PROSITE entry PS50042

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50042
Entry name [info]	CNMP_BINDING_3
Accession [info]	PS50042
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-NOV-1997 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00691
Associated ProRule [info]	PRU00060

Name and characterization of the entry

Description [info]

cAMP/cGMP binding motif profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=120;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=115;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.7862000; R2=0.0194000; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4941.5795898; R2=12.9449272; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=1; SCORE=398; H_SCORE=10094; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!!';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=321; H_SCORE=9097; N_SCORE=7.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=269; H_SCORE=8424; N_SCORE=6.0; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='L';  M= -9,-27,-21,-32,-23, 16,-30,-22, 21,-28, 30, 15,-23,-26,-22,-21,-21, -6, 13,-17,  3,-23;
/M: SY='F';  M=-15,-28,-20,-34,-23, 47,-29,-19,  7,-28, 25,  9,-23,-29,-29,-19,-23,-10,  3, -4, 16,-23;
/M: SY='K';  M= -2,  0,-24, -2,  9,-25,-15, -3,-22, 16,-22, -9,  2,-11, 12, 12,  2, -3,-17,-25,-13, 10;
/M: SY='N';  M= -6, 11,-22,  8, -1,-23,  1,  8,-26, -3,-26,-17, 18,-13, -1,  0, 10,  0,-22,-33,-15, -2;
/M: SY='L';  M= -7,-27,-10,-29,-20,  4,-29,-21, 16,-27, 36, 15,-27,-29,-19,-20,-24, -8, 11,-23, -4,-20;
/M: SY='D';  M= -9, 18,-25, 28, 19,-29,-13, -6,-28, -1,-24,-22,  6,  0,  2, -7,  6,  0,-23,-35,-19, 10;
/M: SY='E';  M= -5, -2,-27,  1, 13,-24,-17, -8,-20,  5,-19,-12, -4,  7,  5,  2, -2, -5,-19,-27,-17,  7;
/M: SY='E';  M= -7,  4,-26,  7,  8,-19,-10, -4,-21, -3,-21,-15,  3,-11,  4, -7,  3, -4,-21,-12, -6,  6;
/M: SY='E';  M= -9, -5,-25, -4, 15,-16,-22, -4,-11, -2, -6, -2, -7,-12, 13, -3, -5, -4,-13,-24, -9, 14;
/M: SY='L';  M=-13,-21,-25,-22,-13, -3,-27,-11,  2, -4, 14,  8,-17,-24, -7, 13,-19, -9,  1,-18, -1,-12;
/M:         M= -5, -5,-21, -6, -3, -8,-17, -8,-10, -5, -7, -4, -4,-17, -2, -2, -1, -2, -7,-24, -8, -3;
/M: SY='E';  M=-10,  7,-28, 10, 15,-27,-17, -6,-25, 14,-22,-14,  2,-11, 12,  5, -2, -5,-22,-17,-11, 14;
/M: SY='I';  M= -8,-29,-20,-33,-26,  6,-32,-24, 30,-26, 29, 19,-26,-27,-22,-22,-21, -7, 25,-22, -2,-25;
/M: SY='V';  M=  7,-22,-15,-25,-20,  2,-21,-22, 12,-20, 12,  5,-20,-23,-20,-20, -8, -3, 17,-22, -6,-20;
/M: SY='D';  M=-12, 29,-25, 37, 11,-29,-12, -1,-28,  0,-21,-20, 15,-13, -1, -7,  1, -5,-22,-35,-16,  5;
/M: SY='A';  M= 14, -6, -3, -9, -8,-18,-13,-14,-12, -8,-13,-10, -7,-17,-11,-13,  3, -2, -1,-28,-16,-10;
/M: SY='L';  M= -6,-24,-15,-29,-20,  2,-25,-15, 18,-21, 28, 28,-23,-24,-13,-18,-20, -7, 11,-22, -3,-17;
/M: SY='E';  M=-13, -1,-27,  2, 11, -8,-17, -2,-19,  0,-13,-10, -4,-14,  1, -1, -7, -9,-17,-17,  0,  6;
/M: SY='E';  M= -4, -9,-25, -6,  7,-18,-16,-14,-15, -7,-10,-11,-10,  5, -4, -9, -3, -1,-14,-20,-15,  1;
/M: SY='R';  M= -7,-10,-15,-10,  0,-17,-23, -8,-10,  5,-12, -5, -9,-18, -2,  6, -5, -3,  1,-28,-11, -2;
/M: SY='H';  M= -7, -5,-22, -7, -3,-11,-19,  2, -9, -3,-11, -5, -1,-17, -2, -3, -1,  0, -6,-23,  0, -3;
/M: SY='Y';  M=-16,-23,-25,-26,-22, 31,-30,  3,  5,-17,  6,  3,-20,-29,-19,-13,-18, -8,  1, 10, 46,-22;
/I:         I=-6; MI=0; IM=0; MD=-20; DM=-20;
/M: SY='E';  M= -5,  0,-28,  4, 10,-27,-15, -7,-20,  1,-21,-14, -2, 10,  5, -3,  0, -5,-20,-29,-17,  6;
/M: SY='P';  M=  7,  2,-24,  4,  4,-26,-11,-12,-21, -1,-21,-16, -2, 10, -3, -8,  3, -2,-16,-28,-20, -1;
/M: SY='G';  M= -3, -3,-29, -3,-12,-30, 45,-13,-37, -7,-30,-18,  4,-18,-12, -9, -1,-16,-28,-22,-24,-12;
/M: SY='E';  M= -7, 15,-25, 23, 30,-28,-14, -1,-27,  2,-22,-20,  6, -7,  8, -4,  6, -3,-22,-33,-18, 19;
/M: SY='Y';  M= -6, -6,-16,-10,-11, -4,-21,  1, -8, -9, -8, -5, -6,-19, -8, -9, -2,  7, -4,-17,  9,-11;
/M: SY='I';  M= -6,-30,-18,-35,-29,  1,-35,-29, 37,-26, 20, 15,-25,-26,-24,-25,-18, -6, 34,-24, -4,-29;
/M: SY='I';  M=-10,-29,-15,-37,-30,  8,-36,-28, 34,-28, 15, 13,-22,-25,-24,-27,-18, -8, 26,-19,  1,-30;
/M: SY='R';  M=-11, -4,-26, -3,  3,-20,-19,  7,-20, 12,-13, -5, -2,-17,  6, 20, -7, -8,-15,-23, -6,  3;
/M: SY='Q';  M= -5,  0,-28,  0, 21,-36,-18,  5,-21, 11,-20, -4, -1, -9, 45,  9,  0, -9,-27,-21,-12, 33;
/M: SY='G';  M= -1, -5,-29, -6,-17,-29, 61,-17,-38,-17,-30,-20,  5,-20,-17,-17,  1,-18,-30,-22,-29,-17;
/M: SY='D';  M= -5, 25,-26, 36, 27,-33,-11, -3,-31,  1,-23,-23,  9, -7,  6, -8,  3, -7,-25,-33,-20, 16;
/M:         M= -3, -8,-26, -7, -1,-20,-14,-14, -9, -4,-13, -7, -9, -2, -4, -5, -5, -8, -8,-22,-15, -4;
/M: SY='G';  M=  9,-12,-24,-14,-17,-25, 41,-20,-28,-18,-21,-15, -5,-11,-17,-20,  0,-14,-20,-21,-26,-18;
/M: SY='D';  M=-11, 26,-24, 32, 13,-29,-12, -1,-29,  1,-24,-21, 14,-11,  2, -1,  5,  1,-22,-35,-16,  7;
/M: SY='B';  M= -4, 10,-22,  8,  5,-18, -8,  0,-20, -5,-18,-14, 10,-14, -1, -7,  6,  3,-17,-27, -8,  1;
/M: SY='F';  M=-14,-28,-18,-35,-25, 43,-29,-20,  9,-26, 17,  9,-23,-28,-29,-19,-20, -9,  8, -3, 14,-25;
/M: SY='Y';  M=-20,-22,-27,-25,-21, 43,-30,  9, -1,-15,  2,  0,-20,-29,-18,-13,-20,-10, -8, 23, 64,-22;
/M: SY='I';  M= -8,-29,-22,-35,-28, 12,-34,-24, 32,-25, 15, 12,-23,-25,-24,-24,-17, -7, 28,-15,  7,-28;
/M: SY='I';  M= -7,-28,-23,-34,-26,  0,-34,-27, 37,-26, 19, 17,-23,-23,-21,-24,-17, -7, 30,-23, -3,-26;
/M: SY='E';  M= -2, -5,-21, -2,  6,-16,-20,-13, -5, -6, -3, -5, -9,-15, -4,-10, -4, -4, -2,-28,-13,  1;
/M: SY='E';  M= -4,  4,-23,  5, 12,-23,-13, -5,-24, 11,-23,-14,  5,-11,  8,  9,  5, -2,-18,-27,-14,  9;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='E';  M= -3, -2,-16, -3,  7,-19,-16,-10,-21,  5,-18,-13, -1,-13,  3,  6,  3,  2,-15,-23,-13,  5;
/M: SY='V';  M=  2,-26,-11,-29,-25,  4,-26,-24, 19,-21, 12,  8,-25,-27,-24,-20,-12, -3, 28,-22, -4,-25;
/M: SY='D';  M= -7, 13,-25, 18, 16,-27,-14, -4,-25,  8,-21,-15,  6,-11,  5,  6,  0, -6,-19,-30,-16, 10;
/M: SY='V';  M= -4,-29,-16,-31,-28,  4,-31,-27, 30,-23, 13, 11,-26,-27,-25,-21,-13, -3, 37,-25, -5,-27;
/M: SY='Y';  M= -7,-16,-18,-20,-16,  7,-23,-12,  3,-15,  7,  2,-13,-22,-14,-11, -5,  6,  3,-15,  8,-16;
/M: SY='R';  M= -7,-10,-23,-12, -5,-18,-20,-10, -4,  3, -9,  0, -7,-18,  4,  9, -6, -6,  0,-24,-11, -2;
/I:         MD=-15;
/M: SY='K';  M=-10,  4,-22,  3,  8,-20,-15, -5,-19,  9,-17,-10,  5,-14,  5,  7, -3, -3,-16,-24, -9,  6; D=-2;
/I:         MD=-15;
/M: SY='D';  M= -8,  7,-19, 10,  0,-26,  0, -8,-26,  0,-22,-16,  4,-12, -2,  0,  2, -4,-18,-28,-17, -2; D=-2;
/I:         MD=-15;
/M: SY='D';  M= -6,  9,-20, 12, 12,-22, -6, -4,-21,  2,-20,-14,  6, -2,  5, -3,  5, -1,-18,-25,-15,  8; D=-2;
/I:         MD=-15;
/M: SY='D';  M= -6,  6,-17,  8,  6,-16,  3, -5,-16, -3,-13,-11,  4,  0, -2, -5, -1, -5,-15,-17,-13,  1; D=-2;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='E';  M= -6,  2,-20,  5,  8,-20,  1, -2,-20,  1,-16,-10,  1, -8,  6,  0,  0, -6,-17,-18,-11,  6; D=-2;
/I:         DM=-15;
/M: SY='E';  M= -5,  3,-20,  7, 16,-17, -9, -6,-16,  0,-15,-12, -1,  4,  2, -6,  0, -4,-15,-20,-13,  8; D=-2;
/I:         DM=-15;
/M: SY='K';  M= -2, -6,-18, -8, -4,-15,-15, -8, -7,  4,-10,  0, -5,-14, -1,  1, -2,  0, -1,-22, -9, -3; D=-2;
/I:         DM=-15;
/M: SY='V';  M= -8,-17,-21,-18, -9, -1,-26,-13,  6,-11,  2,  1,-16,-21,-11,-13,-11, -7,  8,-15,  2,-11;
/M: SY='V';  M= -6,-27,-18,-30,-23,  4,-30,-23, 24,-22, 21, 14,-26,-27,-20,-19,-17, -6, 26,-22, -3,-22;
/M: SY='G';  M=  6, -6,-15, -9, -8,-20,  8,-15,-20, -8,-18,-13, -2,-15, -9, -7,  6,  1,-10,-27,-19, -9;
/M: SY='T';  M= -7, -7,-22,-10, -3,-12,-21, -8, -7, -1,-10, -4, -5,-13, -2,  0,  0,  7, -4,-23, -4, -4;
/M: SY='L';  M= -8,-26,-14,-29,-21,  9,-28,-17, 15,-25, 28, 13,-24,-27,-18,-19,-21, -7,  9,-16,  6,-20;
/M: SY='G';  M= -1, -1,-23, -2, -8,-23, 19, -6,-26, -8,-25,-16,  6,-14, -7, -9,  7, -6,-20,-28,-19, -8;
/M: SY='K';  M= -3, -2,-26, -1,  7,-25,-11, -8,-21,  9,-20,-10, -1, -2,  5,  6, -2, -7,-18,-25,-16,  5;
/M: SY='G';  M=  1, -6,-27, -7,-14,-26, 45,-12,-34,-14,-28,-18,  3,-19,-14,-13,  3,-14,-26,-19,-23,-14;
/M: SY='D';  M=-10, 19,-27, 27, 13,-32,  0, -4,-32,  3,-27,-20, 11,-11,  5, -3,  3, -7,-26,-31,-19,  9;
/M: SY='Y';  M= -5,-16,-19,-19,-17, 11,-21, -8,  0,-15, -5, -3,-12,-22,-14,-14, -1,  3,  2, -6, 19,-17;
/M: SY='F';  M=-19,-30,-20,-39,-29, 71,-30,-20,  4,-30, 14,  3,-21,-30,-37,-20,-21,-10,  2,  6, 26,-29;
/M: SY='G';  M=  3,-10,-29,-11,-19,-29, 65,-20,-38,-19,-29,-19, -1,-19,-19,-20,  1,-19,-28,-20,-29,-19;
/M: SY='E';  M=-10,  9,-30, 19, 57,-29,-20,  0,-29, 10,-19,-18,  0, -1, 19,  0, -1,-10,-29,-30,-19, 38;
/M: SY='L';  M= -5,-23,-21,-26,-18,  0,-27,-19, 18,-20, 25, 14,-20,-22,-15,-17,-20, -8, 11,-22, -4,-18;
/M: SY='A';  M= 33,-10,-15,-16, -8,-20,  7,-18,-14,-11,-12, -9, -8,-10, -9,-18,  8, -3, -6,-22,-20, -9;
/M: SY='L';  M= -9,-28,-20,-31,-23,  6,-31,-22, 26,-27, 36, 20,-26,-28,-20,-21,-24, -8, 19,-22, -2,-22;
/M: SY='L';  M=-11,-28,-21,-31,-21, 12,-30,-18, 21,-25, 33, 20,-25,-27,-17,-19,-24, -9, 12,-17,  4,-19;
/M: SY='Y';  M=-12, -8,-18,-10,-11,  3,-18,  3, -8,-10, -5, -4, -7,-23, -9, -9, -8, -1,-11, -6, 25,-12;
/I:         I=-7; MI=0; IM=0; DM=-20; MD=-20;
/M: SY='N';  M= -7, 21,-26, 19,  3,-24,  9, -1,-28, -4,-26,-20, 22,-16, -4, -8,  2, -8,-27,-28,-15, -1;
/M: SY='R';  M= -7, -2, -3, -4, -3,-20,-18,-11,-22,  4,-17,-11, -1,-17,  0,  9,  2,  6,-13,-30,-14, -3;
/M: SY='P';  M= -7,-15,-30,-10, -1,-25,-20,-17,-15, -6,-22,-14,-14, 48, -5,-13, -7, -5,-19,-29,-23, -6;
/M: SY='R';  M=-17, -9,-29,-10,  0,-20,-16,  0,-28, 24,-19, -9, -1,-19, 11, 56, -8, -9,-20,-19, -9,  1;
/M: SY='A';  M= 22, -7,-14,-13, -7,-17, -9,-17,-11, -8,-13,-11, -6, -4, -7,-14, 11, 11, -4,-24,-15, -8;
/M: SY='A';  M= 37,-10,-11,-19,-11,-12, -4,-19, -9,-12,-10,-10, -9,-12,-12,-18, 11,  5,  0,-21,-15,-11;
/M: SY='T';  M=  0,  3,-15, -5, -7,-13,-13,-15,-14, -9,-17,-14,  6,-11, -8,-10, 17, 28, -8,-22,-12, -7;
/M: SY='V';  M=  2,-26,-13,-30,-26, -4,-27,-28, 27,-21,  8,  9,-24,-25,-24,-22,-10, -4, 35,-27, -9,-26;
/M: SY='V';  M= -6,-13,-22,-16,-10,-11,-24,-12,  1, -1, -4,  0,-10,-19, -7,  4, -7, -1,  5,-22, -5,-11;
/M: SY='A';  M= 35,-10, -7,-18,-11,-17, -5,-20, -9,-11,-10,-10, -9,-11,-11,-18, 11,  7,  2,-24,-18,-11;
/M: SY='K';  M= -8,-11,-24,-14, -5,-13,-23,-13, -4,  5, -5, -2, -8,-16, -4,  5, -7,  1, -2,-22, -6, -6;
/I:         I=-7; MI=-23; MD=-23; IM=-23;
/M: SY='S';  M=  3, -3,-17, -6, -1,-19,  2,-14,-19, -7,-19,-14,  1,-11, -5, -7, 14, 14,-11,-28,-17, -4; D=-4;
/I:         DM=-23;
/M: SY='D';  M= -7,  8,-26, 12,  6,-20,-11, -4,-21, -4,-16,-15,  3, -3, -3, -6, -3, -5,-20,-26,-11,  0;
/M: SY='C';  M= -2,-18, 22,-22,-22,-10,-19,-24, -2,-22, -2, -4,-17,-28,-22,-20, -4,  0, 10,-34,-17,-22;
/M: SY='K';  M= -7,  3,-25,  2,  9,-24,-17, -7,-20, 18,-20, -9,  4,-12,  8, 12, -1, -3,-15,-26,-13,  8;
/M: SY='L';  M= -9,-25, 17,-29,-24,  0,-30,-25,  9,-28, 19,  6,-24,-31,-24,-23,-19, -7, 11,-29, -9,-24;
/M: SY='W';  M= -4,-29,-26,-31,-22,  4,-22,-18,  0,-21,  7,  0,-28,-27,-18,-19,-23,-15, -3, 35,  8,-19;
/M: SY='A';  M=  8, -9,-20,-12, -4,-19, -7,-15,-13,  1,-13, -8, -7,-15, -5, -1,  1, -1, -4,-24,-15, -5;
/M: SY='I';  M=-10,-29,-24,-35,-25,  5,-34,-23, 34,-28, 31, 23,-24,-24,-19,-24,-24,-10, 20,-20,  0,-24;
/M: SY='D';  M=-13, 32,-26, 44, 15,-33, -6, -1,-33, -3,-27,-25, 16, -9,  0,-10,  6, -5,-26,-38,-19,  7;
/M: SY='R';  M=-16,-11,-29,-10, -2,-17,-17, -3,-24, 24,-18, -9, -3,-20,  5, 48,-10,-10,-15,-18, -5, -2;
/M: SY='E';  M= -5,  4,-24,  5,  9,-25,-17, -5,-18,  5,-17,-10,  0, -8,  8,  1,  0, -2,-14,-27,-14,  8;
/M: SY='T';  M=  2, -5, -5, -8, -7,-18,-13,-12,-17, -3,-17,-12, -2,-16, -6,  0,  9, 10, -6,-31,-15, -7;
/M: SY='F';  M=-19,-29,-21,-36,-27, 64,-30,-15,  3,-27, 14,  3,-21,-30,-33,-19,-21,-10,  0,  9, 33,-27;
/M: SY='R';  M=-13,  0,-27, -2, 10,-22,-19,  0,-19, 12,-14, -5,  5,-15, 15, 23, -5, -6,-19,-25,-12, 11;
/M: SY='R';  M=-12, -2,-26, -4,  6,-24,-18,  2,-23, 14,-19, -9,  4,-15, 18, 32,  0, -2,-20,-24,-11, 10;
/M: SY='I';  M= -6,-28,-23,-34,-25,  4,-33,-26, 32,-28, 27, 16,-23,-24,-21,-25,-20, -7, 22,-20, -1,-25;
/M: SY='L';  M= -9,-28,-19,-32,-23,  5,-30,-19, 26,-25, 34, 27,-26,-26,-17,-20,-24, -9, 16,-21, -1,-21;
/M: SY='G';  M= -7,-14,-24,-18,-16,-11, 11, -6,-11,-13, -6, 11, -9,-20, -6,-10, -8,-12,-10,-20,-11,-11;
/M: SY='P';  M= -5, -5,-24, -3, -1,-26, -4,-13,-24,  2,-24,-16, -3, 11, -5,  1, -4, -8,-20,-27,-21, -5;
/M: SY='T';  M= -4,  0,  3, -7,-10,-12,-16, -7,-12,-14,-10,-10,  5,-20,-10,-13,  5,  8, -8,-33,-13,-10;
/M: SY='A';  M=  3, -1,-18, -4, -8,-21, -1,-13,-15,-10,-17, -9, -1, -3, -9,-13,  3,  0,-11,-29,-19, -9;
/M: SY='D';  M= -8,  7,-26, 13, 12,-19,-19, -7,-14, -7, -6, -9, -2,-13,  3,-10, -5, -7,-14,-27,-10,  7;
/M: SY='I';  M= -9,-18,-27,-22,-15,-10,-29,-18, 14, -6,  6,  8,-13,-19, -8, -3,-15, -9,  9,-21, -5,-14;
/M: SY='R';  M=-11,-11,-26,-13, -4,-15,-18, -4,-12, 12, -3,  6, -8,-18,  3, 16,-13,-10,-10,-21, -6, -1;
/M: SY='R';  M=-15, -3,-29, -4,  4,-23,-20,  8,-22, 20,-18, -2,  1,-16, 13, 31, -9,-11,-19,-23, -7,  6;
/M: SY='R';  M= -7, -9,-25,-10,  2,-16,-19, -8,-20, 19,-14, -6, -5,-16,  2, 29, -8, -7,-12,-20, -9,  0;
/M: SY='M';  M= -9,  2,-23, -4, -1,-10,-17, -3, -1, -8,  1,  8,  5,-18, -2, -9, -9, -7, -9,-26, -7, -2;
/M: SY='Y';  M=-13,-15,-25,-17,-17, 12,-26,  0,  6,-14,  2,  4,-14,-23,-11,-14,-11, -3,  0,  0, 34,-17;
/M: SY='E';  M=  0,  5,-23,  8, 20,-26,-11, -5,-22,  1,-20,-14,  3, -6, 10, -3,  8, -2,-18,-30,-18, 14;
/M: SY='D';  M= -9, 17,-25, 19, 17,-27,-14,  5,-25,  1,-21,-15, 13,-11, 11, -2,  4, -2,-23,-32,-14, 14;
/M: SY='F';  M=-15,-24,-23,-29,-21, 38,-24, -8,  1,-20, 11,  6,-19,-27,-22,-14,-19,-10, -2,  4, 28,-21;
/M: SY='L';  M= -2,-12,-20,-15, -5, -3,-21,-11,  3,-17, 14,  3,-10,-20,-10,-15,-12, -7, -1,-24, -7, -8;
/M: SY='R';  M= -7, -3,-25, -2, 12,-23,-16, -3,-21, 15,-19, -5, -1,-12, 12, 19,  2, -4,-17,-26,-13, 11;
/M: SY='R';  M= -8, -3,-24, -2,  7,-14,-16, -5,-23, 11,-21,-12,  1,-13,  7, 14,  4, -2,-17,-22, -6,  6;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_01 which contains 572'970 sequence entries.

Total number of hits	494 in 348 different sequences
Number of true positive hits	485 in 339 different sequences
Number of 'unknown' hits	1
Number of false positive hits	8 in 8 different sequences
Number of false negative sequences	21
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	98.38 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	95.85 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info]	4
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	K_Hofmann
Feature key [info]	NP_BIND
Feature description [info]	cNMP
Version [info]	6

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences	339 sequences AADR_RHOPA (Q01980), ACH1_ARATH (Q5FYU1), ACH2_ARATH (F4HU51), » more Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits: [Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format] Retrieve the sequence logo from the alignment
UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences	21 sequences ARCR_STAA1 (A7X715), ARCR_STAA2 (A6U515), ARCR_STAA3 (Q2FDM8), » more
UniProtKB/Swiss-Prot 'Unknown' sequences	1 sequence CNNM4_HUMAN (Q6P4Q7)
UniProtKB/Swiss-Prot False positive sequences	8 sequences MHQE_BACSU (O34543), NADK_BLOPB (Q492C6), NINAB_GALME (A8Y9I2), » more
PDB [Detailed view]	323 PDB 1CGP; 1CX4; 1G6N; 1HW5; 1I5Z; 1I6X; 1J59; 1LB2; 1NE4; 1NE6; 1O3Q; 1O3R; » more