PROSITE entry PS50097

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50097
Entry name [info]	BTB
Accession [info]	PS50097
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-DEC-2001 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC50097
Associated ProRule [info]	PRU00037

Name and characterization of the entry

Description [info]

BTB domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=67;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=62;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.9751000; R2=0.0206820; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2912.1987305; R2=2.5245535; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=364; H_SCORE=3831; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=268; H_SCORE=3589; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MM=1; M0=-2;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='C';  M= -6,-10, 28,-14, -9,-15,-20,-14,-19,-15,-17,-14, -8,-19,-14,-15,  0,  0, -9,-32,-17,-12;
/M: SY='D';  M=-16, 41,-28, 53, 15,-34,-11, -1,-33,  0,-27,-25, 21,-11,  0, -8,  2, -6,-26,-38,-19,  7;
/M: SY='V';  M=  2,-23, -8,-28,-24, -1,-24,-25, 16,-20,  7,  6,-20,-25,-23,-20,-10, -4, 24,-23, -9,-24;
/M: SY='T';  M= -2,-13,-18,-19,-13, -7,-24,-19,  6, -8, -2,  1,-11,-17,-11,-10, -1, 10, 10,-24, -6,-13;
/M: SY='L';  M=-11,-30,-22,-33,-24, 15,-32,-23, 25,-29, 35, 17,-26,-27,-23,-22,-24, -9, 16,-17,  3,-24;
/M: SY='V';  M=  0,-11,-18,-13,-10,-12,-20,-13,  1, -6, -4,  2,-10,-19, -6, -7, -4, -2,  8,-25, -9, -9;
/M: SY='V';  M=  1,-25, -3,-29,-25, -2,-26,-26, 17,-22, 10,  7,-23,-25,-23,-22,-11, -3, 24,-27,-10,-25;
/M: SY='D';  M= -6,  7,-26,  8,  7,-25,  6, -7,-27,  0,-23,-17,  8,-13,  0, -3,  3, -6,-23,-27,-17,  3;
/I:         I=-5; MI=0; IM=0; DM=-15; MD=-15;
/M: SY='G';  M= -6,  8,-27,  8, -3,-27, 22, -7,-30, -8,-26,-19, 10,-14, -8, -9,  2, -9,-24,-28,-21, -6;
/M: SY='K';  M= -7, -4,-23, -4,  7,-23,-13, -2,-21, 10,-18, -9, -3,-12,  7,  9, -2, -4,-16,-25,-12,  6;
/M: SY='E';  M= -8, -6,-21, -8,  1,-15,-21, -7, -7, -1,-10, -5, -3,-14,  0, -1, -2, -2, -6,-26, -9, -1;
/M: SY='F';  M=-12,-28,-22,-34,-26, 31,-31,-21, 18,-26, 16,  9,-22,-27,-27,-21,-20, -9, 14, -6, 13,-26;
/M: SY='R';  M=-13, -9,-24,-10, -3,-11,-21,  7,-17,  7,-16, -4, -4, -8,  2,  9, -9, -9,-16,-20, -1, -2;
/M: SY='A';  M= 21,-15, -8,-22,-17,-10,-10,-23,  0,-15, -5, -5,-14,-18,-17,-19,  4,  6, 12,-24,-15,-17;
/M: SY='H';  M=-15,  5,-22,  2, -1,-20,-16, 65,-26, -8,-21, -5, 15,-19,  6, -2, -2,-11,-26,-32,  7,  0;
/M: SY='K';  M=-12, -5,-29, -5,  5,-25,-18, -8,-26, 34,-24, -9, -1,-14,  8, 34, -8, -8,-17,-20,-10,  5;
/M: SY='A';  M=  4,-12,-12,-16,-10, -6,-18,-14, -2,-13, -1, -2,-11,-17,-12,-13, -3,  1,  2,-24, -8,-11;
/M: SY='V';  M= -7,-26,-19,-31,-26,  7,-32,-24, 27,-23, 14, 11,-22,-25,-23,-22,-13,  0, 28,-19,  3,-26;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-21,  9,-30,-20, 22,-29, 47, 20,-29,-29,-20,-20,-29,-10, 12,-20,  0,-21;
/M: SY='A';  M= 18, -6,  0,-12, -8,-18, -6,-16,-15,-10,-18,-12, -2,-14, -8,-13, 18, 11, -5,-32,-19, -8;
/I:         I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
/M: SY='A';  M= 15, -9,-13,-14, -8,-12,-10,-12, -9, -4, -7, -3, -7,-14, -7, -9,  1, -1, -4,-20, -9, -7; D=-6;
/I:         DM=-32;
/M: SY='C';  M= -7,-11,  6,-16,-14, -5,-17,  1,-17,-10,-12, -8, -5,-24,-11, -3, -5, -7,-10,-25, -4,-13;
/M: SY='S';  M=  7,  3, -9,  4,  1,-22, -3, -9,-22,-10,-29,-20,  9, -9, -1,-11, 32, 15,-12,-39,-20,  0;
/M: SY='P';  M= -6, -1,-28,  2,  8,-26, -9,-10,-22, -3,-24,-17, -2, 20, -1, -8,  3, -2,-22,-30,-21,  2;
/M: SY='Y';  M=-14,-24,-24,-26,-23, 30,-29,  1,  6,-17,  5,  3,-22,-29,-19,-15,-18, -9,  2, 13, 45,-23;
/I:         I=-10; MI=-15; MD=-29; IM=-15;
/M: SY='F';  M=-18,-29,-19,-37,-28, 66,-29,-19,  4,-28, 14,  5,-21,-29,-35,-19,-20,-10,  2,  5, 24,-27; D=-6;
/I:         DM=-29;
/M: SY='R';  M=-10, -4,-28, -4,  4,-17,-18, -1,-22, 17,-18, -9, -2,-16,  8, 19, -7, -9,-18,-14, -2,  4;
/M: SY='A';  M=  7, -1,-18, -5, -2,-18,-13,-12,-12, -1,-12, -9, -1,-13, -3, -2,  5,  5, -6,-27,-14, -3;
/M: SY='L';  M= -8,-22,-22,-27,-17,  2,-26,-12, 15,-16, 25, 23,-21,-23,-11,-12,-20, -8,  7,-20, -1,-15;
/M: SY='F';  M=-15,-28,-21,-35,-25, 44,-30,-20,  9,-27, 19,  8,-23,-27,-29,-20,-22, -9,  5,  0, 17,-25;
/M: SY='S';  M= -4, -3,-19, -5,  0,-15,-16, -8,-13, -1,-13, -8,  1,-14,  1, -1,  3,  3,-10,-26,-10,  0;
/M: SY='N';  M= -4,  8,-20,  7,  1,-25,  2, -2,-24, -5,-23,-15, 11,-13,  1, -7,  9,  1,-19,-32,-17,  1;
/M: SY='B';  M= -6,  6,-23,  5,  6,-24, -8,  2,-22,  0,-20,-12,  6, -9,  5, -3,  1, -4,-20,-28,-13,  5;
/M: SY='F';  M=-11,-11,-25,-13,-10,  5,-15,-10,-10,-12, -7, -4, -7,-12,-11,-10, -8, -5,-11,-10,  0,-11;
/I:         MD=-15;
/M:         M= -5, -5,-14, -7, -3,-18,-13,-10,-14, -2,-14, -7, -3,-11, -3, -4, -1, -1,-11,-27,-13, -4; D=-1;
/I:         MD=-15;
/M: SY='E';  M= -8,  3,-24,  7, 17,-24,-15, -7,-19,  6,-17,-12, -1, -3,  6, -1, -1, -6,-17,-26,-15, 11; D=-1;
/I:         MD=-15;
/M: SY='H';  M= -5,  1,-20,  2,  3,-19, -9,  4,-19,  0,-18,-11,  2, -9,  1, -1,  3, -2,-15,-23, -9,  1; D=-1;
/I:         MD=-15;
/M: SY='D';  M= -5,  3,-21,  4,  4,-19,-11, -2,-15, -1,-14, -9,  3, -1,  3, -4, -1, -4,-15,-23,-12,  3; D=-1;
/I:         MD=-15;
/M: SY='Q';  M= -3,  3,-16,  3,  4,-16,-11, -4,-11, -1,-11, -5,  2, -7,  6, -3,  2,  1,-10,-20, -9,  5; D=-1;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6;
/M:         M= -5, -6,-17, -7, -2,-10,-12, -8, -1, -7, -2, -1, -5,-11, -5, -6, -5, -4, -1,-19, -8, -4; D=-1;
/I:         DM=-15;
/M: SY='I';  M= -7,-18,-14,-23,-16, -3,-27,-18, 12,-17,  4,  4,-14,-20,-14,-15, -8,  0, 12,-23, -5,-16;
/M: SY='I';  M= -8,-16,-24,-20,-11, -6,-26,-12, 11,-15,  6,  7,-13,-13, -9,-14,-11, -3,  6,-23, -4,-12;
/M: SY='L';  M=-10,-17,-19,-20,-15,  5,-26,-16,  7,-18,  9,  5,-13,-17,-16,-14,-12, -4,  4,-21, -2,-16;
/M:         M= -8, -5,-25, -6, -4,-13,-21,-11, -2, -5, -5, -4, -3,-12, -6, -6, -7, -4, -4,-25, -8, -6;
/M: SY='D';  M=-13, 26,-27, 37, 20,-33, -7, -2,-33, -1,-26,-23, 12, -7,  3, -7,  2, -8,-27,-35,-20, 12;
/M: SY='V';  M= -3,-24,-20,-28,-21,  4,-25,-19, 14,-17, 11, 10,-20,-21,-18,-11,-14, -6, 15,-19, -3,-20;
/I:         I=-5; MI=0; IM=0; DM=-15; MD=-15;
/M: SY='S';  M= -4,  9,-15, 10,  6,-23,-10, -6,-24, -1,-25,-17,  9,-11,  2, -3, 13,  4,-17,-34,-17,  4;
/M: SY='Y';  M= -3,-18,-25,-18,-12,  1,-19, -8, -7,-12,-10, -6,-16,  4,-12,-14, -8, -6, -9, -7,  8,-14;
/M: SY='E';  M= -8,  7,-22, 10, 13,-25,-15, -2,-26,  8,-22,-15,  3, -8,  5,  5,  0, -4,-20,-28,-14,  8;
/M: SY='S';  M=  1, -1,-19,  1, -3,-19,-11, -5,-11,-11,-14,-10, -3,-11, -8,-14,  3, -2, -4,-30,-13, -7;
/M: SY='F';  M=-11,-28,-18,-34,-27, 37,-28,-21, 13,-26, 17, 10,-23,-28,-29,-20,-18, -7, 14, -9, 11,-26;
/M: SY='E';  M= -9,  1,-25,  4, 11,-21,-16, -2,-21,  5,-15,-11, -1,-12,  5,  7, -4, -7,-17,-25,-11,  7;
/M:         M= -2, -7,-22, -8, -4,-14,-18,-13, -4, -7, -5, -4, -6,-11, -4, -7, -2, -1, -4,-26,-11, -5;
/M: SY='I';  M=-10,-29,-21,-34,-26, 13,-32,-23, 28,-27, 28, 19,-25,-26,-22,-22,-22, -8, 21,-18,  2,-25;
/M: SY='L';  M= -9,-30,-20,-32,-23, 10,-31,-22, 25,-28, 37, 19,-28,-28,-22,-21,-25, -8, 18,-20,  0,-23;
/M: SY='B';  M=-10, 15,-25, 15, 10,-23,-13,  1,-23,  5,-21,-15, 14,-13,  5,  4,  2, -3,-21,-29,-11,  7;
/M: SY='F';  M=-16,-23,-19,-29,-24, 40,-28, -5,  0,-20,  3, -1,-18,-28,-24,-16,-16, -8, -2, 11, 37,-23;
/M: SY='M';  M= -7,-24,-19,-31,-22,  7,-26,-15, 21,-20, 20, 29,-21,-21,-14,-18,-18, -8, 14,-19,  0,-19;
/M: SY='Y';  M=-19,-17,-30,-17,-15, 19,-28, 17, -5, -3, -4, -2,-16,-27, -6,  2,-18,-10,-11, 19, 61,-15;
/M: SY='T';  M= -3,  3,-16,  1, -3,-18,-12, -9,-20, -6,-19,-15,  2, -7, -6, -6, 10, 15,-13,-27,-12, -5;
/M: SY='G';  M= -1,  1,-25,  2, -9,-26, 31,-12,-32,-10,-26,-18,  4,-17,-12,-10,  1,-12,-24,-25,-22,-11;
/M: SY='E';  M= -9,  3,-24,  4, 13,-25,-16, -1,-24, 13,-21,-13,  3, -9,  6, 13, -3, -6,-20,-27,-13,  8;
/M: SY='I';  M= -6,-21,-18,-25,-21, -2,-29,-21, 21,-21, 14, 10,-19,-24,-17,-19,-13, -3, 19,-23, -3,-20;
/M: SY='E';  M= -4,  3,-23,  3,  4,-18,-11, -7,-17, -1,-18,-13,  3, -9, -1, -5,  1, -4,-14,-25,-11,  1;
/M: SY='I';  M= -8,-25,-23,-27,-20,  1,-30,-21, 21,-20, 18, 12,-22,-18,-18,-18,-18, -7, 16,-21, -1,-20;
/M: SY='P';  M= -6,  0,-24,  2,  1,-22,-13, -8,-21, -2,-23,-15,  1, 14, -4, -7,  3,  2,-19,-31,-18, -3;
/M: SY='E';  M= -7,  1,-27,  4, 11,-24,-15, -4,-19,  2,-18,-11,  0, -1,  6, -1, -2, -6,-19,-25,-14,  7;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Post-processing [info]

COMPETES_HIT_WITH

PS51463

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_01 which contains 572'970 sequence entries.

Total number of hits	644 in 615 different sequences
Number of true positive hits	644 in 615 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	95
Number of 'partial' sequences	1

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	87.14 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes, Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	2
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	K_Hofmann
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	BTB
Version [info]	6

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences	615 sequences ABAP1_ARATH (B7U179), ABRU_DROME (Q24174), ABT3A_DANRE (Q1LVW0), » more Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits: [Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format] Retrieve the sequence logo from the alignment
UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences	95 sequences BACD1_BOVIN (Q2T9W0), BACD1_DANRE (A9ULR9), BACD2_RAT (Q7TNY1), » more
UniProtKB/Swiss-Prot 'Partial' sequences	1 sequence ZBT17_CHICK (Q90625)
PDB [Detailed view]	220 PDB 1BUO; 1CS3; 1R28; 1R29; 1R2B; 2IF5; 2IHC; 2NN2; 2PPI; 2Q81; 2VKP; 2VPK; » more