PROSITE entry PS50279

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50279
Entry name [info]	BPTI_KUNITZ_2
Accession [info]	PS50279
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-DEC-2001 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00252
Associated ProRule [info]	PRU00031

Name and characterization of the entry

Description [info]

Pancreatic trypsin inhibitor (Kunitz) family profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.1543; R2=0.00996029; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=738; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=537; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M:         M= -6, -3,-22, -5, -1,-12,-14, -5,-12, -5, -8, -7,  0,-17, -2, -3,  0, -1,-11,-23, -7, -3;
/M: SY='L';  M= -6,-12,-22,-12, -1,-11,-21, -8, -2,-10, 11,  6,-13,-19,  4, -8,-11, -7, -6,-23, -7,  2;
/M: SY='P';  M= -3, -7,-30, -4,  1,-26,-14,-13,-20, -4,-25,-16, -6, 38, -3,-10, -1, -5,-23,-28,-23, -4;
/M: SY='P';  M= -6,-16,-26,-16, -8,-10,-22,-11, -6, -4, -7, -2,-14,  4, -7, -3,-11, -7, -6,-21, -7, -9;
/M: SY='D';  M= -7, 16,-25, 22, 12,-24,-12, -4,-24,  0,-21,-18,  7, -9,  1, -5,  2, -6,-18,-31,-15,  6;
/M: SY='T';  M= -1, -5,-21, -6, -1,-18,-16,-10,-12, -4,-14, -9, -4, -2, -2, -5,  4,  5, -7,-28,-13, -2;
/M: SY='G';  M= -1, -7,-29, -7,-16,-28, 57,-17,-36,-17,-28,-19,  1,-19,-17,-17,  0,-18,-28,-20,-26,-17;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='P';  M= -6, -5,-27, -4,  0,-20,-15, -9,-16, -5,-19,-12, -4, 16, -1, -7, -1, -2,-17,-27,-15, -2;
/M: SY='C';  M= -8,-16, 86,-24,-26,-20,-14,-27,-30,-27,-21,-19,-14,-35,-27,-27, -7,-10,-13,-44,-28,-26;
/M: SY='R';  M= -6, -1,-24, -2, -2,-17, -2, -7,-22,  1,-19,-11,  2,-13, -2,  3,  2, -2,-17,-24,-11, -2;
/M: SY='A';  M=  6, -2,-22, -4, -2,-20,  5,-12,-21, -5,-18,-13,  0,-10, -5, -9,  3, -4,-16,-24,-17, -3;
/M: SY='N';  M= -4, -2,-22, -5, -3,-12, -7, -3,-16, -6,-15,-10,  2,-13, -3, -6,  2, -2,-14,-22, -5, -4;
/M: SY='I';  M= -7,-15,-23,-18,-12, -3,-22,-14,  2,-10, -2,  2,-11,-11,-10, -9, -7, -3,  2,-20, -5,-12;
/I:         MD=-26;
/M: SY='T';  M= -5, -8,-23, -9, -2,-14,-17,-12,-12, -3,-13, -9, -6,  2, -4, -3,  0,  4,-10,-19,-11, -4; D=-5;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-26; IM=0; DM=-26;
/M: SY='R';  M=-12,-10,-27,-11, -2,-19,-18, -2,-21, 20,-16, -4, -3,-18,  7, 41, -8, -8,-14,-20, -9, -1;
/M: SY='W';  M=-20,-30,-34,-33,-27, 39,-27,-10, -7,-20, -4, -7,-27,-30,-23,-17,-27,-17,-14, 65, 47,-23;
/M: SY='Y';  M=-15,-21,-27,-24,-20, 29,-25,  6, -6,-15, -3, -4,-17,-27,-16,-13,-16, -9,-10, 24, 45,-19;
/M: SY='Y';  M=-19,-24,-27,-28,-24, 46,-29,  5, -1,-18,  3,  0,-20,-30,-21,-14,-20,-11, -7, 25, 56,-23;
/M: SY='D';  M=-14, 38,-25, 40,  9,-29, -7,  5,-29,  0,-28,-23, 33,-15,  0, -5,  5, -5,-27,-38,-18,  5;
/M: SY='P';  M=  1,-10,-23,-11, -5,-17,-14,-10,-12, -5,-15, -9, -6,  3, -4, -6,  2, -1,-10,-24,-14, -6;
/M: SY='E';  M= -2,  0,-22, -1,  4,-18,-12, -8,-15,  1,-15,-10,  1,-13,  1, -1,  2,  0,-11,-26,-12,  2;
/M: SY='T';  M=  1, -2,-16, -6, -4,-14,-16,-13,-11, -6,-11, -9, -2,-13, -4, -7, 11, 20, -4,-27, -9, -5;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='G';  M= -8, -2,-27, -4, -3,-22,  5, -3,-24,  4,-18, -8,  2,-17,  0,  5, -4,-10,-20,-23,-14, -2;
/M: SY='Q';  M= -5, -2,-22, -5,  5,-20,-17, -6,-17,  8,-15, -6,  0,-13, 10, 10,  3,  4,-14,-25,-11,  7;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='E';  M= -8, -5,-24, -5,  8,-16,-21, -4,-10,  2, -9, -3, -5,-14,  7,  2, -4, -5, -9,-24, -8,  7;
/M: SY='P';  M= -6, -4,-24, -3,  6,-24,-16, -7,-19,  2,-19,-10, -3,  8,  7,  2,  0, -3,-19,-27,-17,  5;
/M: SY='F';  M=-19,-28,-21,-37,-28, 70,-29,-17,  0,-28,  9,  0,-19,-29,-36,-19,-19,-10, -1, 10, 30,-28;
/M:         M= -8,-12,-24,-15, -8, -7,-21,-10, -5, -4, -6,  0,-10,-18, -4, -4, -7, -2, -4, -8, -2, -6;
/M: SY='Y';  M=-19,-21,-30,-22,-20, 28,-28, 10, -3,-12, -3, -3,-20,-27,-13,-11,-20,-11,-11, 34, 62,-20;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='G';  M= -5, -1,-25, -1, -7,-21, 15, -9,-24, -8,-21,-14,  4,-14, -7, -9,  3, -4,-20,-24,-14, -8;
/M: SY='G';  M= -1, -8,-30, -9,-18,-28, 61,-18,-36,-19,-27,-18,  1,-20,-18,-19, -1,-19,-28,-20,-27,-18;
/M: SY='C';  M= -6,-17, 85,-26,-24,-18,-27,-25,-24,-24,-17,-16,-17,-33,-23,-24, -7, -7, -8,-43,-24,-23;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='G';  M= -7,  0,-28,  2,  1,-26, 13, -7,-27, -1,-20,-13,  2,-15,  0,  0, -3,-12,-23,-24,-18,  0; D=-6;
/I:         DM=-29;
/M: SY='G';  M=  0, -8,-28, -9,-15,-28, 51,-17,-35,-15,-27,-17, -1,-18,-16,-15,  0,-15,-26,-21,-26,-15;
/M: SY='N';  M= -9, 34,-21, 18,  0,-21, -2,  7,-21,  1,-28,-19, 49,-18,  1,  0,  9,  1,-28,-38,-19,  1;
/M: SY='A';  M=  5, -3,-21, -4,  2,-17, -8, -5,-17, -4,-16,-10, -2,-12,  2, -6,  5, -3,-14,-21, -8,  1;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-26; IM=0; DM=-26;
/M: SY='N';  M=-10, 39,-20, 19,  0,-20,  2,  9,-21, -1,-30,-20, 58,-20, -1, -1, 10, -1,-30,-39,-20, -1;
/M: SY='N';  M=-10, 16,-23,  4, -2,-19,-10,  3,-16,  6,-22,-12, 30,-19,  3, 13,  3, -3,-20,-32,-15, -1;
/M: SY='F';  M=-20,-29,-21,-39,-29, 77,-30,-17,  0,-29,  9,  0,-20,-30,-38,-19,-20,-10, -1, 11, 33,-29;
/M: SY='E';  M= -4, -3,-24, -2,  5,-17,-16, -5,-15,  1,-10, -7, -5,-11,  0, -1, -4, -5,-12,-23, -7,  2;
/M: SY='T';  M=  1,  6,-13,  3, -1,-18,-10,-12,-18, -7,-21,-16,  8,-10, -3, -8, 25, 28, -9,-35,-16, -2;
/M: SY='R';  M=-10, -9,-26, -9,  2, -9,-22, -6,-10,  3, -6, -4, -7,-16,  2,  4, -9, -7,-11,-15,  2,  1;
/M: SY='E';  M= -5,  9,-25, 11, 21,-27,-15,  2,-22,  4,-18,-12,  6,-10, 15,  0,  2, -6,-21,-29,-15, 17;
/M: SY='E';  M= -6,  8,-24, 12, 20,-26,-16,  4,-22,  1,-16,-12,  2,-10, 12, -3,  2, -4,-21,-29,-13, 16;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='E';  M= -9, -3,-25, -3, 13,-18,-19, -3,-14,  5, -8, -1, -4,-13, 10,  6, -5, -5,-15,-24, -9, 11;
/M: SY='R';  M= -7,  0,-21, -1,  6,-21,-11, -3,-22,  6,-18,-11,  3,-15,  5,  8,  1, -4,-18,-25,-12,  5;
/M: SY='F';  M= -5,-14,-20,-19,-13, 10,-22,-12, -2,-11,  0, -1,-12,-20,-13, -9, -6,  2, -1,-12,  9,-13;
/M: SY='C';  M= -9,-20,118,-30,-30,-20,-29,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-39,-30,-30,-10,-10,-10,-49,-30,-30;
/I:         E1=0;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_01 which contains 572'970 sequence entries.

Total number of hits	476 in 392 different sequences
Number of true positive hits	476 in 392 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	8
Number of 'partial' sequences	19

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	98.35 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	12
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	K_Hofmann
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	BPTI/Kunitz inhibitor
Version [info]	3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences	392 sequences 3API_HETMG (C0HK72), 3BPI_HETMG (C0HK73), 3CPI_HETMG (C0HK74), » more Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits: [Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format] Retrieve the sequence logo from the alignment
UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences	8 sequences BLI5_CAEEL (O62247), BLI5_HAECO (D3GGZ8), IRSPI_IXORI (W6HZ31), » more
UniProtKB/Swiss-Prot 'Partial' sequences	19 sequences BMTI2_RHIMP (P83603), BMTI3_RHIMP (P83604), BMTI4_RHIMP (P83605), » more
PDB [Detailed view]	204 PDB 1AAL; 1AAP; 1ADZ; 1B0C; 1BF0; 1BHC; 1BIK; 1BPI; 1BPT; 1BRB; 1BRC; 1BTH; » more