PROSITE entry PS50022
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| PURL [info] | https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50022 |
| Entry name [info] | FA58C_3 |
| Accession [info] | PS50022 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-MAY-2003 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC00988 |
| Associated ProRule [info] | PRU00081 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Coagulation factors 5/8 type C domain (FA58C) profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=150; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=150; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1392250; R2=0.0273076; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=233; N_SCORE=8.5000; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=160; N_SCORE=6.5000; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-200; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='C'; M= 3,-15, 40,-22,-19,-15,-19,-22,-15,-18,-13,-12,-14,-24,-19,-20, -1, 1, -2,-35,-20,-19; /M: M= -2, -7,-21, -9, -9, -9,-12,-12,-10, -7,-10, -7, -5,-14, -8, -6, -1, -1, -6,-22, -7, -9; /M: SY='E'; M= -1, -6,-23, -6, 2,-18,-14,-10,-10, -7,-11, -8, -6, -1, -3,-11, 0, -1, -9,-27,-14, -2; /M: SY='P'; M= -7,-13,-26,-12, -8,-12,-21,-15, -1,-13, -8, -3,-11, 13,-11,-15, -7, -4, -5,-26,-13,-12; /I: I=-20; MD=-22; /M: SY='S'; M= 1, 1,-16, 0, 2,-15, -6, -7,-13, -2,-12, -9, 1, -8, 0, -3, 3, 1, -9,-19,-10, 1; D=-10; /I: I=-20; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='L'; M= -8,-21,-19,-23,-17, 5,-22,-17, 13,-21, 25, 12,-20,-24,-16,-15,-18, -7, 8,-19, -2,-17; D=-10; /I: I=-20; DM=-22; /M: SY='G'; M= 4, -2,-23, -5,-12,-24, 34,-14,-27,-12,-24,-16, 6,-15,-12,-13, 5, -8,-21,-24,-23,-12; D=-10; /I: I=-20; DM=-22; /M: SY='L'; M= -8,-23,-21,-26,-19, 4,-26,-16, 14,-19, 21, 17,-21,-22,-14,-15,-18, -7, 9,-16, 0,-16; /M: SY='E'; M= -1, -8,-23, -8, 4,-16,-15,-12,-10, -3, -8, -6, -7, -9, -2, -4, -3, -5, -8,-24,-12, 0; /M: SY='D'; M= -2, 9,-22, 11, 7,-25, -3, -7,-23, -4,-23,-17, 7, -8, 1, -7, 10, 1,-18,-32,-18, 4; /M: SY='G'; M= -2, -3,-24, -3, -5,-22, 13,-12,-22, -9,-19,-13, 0,-12, -6,-10, 3, -5,-18,-25,-18, -6; /M: M= 0,-11,-23,-12, -6,-12,-13,-12,-10, -7, -9, -6, -8, -4, -8, -5, -3, -3, -7,-24,-13, -8; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='I'; M= 1,-18,-16,-22,-17, -2,-21,-17, 18,-17, 10, 8,-14,-15,-14,-17, -9, -4, 15,-17, -4,-17; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16; /M: SY='P'; M= 2, -5,-18, -4, 3,-14, -9, -7,-12, -5,-13,-10, -4, 11, -2, -8, 0, -2,-12,-18,-11, -1; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='D'; M= -8, 17,-20, 20, 9,-21, -7, -1,-20, -1,-18,-15, 11, -7, 2, -4, 3, -2,-18,-25,-12, 5; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='S'; M= -2, -1,-18, 0, 0,-14, -9, -7,-13, -2,-15, -9, 0, -5, -3, -5, 4, 0, -9,-21,-10, -2; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='Q'; M= 1, 0,-23, -1, 6,-26, -9, -6,-20, 4,-20,-11, 1, -3, 13, 1, 5, -1,-18,-25,-16, 9; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='I'; M= -5,-26,-20,-32,-25, 7,-30,-24, 27,-23, 17, 14,-21,-24,-22,-22,-16, -5, 23,-19, 0,-25; /M: SY='T'; M= 0, -1,-17, -5, -4,-17,-11,-11,-14, -5,-16,-11, 2,-12, -1, -5, 12, 18, -8,-28,-11, -3; /M: SY='A'; M= 27, -8,-11,-13, -9,-17, -7,-17, -8,-10,-11, -9, -7,-13, -9,-15, 10, 4, 1,-24,-15, -9; /M: SY='S'; M= 8, 1,-10, -1, -2,-18, -4,-11,-18,-10,-24,-17, 7,-11, -3,-11, 29, 20, -9,-36,-17, -3; /M: SY='S'; M= 9, -1,-15, -4, -3,-18, -2,-11,-16, -9,-22,-15, 5,-12, -4,-10, 22, 10, -8,-33,-17, -4; /M: SY='S'; M= -2, -1,-19, -2, 4,-17,-10, -7,-15, -7,-14,-10, 0,-14, 2, -9, 7, 2,-12,-27,-11, 3; /M: M= -6,-11,-24,-12, -7, -8,-15,-10, -9, -8, -9, -6, -9,-19, -4, -6, -4, -4, -7, -5, 0, -6; /M: SY='B'; M= -1, 9,-21, 8, 6,-23, -6, -7,-22, -2,-22,-16, 9, -7, 1, -5, 9, 3,-18,-31,-18, 3; /M: SY='E'; M= -3, 1,-23, 1, 6,-19, -8, -6,-17, -5,-16,-12, 2,-10, 0, -7, 4, -2,-15,-25,-12, 2; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='Y'; M= -4, -9,-21,-11, -9, -5, -9, -8, -9, -9, -9, -7, -6,-13, -8, -9, -4, -3, -9, -6, 2, -9; D=-10; /I: I=-10; MD=-22; /M: M= -4, -3,-18, -4, 0,-10, -7, -1,-12, -7, -9, -8, -2,-12, -3, -7, -1, -1,-11, -9, -4, -2; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='G'; M= 2, -3,-17, -4, -3,-18, 11,-11,-20, -7,-18,-13, 1,-11, -6, -9, 6, -2,-15,-20,-15, -5; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='P'; M= -1,-10,-27, -7, 1,-23,-15,-14,-18, -5,-23,-16,-10, 35, -7,-13, -3, -7,-19,-27,-20, -6; /M: SY='E'; M= -3, 4,-25, 7, 10,-27, -3, -4,-25, 3,-22,-15, 3, -9, 4, -2, 1, -8,-20,-28,-17, 6; /M: M= -2, -7,-23,-11, -7,-10,-14, -7,-10, -3, -9, -5, -4,-15, -4, -3, -4, -4, -9,-15, -3, -6; /M: SY='A'; M= 20, -6,-18,-11, -6,-17, -3,-12,-12, -8,-12, -9, -4,-11, -7,-13, 4, -3, -7,-22,-14, -7; /M: SY='R'; M= -7, -8,-25, -9, -4,-16,-15, -8,-18, 11,-13, -8, -3,-16, 0, 26, -6, -7,-11,-22,-11, -5; /M: SY='L'; M= -6,-16,-22,-16,-16, 1,-23,-19, 9,-22, 20, 7,-18,-22,-17,-19,-17, -8, 6,-22, -5,-17; /M: SY='N'; M= -4, 11,-23, 9, -3,-21, 3, -1,-22, -8,-20,-15, 12,-17, -6, -9, 3, -3,-18,-29,-14, -5; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='D'; M= -7, 17,-17, 23, 6,-20, -6, -4,-20, 2,-17,-13, 7, -7, -1, -3, 1, -3,-14,-22,-11, 3; D=-12; /I: I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25; /M: SY='G'; M= -2, 0,-20, 1, -4,-22, 23,-10,-24, -7,-19,-13, 3,-12, -5, -8, 2, -7,-18,-19,-18, -5; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='D'; M= -8, 15,-22, 17, 3,-23, 1, -4,-23, -2,-21,-16, 13,-10, -1, -4, 3, -4,-20,-27,-15, 0; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: M= -3, -6,-24, -7, -3,-19, -2,-12,-15, -5,-15, -8, -3, -3, -4, -7, -1, -5,-13,-22,-15, -4; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='N'; M= 2, 8,-19, 3, -2,-20, -3, -7,-19, -3,-21,-15, 12,-13, -4, -4, 9, 4,-15,-29,-15, -4; /M: SY='T'; M= -1, 2,-17, -4, -6,-17, -1,-13,-19, -9,-19,-14, 7, -8, -8,-10, 13, 19,-13,-29,-16, -7; /M: SY='A'; M= 3,-12,-22,-15,-12, -6, -3,-11,-13, -7,-12, -7, -7,-16,-11, -5, -2, -6, -8,-17, -5,-12; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-29,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,148, 31,-20; /I: I=-7; MD=-14; /M: SY='S'; M= -2, -7, 0,-10, -8,-15,-13, 2,-15,-11,-15, -9, -2,-19, -6,-10, 4, -1, -9,-30, -9, -8; D=-7; /I: I=-7; MD=-14; /M: SY='S'; M= 8, -7,-18, -9, -6,-20, -2,-14,-16,-10,-21,-14, -3, 9, -7,-13, 13, 9,-11,-28,-19, -8; D=-7; /I: I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14; /M: SY='S'; M= -2, 0,-18, 0, -2,-15, -4, -8,-13, -5,-13, -9, 0, -5, -2, -7, 2, -2,-11,-21,-12, -3; D=-7; /I: I=-7; DM=-14; /M: SY='S'; M= 5, -2,-18, -4, -3,-17,-11,-13,-10, -7,-13,-10, 0,-11, -5,-10, 8, 5, -5,-29,-15, -4; /M: SY='N'; M= -3, 2,-24, 0, -1,-21, -2, 0,-22, -4,-21,-13, 6, -7, -1, -4, 2, -4,-20,-26,-12, -2; /M: SY='D'; M= -1, 6,-23, 8, 4,-24, -5, -9,-21, -3,-22,-17, 5, -2, -3, -8, 7, -1,-17,-30,-18, 0; /M: M= -1, -3,-24, -3, -4,-17, -5, -6,-16, -7,-13,-10, -3, -8, -5,-10, -3, -7,-14,-22, -9, -6; /M: SY='P'; M= -9, 1,-29, 3, 1,-19,-11, -8,-22, -1,-24,-16, 2, 16, -4, -5, -2, -4,-23,-26,-14, -3; /M: SY='Q'; M= -8, -1,-27, 0, 14,-28,-17, 11,-19, 1,-18, -6, -1, -5, 22, -1, -1, -8,-21,-26,-10, 17; /M: SY='W'; M=-15,-25,-35,-28,-19, 13,-20,-16,-15,-16,-14,-13,-23,-25,-14,-14,-20,-13,-20, 70, 22,-14; /M: SY='I'; M= -7,-29,-24,-34,-25, 4,-32,-24, 29,-27, 28, 16,-26,-25,-20,-24,-23, -9, 20,-14, 1,-24; /M: SY='Q'; M= -3, -4,-21, -7, 5,-21,-16, -6,-12, -2,-12, -4, -4,-12, 16, -4, 5, 7,-12,-24, -9, 10; /M: SY='V'; M= -4,-29,-17,-33,-27, 8,-31,-27, 28,-24, 18, 12,-25,-26,-26,-22,-15, -4, 31,-22, -3,-27; /M: SY='D'; M=-16, 40,-28, 54, 19,-36, -9, -1,-36, 3,-29,-27, 19,-10, 1, -7, 1, -8,-28,-37,-19, 10; /M: SY='L'; M=-11,-28,-20,-31,-21, 21,-29,-19, 15,-28, 38, 16,-26,-29,-22,-19,-25, -8, 8,-15, 5,-21; /M: SY='G'; M= -3, -3,-27, -2, -6,-26, 28,-13,-28,-10,-21,-14, 1,-16, -7,-10, -1,-13,-23,-24,-22, -7; /M: SY='K'; M= -1, 1,-24, 1, 9,-24, -7, -7,-24, 10,-21,-13, 1,-11, 3, 5, 2, -3,-17,-25,-15, 6; /M: SY='P'; M= 2,-11,-23,-11, 1,-18,-19,-17, -8, -7,-11, -9,-11, 10, -7,-11, -1, 2, -7,-27,-16, -5; /M: SY='R'; M=-10, -9,-25,-10, -1,-10,-21, 2,-14, 8,-12, -3, -6,-17, 2, 14, -7, -4,-10,-16, 4, -1; /M: SY='N'; M= -8, 4,-23, 1, 3,-18,-17, -6,-17, 4,-16,-10, 5, -9, 0, 3, 1, 4,-14,-26,-12, 1; /M: SY='I'; M= -8,-28,-21,-34,-28, 11,-33,-26, 31,-26, 20, 14,-23,-26,-25,-23,-18, -7, 28,-20, 0,-28; /M: SY='N'; M= -4, 11,-19, 9, 0,-20,-10, -6,-20, -1,-21,-15, 12,-13, -2, -3, 11, 10,-14,-31,-13, -1; /M: SY='G'; M= 1, -4,-25, -4, -3,-27, 17,-12,-28, 0,-23,-14, 0,-15, -2, -1, 2, -8,-20,-23,-20, -3; /M: SY='I'; M= -6,-30,-20,-34,-28, 9,-33,-27, 31,-26, 20, 13,-26,-26,-25,-23,-18, -6, 30,-19, -1,-28; /M: SY='V'; M= -3, -7,-18, -7, -6,-15,-17,-14, -5, -5, -7, -5, -7,-18, -8, -3, -3, 0, 2,-27,-11, -8; /M: SY='I'; M= -8,-20,-20,-26,-21, 4,-29,-18, 17,-20, 15, 10,-18,-22,-16,-18,-11, 7, 13,-17, 6,-20; /M: SY='Q'; M= -5, -7,-22, -9, -2,-15,-20, -7, -9, -1, -5, 0, -7,-16, 9, 0, -3, 1, -9,-21, -4, 3; /M: SY='G'; M= -7,-15,-31,-14,-15,-17, 14,-12,-22,-15,-20,-13, -9, -2,-14,-15, -7,-13,-21, -4,-12,-15; /M: SY='R'; M= -1, -8,-22, -8, -2,-17, -8,-10,-20, 3,-18,-12, -4, -8, -3, 12, 1, -5,-12,-24,-14, -4; /M: SY='Q'; M= -2, -3,-24, -4, 1,-24, -7, -7,-19, 1,-19,-10, -2, -5, 7, 0, -1, -5,-18,-23,-13, 3; /M: SY='B'; M= 2, 9,-21, 7, 1,-23, 1, -6,-23, -4,-21,-15, 9,-13, -2, -7, 7, -1,-18,-29,-17, -1; /M: SY='G'; M= 2, -9,-20,-11,-11,-11, 3,-12,-18,-11,-16,-12, -3,-15,-11,-12, 3, -3,-13,-15, -9,-11; /I: I=-7; MD=-15; /M: SY='D'; M= -4, 2,-21, 3, 2,-18, 1, -9,-17, -5,-15,-11, 2, -7, -4, -8, 0, -5,-14,-21,-14, -1; D=-7; /I: I=-7; MD=-15; /M: SY='N'; M= -4, 4,-14, 2, 1,-12, -2, 1,-12, -3,-13, -8, 8, -6, -1, -3, 3, -1,-12,-18, -9, 0; D=-7; /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='N'; M= -2, 4,-11, 3, 2,-12, -4, -2,-10, -1,-12, -8, 6, -4, -1, -2, 4, 0, -8,-17, -9, 0; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='G'; M= -3, -2,-17, -2, -1,-13, 5, -5,-15, -5,-11, -4, -2, -9, 0, -6, -2, -7,-13,-14, -9, -1; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='W'; M=-11,-13,-22,-16,-12, 8,-16, -3,-10, -6, -9, -6, -9,-17, -8, 0,-11, -8,-10, 16, 14,-10; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='V'; M= 0,-18,-16,-21,-18, -6,-22,-21, 14,-15, 3, 4,-16,-14,-16,-16, -6, 1, 19,-21, -9,-18; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='T'; M= 0, -1,-18, -5, -1,-19, -9,-12,-18, 3,-17,-11, 0,-10, 0, 1, 8, 14,-11,-25,-12, -1; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='S'; M= -3, 4,-21, 4, 5,-23, -5, -7,-23, 4,-21,-13, 6,-12, 3, 1, 7, 3,-17,-28,-15, 4; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='Y'; M=-17,-21,-26,-23,-21, 32,-27, 8, 0,-16, 3, 1,-18,-28,-16,-13,-18, -9, -6, 15, 54,-21; /M: SY='K'; M= -4, -1,-24, -2, 7,-21,-16, -9,-18, 14,-18, -9, 0,-12, 4, 10, -1, -2,-13,-23,-12, 5; /M: SY='I'; M= -5,-29,-20,-34,-27, 5,-32,-26, 32,-26, 22, 16,-25,-25,-23,-23,-18, -6, 29,-22, -3,-26; /M: SY='Q'; M= -7, -4,-26, -4, 10,-15,-18, 1,-14, 0,-10, -4, -4,-14, 13, 1, -3, -6,-16,-18, -2, 11; /M: SY='Y'; M= -7,-20,-20,-23,-21, 12,-19, -6, 4,-16, 0, 0,-17,-25,-18,-16,-10, -3, 6, -4, 24,-21; /M: SY='S'; M= 5, -1,-14, -2, -2,-19, -1,-11,-19, -7,-24,-16, 7,-12, -1, -7, 27, 14,-11,-35,-18, -2; /M: SY='B'; M= -8, 6,-22, 5, 3,-18,-15, -4,-13, -5,-10, -8, 5,-12, 1, -6, 1, 2,-14,-29,-11, 1; /M: SY='D'; M=-14, 39,-27, 50, 15,-35, -8, 0,-34, 1,-28,-26, 22,-10, 0, -6, 2, -7,-28,-38,-20, 7; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='G'; M= -1, -1,-27, -4,-13,-26, 47,-15,-34,-14,-28,-19, 8,-19,-14,-15, 3,-13,-26,-24,-26,-14; /M: SY='E'; M= -5, 1,-24, 2, 16,-23,-19, -6,-18, 5,-16,-11, -1, -7, 8, 0, 2, 2,-14,-28,-14, 11; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='N'; M= -4, 11,-18, 5, 2,-17, -9, -2,-18, 1,-20,-13, 16,-10, -1, 0, 8, 9,-16,-29,-13, 0; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='W'; M=-19,-34,-40,-36,-27, 24,-22,-21,-14,-20,-12,-13,-32,-28,-22,-18,-32,-23,-21,104, 31,-21; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='T'; M= -6, -1,-20, -5, -2,-17,-17, -7,-11, -1,-14, -7, 0,-12, -1, -3, 4, 12, -7,-27, -9, -3; /M: SY='E'; M= -7, -1,-23, 1, 5,-17,-17, -9,-15, -2,-15,-11, -3, -4, 0, -5, 3, 5,-11,-27,-10, 1; /M: SY='I'; M= -5,-25,-21,-27,-23, 12,-28,-15, 15,-20, 12, 6,-23,-23,-21,-19,-16, -7, 15, -8, 15,-23; /M: SY='R'; M= -5, -9,-23, -9, -6,-13,-14, -8,-12, 0, -9, -5, -7,-15, -5, 2, -6, -4, -6,-22, -7, -7; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='B'; M= -1, 10,-17, 10, 6,-20, 0, -3,-18, -2,-17,-13, 9, -7, 2, -5, 4, -3,-16,-22,-14, 4; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='A'; M= 2, 2,-11, 1, 2,-11, -3, -4,-11, 1, -9, -6, 1, -6, 1, -2, 2, -1, -8,-13, -7, 2; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='A'; M= 1, -2,-12, -2, -1,-11, -3, -4, -9, -3, -9, -6, -1, 0, -3, -5, 1, 0, -7,-15, -9, -3; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='K'; M= -5, -4,-15, -4, 2,-11,-10, -4, -8, 6, -8, -1, -3, -9, 5, 6, -3, -3, -7,-11, -5, 3; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='V'; M= -1,-11,-14,-14, -9, -5,-16, -9, 7,-10, 2, 4,-10,-13, -7,-10, -4, 1, 8,-16, -4, -9; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='F'; M= -8,-16,-15,-21,-17, 28,-15,-13, 1,-17, 3, 0,-11,-19,-19,-13, -9, -6, 3, -4, 9,-16; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='E'; M= -8, 2,-21, 3, 6,-14,-14, -6,-17, 2,-15,-11, 1, -3, 2, 0, 0, 1,-14,-20, -8, 3; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='G'; M= 5, -7,-25, -8,-13,-25, 37,-18,-30,-13,-25,-17, 0,-14,-14,-15, 4,-10,-21,-23,-24,-14; /M: SY='N'; M= -8, 20,-22, 11, 2,-21, -1, -2,-20, -3,-24,-17, 29,-11, -3, -5, 6, 1,-23,-34,-19, -1; /M: M= -5,-13,-20,-15, -9, -5,-19,-13, -8, -7, -8, -6,-10,-17, -8, -6, -4, 0, -5, -8, -3, -8; /M: SY='D'; M= -9, 20,-26, 24, 13,-25, -6, -2,-28, 0,-24,-20, 13,-11, 0, -6, 2, -6,-23,-31,-16, 6; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='N'; M= -2, 2,-20, 1, -1,-17, 0, -6,-18, -3,-17,-12, 6, -7, -4, -3, 3, -2,-15,-23,-13, -3; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='N'; M= -5, 4,-15, 2, 0,-11, -6, 0,-12, -1,-13, -8, 7, -9, -2, -1, 3, 1,-11,-18, -5, -2; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='S'; M= 7, -1,-13, -3, -2,-15, -2, -8,-13, -5,-12, -9, -1, -8, -1, -7, 8, 6, -8,-20,-12, -2; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='I'; M= -4,-13,-18,-13, -9, -7,-16,-13, 3,-12, -2, -1,-12, -4,-10,-13, -5, -1, 3,-14, -5,-11; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='V'; M= -2, -9,-15, -9, -8,-10,-16, -9, -2, -2, -6, -2, -9,-15, -7, -4, -4, -2, 6,-17, -6, -8; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='T'; M= -7, -7,-20, -9, -3, -8,-20, -4, -7, -3, -5, -4, -5,-14, -2, 0, -3, 3, -6,-19, -1, -3; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='N'; M= -5, -2,-21, -6, -6,-14,-12, -1, -8, -6,-11, -5, 4,-17, -1, -4, -1, -3, -8,-23, -8, -5; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='N'; M= -8, 3,-22, 1, -1,-15,-12, -7,-12, -5,-12, -8, 6,-17, -4, -3, 0, 1,-11,-24,-12, -3; /M: SY='F'; M=-13,-26,-21,-32,-23, 36,-29,-20, 10,-26, 22, 7,-22,-27,-27,-18,-20, -8, 6, -7, 12,-23; /M: SY='D'; M= -7, 8,-25, 10, 6,-18,-14, -2,-21, 1,-19,-14, 5, -8, -2, -3, -1, -5,-17,-27,-12, 1; /M: SY='P'; M= -6,-10,-24,-11, -4, -7,-19,-11,-10, -9,-11, -8, -7, 7, -8, -9, -3, -1,-10,-24,-11, -7; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='P'; M= -6,-15,-31, -9, -1,-23,-16,-16,-15, -9,-21,-14,-14, 56, -8,-16, -6, -6,-21,-26,-22, -8; D=-13; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='I'; M= -6,-23,-20,-28,-21, -4,-28,-23, 21,-18, 9, 8,-18,-21,-16,-15,-12, -2, 19,-23, -5,-21; /M: SY='E'; M= -7, 0,-24, -2, 3,-20,-16, -8,-10, 0,-14, -8, 2,-12, 1, -1, -1, -2, -9,-28,-13, 1; /M: SY='A'; M= 35,-11,-11,-19,-12,-17, 0,-20, -9,-12, -9, -9, -9,-13,-12,-19, 8, 3, 0,-21,-17,-12; /M: SY='R'; M=-14, -4,-28, -5, 4,-23,-17, -1,-27, 23,-22,-10, 3,-16, 13, 46, -4, -6,-20,-23,-12, 5; /M: SY='Y'; M=-16,-17,-27,-18,-15, 22,-24, 13, -6,-11, -4, -2,-14,-26,-10, -9,-14, -9,-10, 10, 45,-15; /M: SY='V'; M= -5,-29,-18,-32,-28, 1,-33,-28, 33,-24, 17, 13,-26,-25,-25,-23,-15, -4, 36,-25, -6,-28; /M: SY='R'; M=-15, -9,-29,-10, 0,-20,-20, -3,-26, 28,-18, -9, -2,-18, 8, 55, -9, -9,-17,-20,-10, 0; /M: SY='I'; M= -9,-29,-22,-34,-26, 12,-33,-24, 30,-27, 26, 17,-25,-26,-23,-23,-21, -8, 23,-18, 3,-26; /M: SY='H'; M= -9, -5,-22, -5, -6,-12,-18, 1, -7, -7, -9, -4, -4,-19, -5, -5, -3, -2, -3,-22, -1, -7; /M: SY='P'; M= 3,-17,-22,-18,-11,-14,-15,-20, -5,-15,-11, -8,-14, 19,-14,-20, -6, -5, -6,-25,-18,-14; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='T'; M= -3, -7,-14,-10, -6, -6,-12,-11, 0, -8, 0, 0, -5,-10, -6, -7, -2, 4, 1,-17, -6, -7; D=-11; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='S'; M= 2, -6,-20,-10, -5,-17, -6, -9,-13, -8,-13, -8, -3,-14, -1, -8, 5, 5, -9,-23,-12, -3; /M: SY='S'; M= -2, 3,-22, 0, 0,-18, -4, -8,-21, -4,-21,-15, 5,-10, -3, -7, 7, 6,-17,-20,-13, -2; /M: SY='W'; M= -7,-15,-30,-17,-13, -4,-13,-12,-17,-11,-16,-13,-14,-18, -9,-12,-13,-12,-19, 36, 9,-10; /M: SY='H'; M= -8, -2,-25, -3, -1,-14,-15, 10,-16, -3,-16, -8, 1,-13, 0, -4, -3, -5,-15,-17, 0, -2; /M: SY='G'; M= 2, -1,-23, -4, -4,-18, 4, -7,-20, -7,-18,-11, 3,-12, -4, -8, 2, -6,-17,-23,-13, -5; /M: SY='A'; M= 3, -7,-20,-12,-10,-11,-11, -7, -7, -7, -9, -5, -3,-18, -8, -7, -1, -2, -4,-22, -6,-11; /M: SY='I'; M= -2,-11,-22,-15,-10,-13,-16,-16, 2,-12, -7, -3, -5,-11, -7,-12, -1, -4, -1,-23,-11,-10; /M: SY='A'; M= 4,-12, -8,-17,-11,-10,-14,-18, -4,-15, -3, -5, -9,-18,-12,-15, -2, -3, -1,-25,-12,-12; /M: SY='L'; M= 1,-16,-19,-19,-14, -1,-20,-12, 5,-15, 11, 9,-16,-21,-12,-14,-11, -5, 4,-15, 1,-13; /M: SY='R'; M= -9, 0,-28, 2, 20,-24,-16, -3,-27, 18,-20,-14, 1,-11, 10, 26, -4, -9,-21,-25,-15, 13; /M: SY='L'; M= -6,-25,-21,-29,-22, 10,-27,-20, 18,-23, 19, 14,-23,-25,-20,-20,-18, -7, 15,-12, 2,-21; /M: SY='E'; M= -9, 7,-28, 12, 38,-25,-18, -1,-25, 6,-18,-15, 1, -4, 16, 0, -1, -8,-25,-27,-15, 27; /M: SY='L'; M= -5,-24,-19,-24,-17, -1,-25,-21, 15,-20, 18, 8,-22,-19,-18,-18,-16, -6, 15,-24, -6,-18; /M: SY='Y'; M=-11,-21,-24,-24,-18, 15,-25, -4, 6,-17, 12, 7,-19,-26,-14,-14,-18, -8, 0, 1, 25,-18; /M: SY='G'; M= 5, -6,-24, -8,-13,-24, 37,-17,-27,-16,-22,-16, 0,-18,-15,-18, 3,-11,-19,-24,-24,-14; /M: SY='C'; M= -3, -7, 24,-11, -8,-18,-17,-15,-19,-11,-16,-13, -6,-21,-11,-13, 0, -2, -9,-34,-18,-10; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 126 in 94 different sequences |
| Number of true positive hits | 124 in 92 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 2 in 2 different sequences |
| Number of false negative sequences | 2 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 98.41 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 98.41 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 2 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | P_Bucher, N_Hulo |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | F5/8 type C |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
92 sequences
ADAC_FLAPL (P0DTR4), AEBP1_HUMAN (Q8IUX7), AEBP1_MOUSE (Q640N1), AEBP1_RAT (A2RUV9), AFTD_MYCTU (P96419), CADN_ACRMI (B3EWZ3), CNT3B_HUMAN (Q96NU0), CNTP1_HUMAN (P78357), CNTP1_MOUSE (O54991), CNTP1_RAT (P97846), CNTP2_HUMAN (Q9UHC6), CNTP2_MOUSE (Q9CPW0), CNTP2_PONAB (Q5RD64), CNTP3_HUMAN (Q9BZ76), CNTP4_HUMAN (Q9C0A0), CNTP4_MOUSE (Q99P47), CNTP5_CANLF (Q0V8T0), CNTP5_CHICK (Q0V8S9), CNTP5_HUMAN (Q8WYK1), CPXM1_HUMAN (Q96SM3), CPXM1_MOUSE (Q9Z100), CPXM2_HUMAN (Q8N436), CPXM2_MOUSE (Q9D2L5), CTP5A_MOUSE (Q0V8T9), CTP5A_RAT (Q0V8T6), CTP5B_MOUSE (Q0V8T8), CTP5B_RAT (Q0V8T5), CTP5C_MOUSE (Q0V8T7), CTP5C_RAT (Q0V8T4), CTP5D_RAT (Q0V8T3), DCBD1_HUMAN (Q8N8Z6), DCBD2_HUMAN (Q96PD2), DCBD2_MOUSE (Q91ZV3), DCBD2_RAT (Q91ZV2), DDR1_HUMAN (Q08345), DDR1_MOUSE (Q03146), DDR1_PANTR (Q7YR43), DDR1_RAT(Q63474), DDR2_HUMAN (Q16832), DDR2_MOUSE (Q62371), DDRA_CAEEL (Q18163), DDRB_CAEEL (Q95ZV7), DIS1A_DICDI (P02886), DIS1B_DICDI (P02887), DIS1D_DICDI (P02888), DIS2_DICDI (P42530), EDIL3_HUMAN (O43854), EDIL3_MOUSE (O35474), EDIL3_PONAB (Q5R7K9), EXGAL_BIFL2 (A0A401ETL2), FA5V_OXYMI (Q58L90), FA5V_OXYSU (Q58L91), FA5V_PSETE (Q7SZN0), FA5_BOVIN (Q28107), FA5_HUMAN (P12259), FA5_MOUSE (O88783), FA5_PIG (Q9GLP1), FA5_PSETE (Q593B6), FA8_CANLF (O18806), FA8_HUMAN (P00451), FA8_MOUSE (Q06194), FA8_PIG (P12263), GAOA_GIBZA (P0CS93), GAOA_GIBZE (I1S2N3), HMCT_BOMMO (P98092), HYLA_ENTFA (Q82ZM8), MFGM_BOVIN (Q95114), MFGM_HUMAN (Q08431), MFGM_MOUSE (P21956), MFGM_PIG(P79385), MFGM_RAT(P70490), NAGH_CLOPE (P26831), NANH_CLOSE (P29767), NANH_MICVI (Q02834), NRP1A_DANRE (Q8QFX6), NRP1_CHICK (P79795), NRP1_HUMAN (O14786), NRP1_MOUSE (P97333), NRP1_RAT(Q9QWJ9), NRP1_XENLA (P28824), NRP2_HUMAN (O60462), NRP2_MOUSE (O35375), NRP2_RAT(O35276), NRX4_DROME (Q94887), SSPO_BOVIN (P98167), SSPO_CHICK (Q2PC93), SSPO_HUMAN (A2VEC9), SSPO_MOUSE (Q8CG65), SSPO_RAT(Q700K0), XLRS1_HUMAN (O15537), XLRS1_MOUSE (Q9Z1L4), XLRS1_TAKRU (Q9W6R5)» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
2 sequences
AFTD_MYCS2 (A0QPD4), HYBA2_BIFL2 (E8MGH9) |
| UniProtKB/Swiss-Prot False positive sequences |
2 sequences
OGA_CLOP1 (Q0TR53), OGA_CLOPE (Q8XL08) |
| PDB [Detailed view] |
129 PDB
1CFG; 1CZS; 1CZT; 1CZV; 1D7P; 1EUT; 1EUU; 1FAC; 1GOF; 1GOG; 1GOH; 1IQD; 1K3I; 1KEX; 1SDD; 1T2X; 1W8N; 1W8O; 1WCQ; 2BER; 2BZD; 2EIB; 2EIC; 2EID; 2EIE; 2JKX; 2L9L; 2ORX; 2ORZ; 2PQS; 2QQI; 2QQJ; 2QQK; 2QQL; 2QQM; 2QQN; 2QQO; 2R7E; 2VM9; 2VMC; 2VMD; 2VME; 2VZ1; 2VZ3; 2W1Q; 2W1S; 2W1U; 2W94; 2W95; 2WDB; 2WN2; 2WN3; 2WQ8; 2WUH; 2Z4F; 3BN6; 3CDZ; 3HNB; 3HNY; 3HOB; 3I97; 3J2Q; 3J2S; 3JD6; 4AG4; 4BDV; 4BXS; 4DEQ; 4GZ9; 4GZA; 4KI5; 4MO3; 4PT6; 4QDQ; 4QDR; 4QDS; 4RN5; 4XZU; 5C7G; 5DN2; 5DQ0; 5IJR; 5IYY; 5J1X; 5JGI; 5JGQ; 5JHK; 5K8D; 5N6W; 5Y4M; 6FMC; 6FMF; 6MF0; 6MF2; 6TDB; 6TJT; 6TKK; 6XLR; 6XLS; 6XLT; 7AZB; 7JJC; 7K66; 7KBT; 7KVE; 7KVF; 7KWO; 7KXY; 7M0R; 7M22; 7O1N; 7P5U; 7RGA; 7S0P; 7T4S; 7TPP; 8C5G; 8FDG; 8G6I; 8IVW; 8IVX; 8PFE; 8TN9; 8TX5; 8TX6; 8TY1; 9CTH; 9D5D; 9EOU » more |