22,-17,  5,-17, -4, -1,-13, -1,  4,-13,-20,-14,-13, -7, -5,  3,-14,  6,-16;
/M: SY='S';  M=  0,  3,-19,  1,  3,-20,-13, -7,-18,  1,-18,-12,  4,-12,  4, -1, 11,  9,-13,-27,-10,  3;
/M: SY='D';  M= -8, 18,-28, 25, 12,-27, -9, -7,-23, -5,-21,-18,  7,-11,  0,-11,  0, -8,-20,-24,-16,  6;
/M:         M= -6, -6, -9, -6, -5, -4,-16,-15, -9,-15, -1, -7, -9,-21,-14,-15, -8, -5, -4,-26,-10, -9;
/M: SY='S';  M=  0,  3,-18,  0,  2,-21, -4, -9,-19, -5,-23,-16,  9, -6,  0, -7, 17, 12,-15,-33,-18,  1;
/M: SY='G';  M= -5,  1,-25,  1, -2,-28, 13, -4,-29, -4,-25,-14,  4,-14,  5, -4,  6, -3,-23,-26,-17,  1;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='G';  M=  4, -3,-11, -3, -3,-13, 12, -8,-14, -8,-14,-10,  1, -8, -4, -8, 11,  1,-10,-18,-13, -4; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-19;
/M: SY='F';  M=-10,-10,-11,-13,-10, 15,-16, -7, -3, -6,  1, -1, -8,-15,-11,  0,-10, -6, -3, -4,  8,-10; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-19;
/M: SY='F';  M= -8, -3,-11, -6, -8, 20,-11, -7, -6,-10, -3, -5,  0,-12,-13, -8, -3, -3, -5, -5,  6, -9; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-19;
/M: SY='N';  M= -5, 18,-20, 12,  5,-20, -3, -2,-23, -2,-26,-18, 25,-14,  1, -4, 14,  4,-22,-34,-17,  3;
/M: SY='Y';  M= -9,-20,-21,-24,-19, 18,-26,  3,  2,-16,  0,  2,-16,-25,-16,-12,-13, -8,  5, -8, 20,-18;
/M: SY='Q';  M= -2, -2,-23, -5,  0,-24, -6, -9,-18,  5,-20, -9,  3,-13,  9,  0,  6,  1,-15,-26,-14,  4;
/M: SY='E';  M= -4,  5,-23,  4, 16,-19,-15, -4,-19,  0,-16,-12,  4,-10, 11, -3,  4,  0,-19,-27,-13, 14;
/M: SY='F';  M=-12,-19,-24,-23,-11, 10,-28, -9,  5,-14,  3,  4,-14,-21, -5,-11,-13, -9,  1,-14,  5, -8;
/M: SY='A';  M= 24,-14,-14,-23,-15,-11,-11,-16,  3,-12,  2, 10,-14,-15,-10,-17, -1,  1,  7,-21,-12,-12;
/M: SY='K';  M= -3, -1,-22, -4,  5,-22,-17,-10,-20, 18,-20,-10,  0,-12,  5, 14,  1,  4,-12,-25,-12,  5;
/M: SY='F';  M=-13,-15,-25,-19, -8,  6,-19, -4, -7, -7, -2,  6,-10,-20,  4, -1,-12,-11,-11,-12,  3, -1;
/M: SY='L';  M= -7,-26, -4,-32,-25, 14,-30,-24, 14,-27, 19,  8,-23,-27,-25,-23,-18, -6, 13,-19,  0,-25;
/M: SY='L';  M= -3,-23,-11,-27,-20, 11,-20,-21,  6,-24, 15,  4,-18,-25,-21,-20,-11, -4,  5,-19, -3,-20;
/M: SY='K';  M= -7,  0,-26,  1, 15,-27,-15, -5,-25, 18,-22,-11,  0,-10, 15, 16,  0, -2,-21,-24,-14, 15;
/M: SY='K';  M= -9,  2,-24,  0,  3,-23,-19,-10,-23, 25,-21,-10,  2,-12,  3, 20, -3,  4,-15,-24,-10,  2;
/M: SY='L';  M= -8,-30,-21,-33,-25,  5,-33,-25, 31,-28, 33, 18,-27,-27,-22,-23,-23, -8, 24,-22, -2,-25;
/I:         I=-4; MD=-23;
/M: SY='S';  M=  7, -1, -6, -4, -5, -8, -4, -7, -3, -5, -8, -5,  2, -8, -5, -7,  8,  5,  1,-16, -9, -5; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-23;
/M: SY='P';  M= -9, -9,-32, -3, 11,-25,-15,-10,-21,  0,-24,-16,-10, 39,  1, -8, -5, -8,-25,-24,-17,  3; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-23;
/M: SY='R';  M= -3, -6,-22, -7, -3,-21,  2, -8,-23,  2,-20,-11,  0,-11,  4, 13,  5,  1,-17,-22,-15, -1; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='P';  M=  0, -3,-23, -4,  1,-19, -5, -8,-21, -6,-24,-17,  2, 12, -5,-11,  9,  0,-19,-29,-18, -3;
/M: SY='G';  M=  0,  5,-25,  3, -4,-25,  8,-12,-22, -9,-24,-18,  7,  4, -9,-14,  2, -5,-20,-29,-23, -7;
/M: SY='N';  M= -2,  5,-19, -2,  0,-20,-12,  0,-15, -1,-16, -8, 12,-15,  9,  0,  9,  6,-15,-29,-12,  4;
/M: SY='R';  M=-15, -5,-29, -5,  5,-23,-20,  1,-27, 28,-20, -8,  1,-16, 10, 42,-10,-10,-20,-22, -9,  5;
/M: SY='Q';  M= -1,-13, -6,-18, -8, -8,-20,-11, -7, -8, -5,  1,-11,-19,  4, -8, -4, -3, -5,-22, -8, -1;
/M: SY='T';  M=  3,  0, -8, -4, -6,-16,-11,-15,-14,-11,-19,-15,  4,-11, -6,-12, 26, 28, -5,-35,-15, -6;
/M: SY='Y';  M=-10,-27,-22,-29,-25, 14,-32,-12, 21,-20, 14, 10,-25,-28,-21,-18,-18, -7, 20, -6, 24,-25;
/M: SY='E';  M= -5,  6,-23,  7, 22,-25,-13, -6,-23,  5,-22,-16,  5, -2,  9, -1,  9,  6,-21,-31,-18, 15;
/M: SY='H';  M= -4, -1, -5, -2,  8,-24,-16, 12,-23, -6,-21,-11,  1,-14, 12, -5,  8,  1,-19,-32,-11,  9;
/M: SY='G';  M= -8, 16,-29, 22,  5,-33, 24, -8,-36, -8,-29,-22, 10,-14, -4,-12,  2,-13,-29,-29,-24,  0;
/M: SY='N';  M= -5, 15,-26, 14,  4,-27, -2, -4,-26,  0,-26,-19, 17, -1,  0,  0,  3, -6,-25,-32,-21,  1;
/M: SY='Y';  M=-18,-19,-27,-20,-19, 26,-28, 24, -2,-13, -1,  3,-16,-28,-12,-10,-18,-11, -8, 12, 55,-18;
/M: SY='I';  M= -7,-13,-20,-19,-14, -4,-25,-17, 12,-15, 12,  8,-10,-21,-13,-14,-10,  4,  9,-26, -6,-14;
/M: SY='F';  M=-15,-26, -8,-33,-28, 44,-21,-18, -1,-26,  3, -2,-19,-29,-32,-21,-17,-10,  0, -1, 19,-28;
/M: SY='H';  M=-19,  5,-29,  2,  0,-20,-18, 90,-29, -9,-21, -2, 16,-20,  9,  0, -8,-18,-30,-31, 15,  0;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='Y';  M=-17,-21,-26,-22,-21, 29,-30,  9,  3,-13,  2,  1,-20,-29,-14,-12,-17, -6, -3, 19, 61,-21;
/M: SY='L';  M= -5,-18,-21,-23,-18, -3,-26,-19, 16,-16, 17, 11,-14,-22,-14,-15,-14, -2, 11,-24, -5,-17;
/M: SY='R';  M=-11,-17,-13,-21,-14,-12,-26,-16,  0,  0, -6, -1,-10,-21, -7, 15, -9, -4,  4,-25, -9,-14;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='E';  M= -2,  8,-21, 11, 22,-24,-13, -5,-22,  2,-20,-16,  5, -7,  8, -4,  9,  2,-17,-30,-17, 15; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='D';  M=-13, 34,-25, 35, 14,-31, -5,  3,-29,  1,-28,-22, 30,-13,  6, -4,  5, -5,-29,-37,-20, 10;
/M: SY='G';  M= -5,  0,-28, -1,-11,-27, 37, -9,-33, -9,-27,-15,  7,-18,-10, -7,  0,-14,-26,-25,-23,-11;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-21,-34,-26, 14,-33,-24, 28,-28, 30, 16,-26,-27,-24,-23,-23, -8, 21,-18,  2,-26;
/M: SY='C';  M=  6,-14, 33,-22,-19,-13,-20,-22,-11,-18,-11,-11,-13,-24,-19,-20,  3,  8,  3,-33,-15,-19;
/M: SY='Y';  M= -8,-18,-26,-20,-21, 13, -4,  0, -8,-15, -6, -5,-15,-26,-16,-15,-12,-11, -8,  8, 35,-21;
/M: SY='L';  M= -9,-29, -8,-31,-24,  7,-31,-23, 20,-28, 31, 15,-27,-29,-23,-22,-23, -8, 17,-23, -3,-24;
/M: SY='C';  M= -3,-23, 29,-29,-27, -9,-24,-28,  4,-24,  1, -1,-22,-30,-26,-24,-10, -4, 16,-34,-16,-27;
/M: SY='I';  M= -3,-26,-21,-33,-25,  4,-29,-22, 29,-23, 20, 22,-22,-23,-18,-22,-17, -7, 23,-20, -2,-23;
/M: SY='C';  M= 15,-13, 25,-22,-17,-11,-15,-22,-13,-17,-10, -9,-12,-20,-17,-20,  4,  6, -1,-29,-17,-17;
/M: SY='D';  M=-16, 30,-29, 44, 20,-33,-14,  2,-30, -1,-24,-23, 11, -5,  1, -9, -2, -9,-23,-36,-18, 10;
/M: SY='E';  M= -9, 10,-21, 13, 15,-27,-16,  0,-26, 12,-23,-15,  6,-12,  6,  6, -1, -7,-20,-30,-14, 10;
/M: SY='E';  M= -2,  9,-22, 11, 16,-24, -8, -2,-24,  0,-22,-15,  7, -9,  4, -5, 10,  3,-19,-32,-16,  9;
/M: SY='Y';  M=-11,-23,-24,-27,-22, 33,-27, -1,  3,-17,  5,  1,-20,-28,-19,-15,-17, -8, -1, 12, 45,-22;
/M: SY='P';  M= -6,-13,-34, -7, -2,-29, 11,-18,-27,-12,-29,-20,-10, 41,-10,-18, -3,-12,-29,-27,-29, -9;
/M: SY='R';  M=-13,-12,-25,-12, -5,-17,-21, -3,-16, 18,-14, -5, -6,-20,  1, 34, -8, -7, -6,-23, -8, -5;
/M: SY='R';  M=-13, -3,-28, -4,  5,-25,-17, -1,-27, 26,-23,-10,  4,-15, 17, 42, -3, -7,-21,-23,-11,  9;
/M: SY='I';  M= -8,-26,-23,-28,-20, -3,-29,-22, 21,-20, 16, 11,-21,-13,-17,-15,-16, -7, 16,-24, -6,-21;
/M: SY='A';  M= 30,-13,-20,-17, -7,-23, -7,-20,-13,-10,-17,-13,-13, 23,-10,-20,  3, -3,-10,-23,-23,-10;
/M: SY='F';  M=-18,-24,-22,-32,-24, 54,-28, -5,  0,-23,  5,  3,-17,-28,-27,-16,-17, -9, -3,  7, 34,-24;
/M: SY='T';  M=  9, -3,-15, -9, -3,-16,-10,-13,-11,-10, -8, -8,  0,-13, -2,-11, 10, 12, -7,-28,-14, -3;
/M: SY='F';  M=-17,-27,-23,-32,-24, 46,-30, -9,  6,-24, 18,  6,-23,-30,-26,-17,-23,-10,  0,  7, 36,-24;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-21,-31,-21,  9,-31,-21, 23,-30, 47, 20,-29,-29,-20,-21,-29,-10, 12,-20,  0,-21;
/M: SY='E';  M= -6, 19,-23, 17, 28,-25,-11,  1,-24,  3,-23,-19, 21, -9,  8, -2,  8, -1,-26,-34,-19, 18;
/M: SY='D';  M=-16, 22,-30, 33, 22,-34,-16, -2,-34, 17,-27,-20,  9,-10, 10, 11, -3,-10,-27,-30,-16, 15;
/M: SY='I';  M= -8,-30,-23,-36,-28,  2,-36,-28, 39,-28, 24, 18,-24,-24,-22,-26,-20, -8, 31,-22, -2,-28;
/M: SY='K';  M= -3,-12,-16,-14, -6,-16,-17, -1,-13,  3, -2, -1,-10,-19, -3,  2,-12,-10,-10,-23, -7, -5;
/M: SY='D';  M=-12, 16,-29, 22, 19,-34,-12,  1,-28, 10,-24,-13,  8,-10, 21,  3,  0, -9,-26,-28,-15, 20;
/M: SY='E';  M=-13, 12,-30, 20, 36,-32,-18,  1,-30, 13,-22,-17,  3, -7, 21, 11, -2,-10,-28,-28,-17, 28;
/M: SY='F';  M=-20,-29,-21,-37,-29, 73,-30,-14,  0,-27,  9,  0,-20,-30,-36,-19,-20,-10, -1, 13, 37,-29;
/M: SY='L';  M= -9, -8,-14,-12, -7, -8,-22,-11, -1,-13,  2,  0, -6,-21, -8,-12, -8, -3, -3,-21, -7, -8;
/M: SY='R';  M= -4,  0,-23, -2,  6,-23,-15, -2,-22, 14,-21,-11,  4,-13,  7, 16,  3,  0,-15,-26,-12,  5;
/M: SY='S';  M= -3,  1,-20, -2,  5,-20,-14, -7,-17,  4,-17,-10,  5,-13,  7,  5,  8,  7,-13,-29,-14,  5;
/M: SY='Y';  M=-15,-13,-25,-17,-18, 18,-20, 14, -5,-15, -3, -1, -7,-27,-14,-11,-14,-10, -7, -1, 33,-18;
/M: SY='G';  M=  1, -7,-26, -6,-12,-27, 34,-16,-29,-15,-26,-16, -1, -3,-13,-17,  5,-10,-23,-26,-26,-13;
/I:         I=-5; MD=-25;
/M: SY='R';  M= -6, -3,-23, -5,  1,-18, -5, -4,-18,  7,-15, -8,  2,-14,  0, 13, -4, -8,-15,-21,-12, -1; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-25;
/M: SY='E';  M=  0, -3,-18, -2,  3,-16, -3, -9,-11, -7, -8, -6, -3,-11,  2, -9,  1, -3, -9,-20,-12,  2; D=-5;
/I:         I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
/M: SY='K';  M= -8,  2,-24,  4,  8,-21,-15,  0,-21, 14,-19, -9,  1,-12, 14, 14, -1, -6,-18,-17, -3, 10; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-25;
/M: SY='W';  M=  1,-26,-26,-29,-22,  1,-15,-24,  1,-19, -3, -4,-24,-18,-19,-20,-16,-12,  0, 28,  2,-20; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-25;
/M: SY='E';  M=  0,  1,-25,  0, 10,-23,-14, -2,-22,  3,-21,-13,  2,  3,  6,  0,  2, -3,-20,-27,-15,  7;
/M: SY='T';  M= -4,  3,-18, -2, -4,-17,-16, -5,-14, -7,-17,-11,  5, -5, -1, -8, 12, 20,-10,-30,-10, -3;
/I:         I=-5; MD=-27;
/M: SY='A';  M= 17, -7, -9,-13,-11,-11, -5,-15, -2, -9, -7, -5, -5,-12,-11,-13,  6,  5,  6,-20,-13,-11; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-27;
/M: SY='V';  M=  1,-13,-14,-15,-11, -8,-12,-15,  4,-13,  1,  1,-10,-12, -8,-12, -1,  3,  6,-20, -9,-10; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='P';  M=  8,-16,-27,-14, -7,-21, -4,-18,-13,-12,-18,-13,-14, 26,-12,-19, -4, -8,-14,-22,-18,-12;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='Y';  M=-12, -5,-23, -6, -8,  2,-20,  9,-11, -4,-11, -7, -3,-20, -2, -2, -3,  2,-13, -3, 30, -8; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='A';  M= 17, -3,-16, -6,  0,-23, -2, -8,-19, -5,-21,-14,  2, -6,  0,-10, 15,  4,-12,-28,-18, -1;
/M: SY='F';  M= -4,-16,-19,-22,-18, 19,-22,-15,  4,-19,  9, 10,-15,-22,-19,-17,-12, -5,  4,-13,  4,-17;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='N';  M= -4, 14,-15,  6,  0,-11, -8,  0,-10, -3,-14,-10, 21,-12, -2, -5,  5,  5,-13,-23, -8, -2; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='I';  M= -7, -8,-24, -8, -3, -9,-24,-16,  2, -9,  1, -1, -9,-17, -9, -9, -8, -5,  2,-24, -8, -7;
/M: SY='E';  M= -8,  7,-26,  9, 28,-26,-16,  2,-25,  7,-22,-16,  6, -2, 14,  0,  5,  0,-24,-30,-16, 20;
/M: SY='F';  M=-18,-28,-23,-35,-25, 55,-29,-17,  2,-24,  9,  3,-19,-23,-31,-15,-19,-10,  0,  3, 23,-26;
/M: SY='D';  M= -9, 13,-28, 21,  7,-29, -3, -9,-27, -4,-26,-20,  5, -4, -1,-10,  3, -6,-23,-24,-18,  3;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='R';  M= -6, -6,-22, -7, -1,-12,-16, -8,-17,  5,-17,-10, -2, -3,  0,  8,  1,  3,-13,-21, -7, -2; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='F';  M=-11,-22,-19,-24,-19, 10,-23,-16,  2,-11,  5,  2,-19,-20,-19, -9,-16, -8,  5,-13,  6,-19;
/M: SY='L';  M=-12,-13,-24,-14,-13, -2,-26,-12, 12,-20, 23, 12,-15,-24,-10,-16,-20, -9,  3,-21,  0,-13;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_01 which contains 572'970 sequence entries.

Total number of hits	61 in 61 different sequences
Number of true positive hits	61 in 61 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	3
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	95.31 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	Longin
Version [info]	5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

61 sequences

PHL11_ARATH (Q9SN26), S22BA_DANRE (Q7ZV15), S22BB_DANRE (Q7SXP0),

SC221_ARATH (Q94AU2), SC22A_HUMAN (Q96IW7), SC22A_MACFA (Q4R866), 
SC22A_MOUSE (Q8BH47), SC22A_RAT   (Q642F4), SC22B_CHICK (Q5ZJW4), 
SC22B_CRIGR (O08595), SC22B_HUMAN (O75396), SC22B_MOUSE (O08547), 
SC22B_PONAB (Q5RAI9), SC22B_RAT   (Q4KM74), SC22B_XENTR (Q6P7L4), 
SC22C_BOVIN (Q2YDJ2), SC22C_HUMAN (Q9BRL7), SC22C_MOUSE (Q8BXT9), 
SEC22_CANGA (Q6FWT0), SEC22_EREGS (Q74ZD2), SEC22_KLULA (Q6CJA0), 
SEC22_SCHPO (Q9Y7L0), SEC22_YARLI (Q6C880), SEC22_YEAST (P22214), 
VA711_ARATH (O49377), VA712_ARATH (Q9SIQ9), VA713_ARATH (Q9LFP1), 
VA714_ARATH (Q9FMR5), VA721_ARATH (Q9ZTW3), VA722_ARATH (P47192), 
VA723_ARATH (Q8VY69), VA724_ARATH (O23429), VA725_ARATH (O48850), 
VA726_ARATH (Q9MAS5), VA727_ARATH (Q9M376), VAM7A_DICDI (Q54NW7), 
VAM7B_DICDI (Q86AQ7), VAMP7_BOVIN (Q17QI5), VAMP7_CHICK (Q5ZL74), 
VAMP7_HUMAN (P51809), VAMP7_MOUSE (P70280), VAMP7_PONAB (Q5RF94), 
VAMP7_RAT   (Q9JHW5), YKT61_ARATH (Q9ZRD6), YKT62_ARATH (Q9LVM9), 
YKT6A_XENLA (Q6DDU7), YKT6B_XENLA (Q32N70), YKT6_BOVIN  (Q3T000), 
YKT6_CANGA  (Q6FW27), YKT6_DANRE  (Q7ZUN8), YKT6_DEBHA  (Q6BSL0), 
YKT6_DICDI  (Q54ES8), YKT6_EREGS  (Q757A4), YKT6_HUMAN  (O15498), 
YKT6_KLULA  (Q6CSA2), YKT6_MOUSE  (Q9CQW1), YKT6_RAT(Q5EGY4), 
YKT6_SCHPO  (O60073), YKT6_XENTR  (Q6P816), YKT6_YARLI  (Q6C537), 
YKT6_YEAST  (P36015)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences

3 sequences

PHL12_ARATH (Q84WF5), PHL21_ARATH (Q9STP2), PHL22_ARATH (Q9LVV3)

PDB
[Detailed view]

28 PDB

1H8M; 1IFQ; 1IOU; 2DMW; 2NUP; 2NUT; 2VX8; 3BW6; 3EGD; 3EGX; 3KYQ; 4AFI;
» more