PROSITE entry PS50142

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50142
Entry name [info]	RNASE_3_2
Accession [info]	PS50142
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-DEC-2001 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00448
Associated ProRule [info]	PRU00177

Name and characterization of the entry

Description [info]

Ribonuclease III family domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=124;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=119;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.2496000; R2=0.0182516; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6947.5546875; R2=6.2195892; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=453; H_SCORE=9765; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=343; H_SCORE=9081; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='L';  M= -6,-24,-19,-27,-20,  8,-26,-21, 17,-25, 21,  9,-20,-24,-19,-20,-12, -3, 13,-22, -2,-20;
/M: SY='N';  M=  1,  9,-20,  7,  8,-24,-10, -7,-23, 11,-25,-16, 12,-11,  3,  3, 10,  4,-17,-30,-16,  5;
/M: SY='R';  M= -2, -1,-23, -6, -1,-18,-15,  8,-20,  9,-18, -8,  4,-15,  6, 10, -1, -2,-17,-20, -1,  1;
/M: SY='L';  M=-13,-30,-22,-35,-25, 29,-32,-22, 20,-30, 32, 14,-25,-28,-26,-22,-25,-10, 11,-11,  9,-25;
/M: SY='E';  M=-13, -5,-25, -3,  9,  0,-23, -8,-11, -4,  0, -1, -9,-16, -1, -6,-12,-10,-12,-19, -3,  5;
/M: SY='E';  M=-10,  3,-28,  7, 30,-27,-18, -3,-29, 20,-23,-16,  1, -7, 14, 20,  0, -7,-24,-27,-16, 21;
/M: SY='K';  M=-12,  8,-27,  7,  8,-28,-17, -2,-26, 23,-25,-11,  8,-13, 15, 21, -2, -3,-22,-25,-12, 11;
/M: SY='I';  M=-11,-28,-25,-32,-25,  9,-34,-17, 28,-25, 25, 15,-24,-26,-19,-22,-22, -9, 17,-11, 15,-25;
/M: SY='G';  M= -7,  0,-28, -1,-13,-18, 37, -4,-33,-16,-25,-17,  7,-20,-15,-15, -2,-16,-27,-22,-18,-14;
/M: SY='Y';  M=-13,-23,-25,-26,-21, 10,-30,  2, 16,-19, 15, 15,-20,-26,-13,-16,-20,-10,  8, -6, 27,-20;
/M: SY='R';  M=-10, -9,-23,-12, -7, -3,-10, -1,-20, -1,-16, -8, -2,-18, -3,  6, -1,  0,-15,-19, -3, -5;
/M: SY='F';  M=-14,-22,-25,-27,-23, 26,-30,-22, 13,-24,  6,  3,-18,-13,-27,-22,-16, -9,  9,-12,  6,-25;
/M: SY='N';  M= -6, 20,-21, 10,  3,-23, -6,  0,-23, 12,-30,-17, 33,-15,  3,  6, 11,  1,-23,-34,-17,  3;
/I:         I=-5; MI=0; IM=0; DM=-15; MD=-15;
/M: SY='D';  M= -7, 22,-26, 24, 15,-28,-10,  6,-27, -1,-25,-20, 19,  0,  2, -7,  2, -7,-27,-34,-18,  8;
/M: SY='W';  M=-15,-18,-16,-20,-10,-10,-24,-10,-14,  0,-11, -6,-15,-23,  2,  6,-17,-14,-16, 13,  5, -5;
/M: SY='E';  M= -1,  2,-25,  2, 22,-25,-16, -4,-18,  5,-12, -9,  0,-10, 16, -1, -2, -8,-20,-25,-15, 19;
/M: SY='L';  M=-13,-28,-24,-31,-23, 19,-32,-15, 20,-26, 31, 14,-25,-28,-20,-20,-25,-10,  9, -8, 18,-23;
/M: SY='L';  M=-13,-27,-22,-28,-22, 22,-30, -9, 13,-23, 28, 11,-26,-30,-20,-17,-24, -9,  6, -3, 26,-22;
/M: SY='K';  M=-10, -2,-26,  0,  6,-22,-21, -1,-17,  7,-14, -7, -5, -4,  3,  1, -6, -3,-13,-27,-10,  3;
/M: SY='Q';  M= -4, -3,-25, -5, 11,-22,-19, -5,-10,  1, -7, -3, -2,-13, 17, -2, -5, -8,-15,-24,-11, 14;
/M: SY='A';  M= 40,-11,-12,-19, -9,-19, -4,-18, -8,-10, -5, -6,-11,-12, -5,-18,  6, -2, -1,-20,-17, -7;
/M: SY='F';  M=-11,-25,-18,-29,-21, 29,-27,-19,  8,-27, 26,  8,-21,-27,-24,-18,-17, -3,  5,-13,  7,-21;
/M: SY='T';  M= -1, -5,-14,-14,-14, -9,-21,-20,  1,-13, -7, -5, -1,-14,-12,-13, 12, 30,  7,-30,-10,-14;
/M: SY='H';  M=-12,  2,-26,  1, -2,-21, -8, 55,-27,-10,-24, -8, 12,-10,  4, -5,  1,-11,-27,-32,  2, -2;
/M: SY='N';  M=  8,  6, -9, -4, -6,-20, -7, -9,-18, -4,-21,-15, 14, -9, -5, -4,  9,  4,-15,-31,-19, -6;
/M: SY='S';  M=  8, -2,-14,  0, 10,-20, -8,-11,-16, -7,-22,-16,  2,-10,  1,-10, 23,  9, -7,-35,-19,  5;
/M: SY='Y';  M=  1,-15,-22,-17,-11, -3,-17, -2, -4,-10, -4,  4,-13, -8, -4,-12, -5, -4, -7, -9, 13, -9;
/M: SY='A';  M=  5, -9,-20,-13,-11,-15,-13,-16,  1,-14, -3,  1, -7,-15, -6,-16,  1,  1,  0,-25,-12, -9;
/M: SY='N';  M= -3, 18,-20,  9, -3,-20,  1, -3,-19, -7,-22,-17, 27,-11, -5, -8,  8,  1,-21,-34,-19, -4;
/M: SY='E';  M= -6,  7,-26,  6, 18,-25,-16, -3,-16,  8,-17, -6,  6,-10, 12,  1, -2, -8,-18,-27,-14, 14;
/M: SY='H';  M=-15, -3,-27, -5, -2,-10,-19, 41,-22, -2,-17, -4,  5,-20,  9,  8, -5,-11,-22,-19, 13,  1;
/M: SY='N';  M= -9, 14,-22,  7,  0,-17, -7, -4,-13, -4,-11,-10, 20,-20, -5, -5, -3, -6,-16,-32,-15, -3;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-15; MD=-15;
/M: SY='Y';  M=-12, -5,-18, -3, -8, 11,-16, 10, -4, -5, -3, -3, -8,-16, -5, -6,-10, -6, -8, 11, 38, -9; D=-4;
/I:         DM=-22;
/M: SY='E';  M=-12, 16,-29, 21, 34,-34,-16,  5,-27,  7,-23,-15,  9, -7, 29,  2,  1, -9,-30,-29,-17, 31;
/M: SY='R';  M=-19, -8,-30, -8,  3,-23,-20, 12,-29, 23,-20, -8,  1,-19, 17, 55, -9,-11,-22,-21, -7,  5;
/I:         I=-10; MI=-10; IM=-10;
/M: SY='L';  M=-11,-29,-20,-31,-21, 15,-29,-19, 18,-29, 45, 21,-28,-29,-20,-19,-28,-10,  9,-17,  3,-20;
/M: SY='E';  M=-10, 13,-29, 20, 54,-29,-18,  1,-29,  9,-21,-20,  6, -2, 18,  0,  1, -9,-30,-31,-20, 36;
/M: SY='F';  M=-17,-27,-20,-37,-28, 64,-30,-21,  4,-28,  9,  1,-18,-27,-35,-20,-17, -5,  3,  3, 23,-28;
/M: SY='L';  M=-10,-28,-21,-30,-21,  9,-30,-16, 22,-26, 38, 22,-27,-28,-18,-19,-26, -9, 13,-17,  5,-20;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='D';  M=-19, 45,-30, 63, 19,-39,-11, -1,-39,  5,-30,-28, 18,-10,  1, -6, -1,-10,-29,-38,-19, 10;
/M: SY='A';  M= 23, -2, -1, -9, -7,-20, -2,-14,-17,-10,-21,-16,  4,-13, -7,-15, 20,  7, -8,-32,-21, -7;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-21,-36,-28, 20,-33,-26, 28,-27, 20, 13,-24,-27,-27,-23,-19, -7, 25,-16,  4,-28;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-31,-22, 14,-31,-21, 21,-29, 42, 18,-29,-29,-22,-21,-27, -9, 13,-18,  2,-22;
/M: SY='B';  M= -5, 17,-24, 16,  6,-28, -4, -3,-27,  7,-27,-18, 17,-13,  5,  4,  7, -3,-23,-31,-18,  5;
/M: SY='Y';  M=-14,-22,-23,-25,-19, 29,-26, -5,  2,-15, 10,  7,-18,-26,-17,-12,-17, -8, -2,  1, 30,-18;
/M: SY='V';  M=  0,-17,-21,-21,-15, -2,-16, -5,  4,-16, -1,  4,-14,-20,-14,-16, -8, -5,  7,-18,  1,-15;
/M: SY='I';  M=  0,-21,-18,-28,-23, -4,-27,-24, 24,-20,  7, 11,-17,-20,-17,-21, -5,  5, 24,-25, -7,-22;
/M: SY='T';  M= 17, -5,-10,-12, -9,-15,-10,-18, -9,-11,-13,-11, -3,-11, -9,-14, 19, 25,  1,-29,-15, -9;
/M: SY='K';  M=-11, -1,-27,  0,  7,-21,-20, -7,-16, 12,-11, -7,  0,-15,  6, 12, -7, -8,-14,-25,-11,  5;
/M: SY='Y';  M= -4,-15,-22,-18,-12,  6,-23, -7,  1, -9, -4, -2,-12,-20,-11,-12, -5, -1,  0, -7, 18,-13;
/M: SY='L';  M= -9,-30,-22,-33,-23,  7,-33,-23, 28,-29, 39, 19,-27,-27,-21,-23,-26, -9, 18,-21, -1,-23;
/M: SY='F';  M=-18,-25,-25,-31,-25, 47,-30, -4,  6,-21,  8,  6,-20,-28,-24,-16,-20,-10,  0, 13, 45,-25;
/M: SY='H';  M=-11, -2,-26, -3,  8,-14,-19, 15,-17,  0,-10, -4,  1,-16, 10,  0, -5, -9,-19,-24, -3,  9;
/M: SY='K';  M=-11,  0,-26,  1,  4,-23,-19,  6,-24, 19,-19, -8,  1,-14,  7, 17, -4, -4,-18,-25, -6,  4;
/M: SY='F';  M=-17,-23,-24,-27,-21, 41,-27, -3, -2,-17,  5,  0,-18,-28,-21,-10,-16, -8, -5, 10, 41,-21;
/M: SY='P';  M= -9,-19,-35,-11, -2,-25,-19,-18,-17, -9,-22,-16,-17, 64, -9,-13, -8, -8,-24,-29,-25, -9;
/M: SY='D';  M=-15, 16,-29, 21, 13,-33,-16,  2,-30, 16,-25,-14, 10,-13, 19, 18, -3, -9,-26,-28,-14, 15;
/M: SY='Y';  M= -2,-15,-14,-19,-13, -2,-22, -7, -1, -9,  4,  4,-15,-21, -6,-10, -9,  0, -1,-12, 10,-10;
/M: SY='N';  M= -7, 10,-24,  9,  2,-25, -4,  4,-25, -4,-26,-17, 15, -4,  3, -2,  9,  1,-23,-33,-16,  1;
/M: SY='E';  M= -7,  4,-26, 10, 39,-25,-19, -6,-23,  3,-19,-17, -3,  3, 10, -4,  4, -1,-21,-31,-19, 24;
/M: SY='G';  M= -2,-13,-28,-13,-21,-22, 52,-18,-30,-19,-24,-15, -5,-22,-20,-19, -3,-17,-20,-17,-20,-21;
/M: SY='E';  M= -8,  2,-24,  7, 19,-24,-20, -7,-15,  3,-12, -9, -4,-12, 10, -3, -2, -6,-11,-29,-14, 14;
/M: SY='L';  M=-10,-29,-21,-31,-21,  8,-30,-18, 22,-28, 45, 25,-28,-28,-18,-20,-28,-10, 11,-20,  0,-20;
/M: SY='S';  M=  2,  4,-13, -2, -4,-16, -9, -3,-17, -9,-22,-15, 12,-12, -3, -8, 26, 26,-10,-36,-13, -4;
/M: SY='R';  M= -6,  0,-23, -3, -4, -7,-16, -8,-21,  6,-16,-12,  2,-17, -5, 16, -3, -3,-14,-20, -7, -5;
/M: SY='L';  M=  1,-16,-18,-22,-16,  0,-20,-12,  8,-18, 20, 14,-15,-22,-12,-15,-13, -3,  3,-19,  0,-14;
/M: SY='R';  M=-16,-11,-28,-11, -2,-19,-21, -5,-24, 28,-18, -8, -3,-20,  6, 55,-10, -9,-13,-21,-10, -2;
/M: SY='A';  M= 15, -3,-15, -9, -6,-18, -6,-12, -9, -6,-16, -7,  4,-13, -4,-10, 15,  5, -5,-30,-16, -5;
/M: SY='K';  M=  4, -2,-20, -7,  1,-15,-14,-12,-15,  8,-18,-10,  2,-12, -2,  0,  5,  3,-10,-24,-11, -1;
/M: SY='L';  M=-12,-22,-24,-25,-15, 11,-30,-12, 15,-20, 19, 12,-20,-23,-14,-17,-18, -5,  6,-11, 14,-16;
/M: SY='V';  M= -2,-30,-14,-32,-30,  0,-32,-30, 34,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 46,-28, -8,-30;
/M: SY='S';  M= -4,  1,-10, -3, -3,-21, -4, -7,-25,  4,-27,-17, 11,-17,  0, 12, 14,  3,-17,-33,-18, -3;
/M: SY='N';  M= -9, 22,-25, 17, 15,-26,  7,  1,-28, -1,-27,-21, 28,-13,  2, -4,  5, -7,-30,-33,-22,  9;
/M: SY='E';  M= -3,  0, -2,  0,  6,-25, -5,-12,-28, -2,-22,-18, -1,-10, -4, -6,  0, -6,-20,-31,-22,  0;
/M: SY='T';  M= -3,  3,-17, -5, -5,-15,-16,-10, -4, -8,-13, -8,  9,-16, -3, -9,  9, 12, -2,-32,-14, -4;
/M: SY='L';  M= -6,-29,-21,-32,-22, 11,-29,-22, 21,-29, 38, 16,-26,-27,-21,-22,-25, -9, 12,-18,  1,-22;
/M: SY='A';  M= 17, -4,-19, -9, -8,-13,-10, -9, -9, -5,-12, -9, -3,-15, -7,-12,  3, -2, -6,-16, -2, -9;
/M: SY='R';  M=-11, -4,-28, -3,  8,-22,-14,  9,-22, 11,-19, -8, -1,-14, 13, 14, -4,-10,-21,-20, -3,  9;
/M: SY='L';  M=-11,-31,-26,-35,-26, 11,-31,-24, 21,-26, 23, 14,-27,-27,-21,-22,-26,-12, 12,  7,  6,-24;
/M: SY='A';  M= 24,-10,-16,-15,-13,-22, 20,-19,-18,-14,-18,-13, -5,-15,-13,-18, 10, -3, -7,-24,-22,-13;
/M: SY='R';  M=-12,-13,-26,-16, -6, -8,-25,-12, -4,  9, -7,  2, -9,-17, -3, 15,-11, -5, -2,-20, -5, -6;
/M: SY='K';  M=-12, -6,-26, -4,  4,-13,-23, -5,-11,  8, -5,  0, -9,-17,  3,  6,-12, -9, -9,-18,  0,  3;
/M: SY='Y';  M=-15,-27,-14,-31,-24, 24,-28,-11,  3,-23, 15,  7,-25,-30,-21,-18,-25,-12, -3, 14, 25,-22;
/M: SY='G';  M= -6,  8,-28,  6,  8,-28, 22, -7,-32, -2,-27,-19, 14,-14, -2, -6,  2,-12,-29,-27,-23,  3;
/M: SY='L';  M=-13,-31,-25,-36,-26, 24,-32,-23, 21,-29, 27, 12,-26,-27,-25,-23,-26,-11, 10,  0,  9,-25;
/M: SY='H';  M= -6,  4,-30,  7,  0,-29,  4, 10,-28, -8,-26,-15,  5,  5,  0,-11, -2,-12,-27,-29,-16, -2;
/M: SY='E';  M=-12,  7,-31, 14, 23,-32,-18, -4,-30, 22,-26,-15,  1,  0, 14, 14, -5,-10,-26,-26,-16, 18;
/M: SY='Y';  M=-16,-18,-15,-22,-18, 24,-27,  3, -6,-13,  1, -1,-15,-26,-16,-10,-15, -6, -7,  0, 31,-18;
/M: SY='L';  M= -4,-28,-20,-32,-23, 10,-29,-22, 22,-26, 30, 17,-25,-26,-21,-21,-21, -8, 16,-18,  0,-22;
/M: SY='Q';  M= -9,-16,-26,-17, -7,-13,-24,-13, -3,  1, -2,  1,-13,-19,  3,  2,-12, -9, -4, -8, -4, -2;
/M: SY='L';  M= -2,-19,-19,-22,-15, -2,-23, -8,  8,-22, 21,  8,-16,-22,-13,-17,-11, -1,  4,-24, -3,-15;
/M: SY='G';  M= -1,  0,-20, -4, -4,-20, 15,-11,-22,-10,-21,-11,  6,-14, -6,-11, 11,  5,-17,-29,-19, -5;
/M: SY='P';  M= -8,-11,-11,-12,-10, -6,-19,-12,-14, -8,-18,-12, -6,  6,-12,-12, -2, -3,-12,-24, -7,-12;
/M: SY='G';  M=  6, -6,-24, -4,-10,-24, 23,-17,-25,-15,-18,-15, -4, -7,-13,-18,  2, -9,-19,-25,-23,-12;
/M: SY='E';  M= 10, -5,-21, -4, 16,-20, -7,-12,-15, -5, -8,-10, -9,-11, -1,-12, -1, -7,-10,-25,-18,  7;
/M: SY='L';  M=-10,-15,-26,-16,  1, -9,-27,-12,  7, -8, 13, 11,-15,-17,  0, -9,-16,-10, -1,-22, -6, -1;
/M: SY='K';  M= -8, -4,-13, -3, -1,-18,-20, -9,-21, 16,-15, -9, -6,-18, -2, 11,-10, -9,-14,-20, -4, -2;
/M: SY='D';  M=-10, 17,-22, 21, 10,-25,-13, 15,-27, -4,-23,-17, 13,-12,  2, -6,  9,  5,-21,-35,-10,  5;
/I:         MD=-15;
/M: SY='G';  M= -2, -5,-25, -9, -7,-19,  6, -9,-19,  1,-18, -6, -1,-15,  0, -3, -6,-11,-18, -2,-10, -3; D=-1;
/I:         MD=-15;
/M: SY='G';  M= -4,-11, -7,-15,-17,-14,  8,-17, -8,-19, -8, -6, -3,-20,-15,-18, -3, -8, -7,-25,-16,-17; D=-1;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='Y';  M=-11, -8,-22,-14,-10,  4,-20, -7, -1,  2, -6, -1, -2,-17, -7,  3,-10, -7, -4,-10,  7,-10; D=-1;
/I:         DM=-15;
/M: SY='R';  M=-10, -1,-26,  3,  8,-21, -1, -7,-25,  7,-14,-12, -1,-13,  1, 12, -6,-11,-20,-22,-15,  4; D=-1;
/I:         DM=-15;
/M: SY='R';  M= -5, -6,-19, -6, -1,-18,-13, -8,-18, 14,-20,-10,  0,-14,  2, 22,  6,  1, -8,-25,-12, -1; D=-1;
/I:         DM=-15;
/M: SY='E';  M= -9, -7,-26, -5,  9,-19,-21,-10,-10, -3,-10, -7, -7,  4,  2, -3, -7, -7,-10,-28,-16,  4;
/M: SY='K';  M= -5,  3,-23,  1,  5,-25,-12, -7,-26, 25,-29,-14,  9,-12,  6, 18,  7,  0,-18,-28,-14,  5;
/M: SY='I';  M= -4,-23,-21,-29,-21,  5,-28,-22, 17,-19, 14,  8,-18,-22,-18,-13,-13, -2, 14,-19, -2,-21;
/M: SY='I';  M=-10,-27,-23,-32,-24,  6,-31,-16, 28,-23, 26, 24,-24,-25,-16,-20,-22, -9, 18,-16,  7,-22;
/M: SY='A';  M= 36, -9,-14,-16,-11,-22, 14,-19,-17,-12,-16,-13, -6,-12,-11,-19, 11, -2, -7,-22,-22,-11;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='V';  M=  2,-16, -6,-23,-19, -7,-23,-22, 11,-17,  1,  6,-13,-19,-15,-18,  1, 11, 16,-28,-10,-18;
/M: SY='F';  M=-12,-29,-19,-33,-26, 36,-30,-19, 13,-26, 20,  8,-25,-30,-29,-19,-20, -8, 14, -6, 17,-26;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='A';  M= 38, -7,-10,-15, -8,-19, -2,-18,-12,-10,-14,-12, -5,-10, -8,-17, 17,  8, -2,-25,-19, -8;
/M: SY='L';  M= -9,-23,-22,-26,-20,  7,-27,-10, 17,-19, 18, 18,-20,-25,-13,-17,-15, -6, 11,-13, 13,-18;
/M: SY='I';  M= -2,-28,-23,-34,-26,  0,-32,-27, 35,-26, 21, 15,-23,-23,-21,-25,-17, -7, 27,-22, -4,-26;
/M: SY='G';  M=  4,-11,-14,-13,-20,-28, 54,-21,-36,-20,-27,-19, -3,-21,-20,-21,  0,-17,-25,-23,-29,-20;
/M: SY='A';  M= 41,-10,-14,-18,-12,-22, 12,-20,-15,-12,-14,-12, -8,-12,-12,-20,  8, -4, -5,-20,-22,-12;
/M: SY='I';  M= -9,-28, -9,-34,-26,  2,-33,-24, 27,-28, 27, 18,-25,-27,-20,-24,-22, -9, 18,-24, -4,-25;
/M: SY='Y';  M=-15,-22,-25,-26,-21, 27,-28,  0,  8,-17,  9,  9,-19,-27,-15,-15,-17, -8,  0,  7, 41,-20;
/M: SY='L';  M=-10,-22,-23,-20, -4,  1,-29,-17, 12,-22, 33, 12,-23,-23,-12,-17,-23,-10,  3,-22, -4, -8;
/M: SY='D';  M=-18, 46,-28, 64, 18,-38, -9, -1,-38, -1,-30,-29, 19,-10,  0,-10,  3, -8,-28,-40,-20,  9;
/M: SY='S';  M=  3, -4,-17, -4, -6,-18, -3,-11,-11,-11,-12, -4, -2,-16, -3,-12, 10,  2, -6,-30,-16, -5;
/M: SY='G';  M= -3, -6,-31, -3,-11,-32, 46,-16,-36,-15,-29,-19, -1, -7,-10,-16, -1,-17,-30,-22,-27,-11;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_01 which contains 572'970 sequence entries.

Total number of hits	620 in 567 different sequences
Number of true positive hits	620 in 567 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	4
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	99.36 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	2
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	K_Hofmann
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	RNase III
Version [info]	5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

567 sequences

A464_PBCV1  (Q98514), DCL1_ARATH  (Q9SP32), DCL1_ASPCL  (A1CBC9),

DCL1_ASPFU  (Q4WVE3), DCL1_ASPNC  (A2RAF3), DCL1_ASPOR  (Q2U6C4), 
DCL1_ASPTN  (Q0CW42), DCL1_CHAGB  (Q2H0G2), DCL1_COCIM  (Q1DKI1), 
DCL1_CRYPA  (Q2VF19), DCL1_NEOFI  (A1DE13), DCL1_NEUCR  (Q7S8J7), 
DCL1_ORYSJ  (Q8LMR2), DCL1_PHANO  (Q0UI93), DCL1_PYRO7  (A4RKC3), 
DCL21_ASPNC (A2R345), DCL22_ASPNC (A2QX45), DCL2A_ORYSJ (Q10HL3), 
DCL2B_ORYSJ (Q69LX2), DCL2_ARATH  (Q3EBC8), DCL2_ASPCL  (A1C9M6), 
DCL2_ASPFU  (Q4WA22), DCL2_ASPOR  (Q2UNX5), DCL2_ASPTN  (Q0CEI2), 
DCL2_COCIM  (Q1DW80), DCL2_CRYPA  (Q2VF18), DCL2_EMENI  (P0C5H7), 
DCL2_NEOFI  (A1D9Z6), DCL2_NEUCR  (Q7SCC1), DCL2_PHANO  (Q0UL22), 
DCL2_PYRO7  (A4RHU9), DCL3A_ORYSJ (Q5N870), DCL3B_ORYSJ (Q7XD96), 
DCL3_ARATH  (Q9LXW7), DCL4_ARATH  (P84634), DCL4_ORYSJ  (A7LFZ6), 
DCL_GIAIC   (A8BQJ3), DCR1_CAEEL  (P34529), DCR1_DROME  (Q9VCU9), 
DCR1_SCHPO  (Q09884), DCR2_DROME  (A1ZAW0), DICER_BOVIN (Q6TUI4), 
DICER_CHICK (Q25BN1), DICER_CRIGR (A0MQH0), DICER_DANRE (Q6TV19), 
DICER_HUMAN (Q9UPY3), DICER_MOUSE (Q8R418), DICER_XENTR (B3DLA6), 
NFD2_ARATH  (Q9FYL8), PAC1_SCHPO  (P22192), RM03_NEUCR  (Q7SA88), 
RM03_SCHPO  (O43042), RM03_YEAST  (P36516), RNC1_ARATH  (Q9SZV0), 
RNC1_MAIZE  (A6YSL1), RNC1_NOSS1  (Q8Z023), RNC1_ORYSJ  (Q8S1Z0), 
RNC1_SYNY3  (P74368), RNC2_NOSS1  (Q8YPT4), RNC2_SYNY3  (Q55637), 
RNC_ACIAD   (Q6F9C2), RNC_ACIB3   (B7GYT0), RNC_ACIBS   (B0VTM5), 
RNC_ACIBT   (A3M7P2), RNC_ACIBY   (B0VCU0), RNC_ACIP2   (F0KKL2), 
RNC_ACTP2   (A3MZQ9), RNC_ACTPJ   (B0BUA6), RNC_ACTSZ   (A6VLV8), 
RNC_AGRFC   (Q8UGK2), RNC_ALBFT   (Q21XN1), RNC_ALCBS   (Q0VP19), 
RNC_ALIB4   (A8EV88), RNC_ALIF1   (Q5E314), RNC_ALKEH   (Q0A8Z1), 
RNC_ALLAM   (B9JUN7), RNC_ANAMF   (B9KGT5), RNC_ANAMM   (Q5P9U8), 
RNC_ANAPZ   (Q2GIW0), RNC_ANOFW   (B7GGE9), RNC_AQUAE   (O67082), 
RNC_AROAE   (Q5P086), RNC_AYWBP   (Q2NJY3), RNC_AZOC5   (A8I3B5), 
RNC_AZOPC   (B6YQI6), RNC_AZOVD   (C1DQS2), RNC_BACAA   (C3P5Q0), 
RNC_BACAC   (C3L778), RNC_BACAN   (Q81WI8), RNC_BACC0   (B7JJT6), 
RNC_BACC1   (Q732M1), RNC_BACC2   (B7IUK8), RNC_BACC3   (C1EP73), 
RNC_BACC4   (B7HDX2), RNC_BACC7   (B7HLI2), RNC_BACCN   (A7GRH9), 
RNC_BACCQ   (B9IVD8), RNC_BACCR   (Q819V8), RNC_BACCZ   (Q636H7), 
RNC_BACFN   (Q5LIS2), RNC_BACFR   (Q64ZV9), RNC_BACHK   (Q6HEW6), 
RNC_BACLD   (Q65JQ5), RNC_BACMK   (A9VT87), RNC_BACSU   (P51833), 
RNC_BACTN   (Q8A2E8), RNC_BACVZ   (A7Z4L3), RNC_BARBK   (A1US36), 
RNC_BARHE   (Q6G459), RNC_BARQU   (Q6G082), RNC_BART1   (A9IRN0), 
RNC_BDEBA   (Q6MLR5), RNC_BIFLO   (Q8G7H1), RNC_BLOFL   (Q7VRR0), 
RNC_BLOPB   (Q492D1), RNC_BORA1   (Q2KWY0), RNC_BORAP   (Q0SMF0), 
RNC_BORBR   (Q7WD32), RNC_BORBU   (O51648), RNC_BORGP   (Q660G7), 
RNC_BORPA   (Q7W5J6), RNC_BORPD   (A9IIJ2), RNC_BORPE   (Q7VW39), 
RNC_BRADU   (O69161), RNC_BRUA1   (B2SAD9), RNC_BRUA2   (Q2YN02), 
RNC_BRUAB   (Q57E81), RNC_BRUC2   (A9MA35), RNC_BRUMB   (C0RI03), 
RNC_BRUME   (P66664), RNC_BRUSI   (B0CKY7), RNC_BRUSU   (P66665), 
RNC_BUCA5   (B8D951), RNC_BUCAI   (P57346), RNC_BUCAP   (Q8K9R1), 
RNC_BUCAT   (B8D7F5), RNC_BUCBP   (P59476), RNC_BUCCC   (Q057R4), 
RNC_CAEBR   (Q61XX9), RNC_CAEEL   (O01326), RNC_CALS4   (Q8R9W3), 
RNC_CAMC1   (A8Z6F6), RNC_CAMC5   (A7H186), RNC_CAMFF   (A0RRM7), 
RNC_CAMJ8   (A8FNU7), RNC_CAMJD   (A7H5Y2), RNC_CAMJE   (Q9PM40), 
RNC_CAMJR   (Q5HSF8), RNC_CARHZ   (Q3AC58), RNC_CAUSK   (B0T3I0), 
RNC_CAUVC   (Q9A805), RNC_CAUVN   (B8H627), RNC_CERS1   (A3PGF8), 
RNC_CERS4   (Q3J5W1), RNC_CERS5   (A4WVP5), RNC_CERSK   (B9KSA7), 
RNC_CHLAA   (A9WJ69), RNC_CHLAB   (Q5L6E3), RNC_CHLAD   (B8GAM6), 
RNC_CHLCH   (Q3AQ14), RNC_CHLCV   (Q823R4), RNC_CHLFF   (Q253V2), 
RNC_CHLL3   (Q3B6L3), RNC_CHLMU   (Q9PK97), RNC_CHLPN   (Q9Z9C7), 
RNC_CHLSY   (B9LB70), RNC_CHLT2   (B0B7L3), RNC_CHLTA   (Q3KM65), 
RNC_CHLTB   (B0BBS8), RNC_CHLTE   (Q8KAN7), RNC_CHLTR   (O84299), 
RNC_CHRVO   (Q7NWC4), RNC_CLOAB   (Q97IA4), RNC_CLOB8   (A6LSM2), 
RNC_CLOBA   (B2V4D6), RNC_CLOBB   (B2TJ22), RNC_CLOK1   (B9E1G8), 
RNC_CLOK5   (A5N807), RNC_CLOPE   (Q8XJN8), RNC_CLOTE   (Q895M9), 
RNC_COLP3   (Q47WP5), RNC_CORDI   (Q6NGH3), RNC_COREF   (Q8FP16), 
RNC_CORGL   (Q8NNV6), RNC_CORJK   (Q4JUY7), RNC_COXB1   (B6J4J9), 
RNC_COXB2   (B6IYZ9), RNC_COXBN   (A9KFA0), RNC_COXBR   (A9N942), 
RNC_COXBU   (P51837), RNC_CUPMC   (Q1LKN1), RNC_CUPNH   (Q0K8N3), 
RNC_CUPPJ   (Q46Z18), RNC_CUPTR   (B3R1Z9), RNC_DECAR   (Q47EF7), 
RNC_DEHM1   (Q3Z7Q8), RNC_DEHMC   (Q3ZXY9), RNC_DELAS   (A9BNJ5), 
RNC_DESPS   (Q6ANV0), RNC_DESRM   (A4J683), RNC_DINSH   (A8LLD9), 
RNC_ECO24   (A7ZQ11), RNC_ECO27   (B7UH07), RNC_ECO45   (B7MIQ2), 
RNC_ECO55   (B7LDG0), RNC_ECO57   (P0A7Y2), RNC_ECO5E   (B5Z141), 
RNC_ECO7I   (B7NRM0), RNC_ECO81   (B7MYJ8), RNC_ECO8A   (B7M8I0), 
RNC_ECOBW   (C4ZYJ0), RNC_ECODH   (B1XB41), RNC_ECOHS   (A8A377), 
RNC_ECOK1   (A1AE97), RNC_ECOL5   (Q0TES1), RNC_ECOL6   (P0A7Y1), 
RNC_ECOLC   (B1IVR0), RNC_ECOLI   (P0A7Y0), RNC_ECOLU   (B7N6F5), 
RNC_ECOSE   (B6I5E1), RNC_ECOSM   (B1LP80), RNC_ECOUT   (Q1R8G6), 
RNC_ECTM1   (A4XSC4), RNC_EDWI9   (C5B8Y2), RNC_EHRCJ   (Q3YQX7), 
RNC_EHRCR   (Q2GFE4), RNC_EHRRG   (Q5FGH0), RNC_EHRRW   (Q5HA74), 
RNC_ENT38   (A4WDD8), RNC_ENTFA   (Q82ZG1), RNC_ERWT9   (B2VI46), 
RNC_ESCF3   (B7LUZ7), RNC_FLAPJ   (A6GW45), RNC_FRAP2   (B0TXH8), 
RNC_FRAT1   (Q14G66), RNC_FRATF   (A7NAR0), RNC_FRATH   (Q2A4N2), 
RNC_FRATM   (B2SFY4), RNC_FRATN   (A0Q7W6), RNC_FRATO   (Q0BN07), 
RNC_FRATT   (Q5NER3), RNC_FRATW   (A4IWK9), RNC_FRG3G   (Q6GZP5), 
RNC_FUSNN   (Q8RGX3), RNC_GEOKA   (Q5L0Q3), RNC_GEOMG   (Q39T82), 
RNC_GEOSL   (Q74AX1), RNC_GEOSW   (C5D8T6), RNC_GEOTN   (A4IM67), 
RNC_GLAP5   (B8F3C7), RNC_GLOVI   (Q7NH89), RNC_HAEDU   (Q7VL75), 
RNC_HAEI8   (Q4QPN0), RNC_HAEIE   (A5UBC4), RNC_HAEIG   (A5UFI8), 
RNC_HAEIN   (P44441), RNC_HAHCH   (Q2SL32), RNC_HALH5   (Q9KA05), 
RNC_HAMD5   (C4K3Z3), RNC_HELAH   (Q17XJ6), RNC_HELHP   (Q7VIA9), 
RNC_HELMI   (B0TGW4), RNC_HELP2   (B6JLQ0), RNC_HELPG   (B5Z735), 
RNC_HELPJ   (Q9ZLH2), RNC_HELPS   (B2UTG4), RNC_HELPY   (P56118), 
RNC_HISS2   (B0USS1), RNC_HUMAN   (Q9NRR4), RNC_HYDS0   (B4U7T8), 
RNC_IDILO   (Q5R106), RNC_IIV3(Q196V9), RNC_IIV6(O55748), 
RNC_JANSC   (Q28V23), RNC_KLEP3   (B5XNH0), RNC_KLEP7   (A6TCI1), 
RNC_LACAC   (Q5FJJ7), RNC_LACJO   (Q74IP8), RNC_LACLA   (Q9CHD0), 
RNC_LACLM   (A2RLZ8), RNC_LACLS   (Q030F9), RNC_LACPL   (Q88WK0), 
RNC_LATSS   (Q38XR8), RNC_LEGPA   (Q5X446), RNC_LEGPC   (A5ID21), 
RNC_LEGPH   (Q5ZUD5), RNC_LEGPL   (Q5WVI4), RNC_LEIXX   (Q6AFJ4), 
RNC_LEPBJ   (Q04R64), RNC_LEPBL   (Q053L4), RNC_LEPIC   (Q75FW5), 
RNC_LEPIN   (Q8EXX3), RNC_LEUCK   (B1N016), RNC_LEUMM   (Q03VW5), 
RNC_LIGS1   (Q1WUA0), RNC_LIMF3   (B2GD42), RNC_LIMRD   (A5VKP2), 
RNC_LIMRJ   (B2G826), RNC_LISIN   (Q92AK3), RNC_LISMC   (C1KWA4), 
RNC_LISMF   (Q71YL2), RNC_LISMH   (B8DDU8), RNC_LISMO   (Q8Y691), 
RNC_LISW6   (A0AJR0), RNC_MAGMM   (A0L633), RNC_MANSM   (Q65VN5), 
RNC_MARMS   (A6VUP6), RNC_MESFL   (Q6F1N5), RNC_METCA   (Q608M7), 
RNC_METSB   (B8EK13), RNC_MIMIV   (Q5UQT7), RNC_MOOTA   (Q2RJX2), 
RNC_MOUSE   (Q5HZJ0), RNC_MYCBO   (P66667), RNC_MYCCT   (Q2SRZ8), 
RNC_MYCGA   (Q7NAZ2), RNC_MYCGE   (P47607), RNC_MYCGF   (D3FI09), 
RNC_MYCGH   (D3FH24), RNC_MYCLE   (O69469), RNC_MYCM1   (Q6KHN3), 
RNC_MYCMS   (Q6MTC9), RNC_MYCPA   (Q73VL8), RNC_MYCPB   (E1QCT1), 
RNC_MYCPN   (P75233), RNC_MYCS2   (A0QV20), RNC_MYCS5   (Q4A589), 
RNC_MYCTO   (P9WH02), RNC_MYCTU   (P9WH03), RNC_MYXXD   (Q1D5X9), 
RNC_NATTJ   (B2A2N1), RNC_NEIG1   (Q5F9X7), RNC_NEIG2   (B4RJT7), 
RNC_NEIM8   (C9X0M5), RNC_NEIMA   (Q9JVD3), RNC_NEIMB   (Q9K0C8), 
RNC_NITEC   (Q0AF70), RNC_NITEU   (Q820I0), RNC_NITOC   (Q3J8D5), 
RNC_NITSB   (A6Q1H0), RNC_NITV2   (Q72C44), RNC_NITV9   (B8DPB3), 
RNC_NITWN   (Q3SRB3), RNC_NOCFA   (Q5YS08), RNC_OCEIH   (Q8ER05), 
RNC_OENOB   (Q04GL2), RNC_OLEA2   (Q310Z1), RNC_ONYPE   (Q6YPW7), 
RNC_PANAM   (D4GKM1), RNC_PARUW   (Q6MEK1), RNC_PASMU   (P57805), 
RNC_PECAS   (Q6D219), RNC_PECCP   (C6DC00), RNC_PEDPA   (Q03FX0), 
RNC_PELTS   (A5D1H6), RNC_PELUB   (Q4FLS9), RNC_PHEZH   (B4RCU4), 
RNC_PHOLL   (Q7N1X5), RNC_PHOPR   (Q6LMS2), RNC_PHOV8   (A6KZ76), 
RNC_PHYMT   (B3R075), RNC_PROMA   (G3XCR8), RNC_PROMH   (B4F047), 
RNC_PSE14   (Q48EV3), RNC_PSEA7   (A6VAK6), RNC_PSEA8   (B7UYX2), 
RNC_PSEAB   (Q02HS2), RNC_PSEAE   (Q9XCX9), RNC_PSEE4   (Q1I5V8), 
RNC_PSEF5   (Q4KHT1), RNC_PSEFS   (C3K6Y7), RNC_PSELT   (A8F397), 
RNC_PSEP1   (A5W8F2), RNC_PSEPF   (Q3KHL9), RNC_PSEPG   (B0KV27), 
RNC_PSEPK   (Q88MY5), RNC_PSEPW   (B1J4E0), RNC_PSESM   (Q87XG1), 
RNC_PSET1   (Q3IDL2), RNC_PSEU2   (Q4ZPE1), RNC_PSYA2   (Q4FUV6), 
RNC_PSYIN   (A1SSM8), RNC_RALN1   (Q8Y0I1), RNC_RALPJ   (B2U981), 
RNC_RHIE6   (B3PUN8), RNC_RHIEC   (Q2KAE3), RNC_RHIJ3   (Q1MJ54), 
RNC_RHILO   (Q985A6), RNC_RHILW   (B5ZW73), RNC_RHIME   (Q92R47), 
RNC_RHIR8   (B9JC73), RNC_RHOBA   (Q7UGZ7), RNC_RHOCA   (Q52698), 
RNC_RHOPA   (Q6N6C1), RNC_RICAE   (C3PMF3), RNC_RICAH   (A8GM79), 
RNC_RICB8   (A8GYE2), RNC_RICBR   (Q1RHA2), RNC_RICCK   (A8EXI3), 
RNC_RICCN   (Q92JB0), RNC_RICFE   (Q4UKA8), RNC_RICM5   (A8F0M2), 
RNC_RICPR   (Q9ZE31), RNC_RICPU   (C4K1R3), RNC_RICRO   (B0BW84), 
RNC_RICRS   (A8GQT8), RNC_RICTY   (Q68XY5), RNC_ROSCS   (A7NGC5), 
RNC_ROSDO   (Q16AI6), RNC_ROSHA   (G2SYN4), RNC_ROSS1   (A5V230), 
RNC_RUEPO   (Q5LNK5), RNC_SALCH   (Q57LD0), RNC_SALEP   (B5QTU8), 
RNC_SALG2   (B5RD49), RNC_SALPA   (Q5PIG5), RNC_SALPK   (B5BAT0), 
RNC_SALTI   (Q8Z4K4), RNC_SALTY   (Q56056), RNC_SERP5   (A8GI25), 
RNC_SHEAM   (A1S3Y1), RNC_SHEB2   (B8EBQ2), RNC_SHEB5   (A3D1V6), 
RNC_SHEB8   (A6WKQ7), RNC_SHEB9   (A9L5N6), RNC_SHEDO   (Q12KI1), 
RNC_SHEFN   (Q07YZ6), RNC_SHEHH   (B0TIV7), RNC_SHELP   (A3QBS7), 
RNC_SHEON   (Q8EH81), RNC_SHEPA   (A8H1C7), RNC_SHEPC   (A4Y4K4), 
RNC_SHEPW   (B8CQJ5), RNC_SHESA   (A0KZN2), RNC_SHESH   (A8FSD6), 
RNC_SHESM   (Q0HG98), RNC_SHESR   (Q0HSJ1), RNC_SHESW   (A1RMC7), 
RNC_SHEWM   (B1KI57), RNC_SHIB3   (B2TXY0), RNC_SHIBS   (Q31XS0), 
RNC_SHIDS   (Q32CV4), RNC_SHIF8   (Q0T1T8), RNC_SHIFL   (P0A7Y3), 
RNC_SHISS   (Q3YYU9), RNC_SHOC1   (Q5WFM6), RNC_SINFN   (C3M8S4), 
RNC_SINMW   (A6U7A8), RNC_SODGM   (Q2NS13), RNC_SOLUE   (Q027L3), 
RNC_SPHAL   (Q1GTU3), RNC_SPICI   (Q53844), RNC_STAA1   (A7X1J9), 
RNC_STAA2   (A6U152), RNC_STAA3   (Q2FHK5), RNC_STAA8   (Q2FZ50), 
RNC_STAA9   (A5ISB8), RNC_STAAB   (Q2YXI3), RNC_STAAC   (Q5HGJ9), 
RNC_STAAE   (A6QGD3), RNC_STAAM   (Q931T1), RNC_STAAN   (P66668), 
RNC_STAAR   (Q6GHK2), RNC_STAAS   (Q6G9Y0), RNC_STAAT   (A8Z3R9), 
RNC_STAAW   (P66669), RNC_STACT   (B9DPJ2), RNC_STAEQ   (Q5HPV8), 
RNC_STAES   (Q8CPI1), RNC_STAHJ   (Q4L5T5), RNC_STAS1   (Q49X17), 
RNC_STRA1   (Q3K1Y2), RNC_STRA3   (Q8E680), RNC_STRA5   (Q8E0K7), 
RNC_STRAW   (Q82JT9), RNC_STRCO   (Q9ZBQ7), RNC_STRE4   (C0M8Y3), 
RNC_STRGC   (A8AWC2), RNC_STRMU   (Q8DT66), RNC_STRP1   (P66670), 
RNC_STRP2   (Q04K72), RNC_STRP3   (P0DF14), RNC_STRP4   (B5E4Y2), 
RNC_STRP6   (Q5XDA6), RNC_STRP7   (C1C7M6), RNC_STRP8   (P66672), 
RNC_STRPB   (Q1JCZ9), RNC_STRPC   (Q1JMX4), RNC_STRPD   (Q1JI19), 
RNC_STRPF   (Q1J7V3), RNC_STRPG   (A2RFW8), RNC_STRPI   (B1IC43), 
RNC_STRPJ   (B8ZJR8), RNC_STRPM   (Q48UR6), RNC_STRPN   (Q97QG6), 
RNC_STRPQ   (P0DF15), RNC_STRPS   (B2IPN5), RNC_STRPZ   (B5XKB7), 
RNC_STRR6   (Q8DPJ8), RNC_STRS7   (C0MCR4), RNC_STRSV   (A3CP46), 
RNC_STRT1   (Q5LZ68), RNC_STRT2   (Q5M3S3), RNC_STRTD   (Q03K17), 
RNC_STRU0   (B9DRH1), RNC_STRZJ   (C1CEK4), RNC_STRZP   (C1CKY7), 
RNC_STRZT   (C1CR56), RNC_SULNB   (A6QCJ0), RNC_SYMTH   (Q67PF5), 
RNC_SYNC1   (Q3A4Q8), RNC_SYNFM   (A0LGM1), RNC_SYNWW   (Q0AYW0), 
RNC_THEFY   (Q47S78), RNC_THEMA   (Q9X0I6), RNC_THENN   (B9K9K8), 
RNC_THEP1   (A5IN74), RNC_THESQ   (B1LCY9), RNC_THIDA   (Q3SH50), 
RNC_TREDE   (Q73NX5), RNC_TREPA   (O83787), RNC_TREPS   (B2S448), 
RNC_TRES6   (F2NV13), RNC_TROW8   (Q83I82), RNC_TROWT   (Q83FY2), 
RNC_UREPA   (Q9PQT8), RNC_VARPS   (C5CSF5), RNC_VEREI   (A1WMW1), 
RNC_VIBA3   (B7VK79), RNC_VIBC1   (A7MZA8), RNC_VIBC3   (A5F5H8), 
RNC_VIBCH   (Q9KPB2), RNC_VIBCM   (C3LR04), RNC_VIBPA   (Q87LN9), 
RNC_VIBVU   (Q8DC76), RNC_VIBVY   (Q7MHN8), RNC_WIGBR   (Q8D305), 
RNC_WOLPM   (Q73FT3), RNC_WOLPP   (B3CMS0), RNC_WOLSU   (Q7M840), 
RNC_WOLTR   (Q5GTI3), RNC_WOLWR   (C0R4Q8), RNC_XANAC   (Q8PMV0), 
RNC_XANC8   (Q4USF7), RNC_XANCP   (Q8PB52), RNC_XANE5   (Q3BVV6), 
RNC_XANOR   (Q5H1R2), RNC_XYLF2   (B2I604), RNC_XYLFA   (Q9PB98), 
RNC_XYLFM   (B0U3D8), RNC_XYLFT   (Q87C06), RNC_YERE8   (A1JKK3), 
RNC_YERP3   (A7FFT9), RNC_YERPA   (Q1C555), RNC_YERPE   (Q8ZD72), 
RNC_YERPG   (A9R402), RNC_YERPN   (Q1CKE4), RNC_YERPP   (A4TKX8), 
RNC_YERPS   (Q667V1), RNC_ZUNPS   (D5BDP9), RNC_ZYMMO   (Q9Z5U2), 
RNT1_YEAST  (Q02555), RTL1_ORYSJ  (Q5JK90), RTL2_ARATH  (Q9LTQ0), 
RTL2_ORYSJ  (Q6ATG6), RTL3_ARATH  (Q9FKF0), RTL3_ORYSJ  (Q69KJ0)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences

4 sequences

RM44_BOVIN  (Q2KIS2), RM44_HUMAN  (Q9H9J2), RM44_MOUSE  (Q9CY73),

RM44_PONAB  (Q5REY8)

» more

PDB
[Detailed view]

143 PDB

1I4S; 1JFZ; 1O0W; 1RC5; 1RC7; 1YYK; 1YYO; 1YYW; 1YZ9; 2A11; 2EB1; 2EZ6;
» more